Las tasas que hay que pagar al presentar una solicitud internacional de patente en el marco del Sistema del PCT varían en función de la Oficina receptora, la autoridad encargada del examen preliminar internacional y la autoridad encargada de la búsqueda internacional que se escojan al presentar la solicitud.
En la página web dedicada al PCT figura más información sobre los tipos de tasas y su importe.
Hay cuatro métodos para abonar las tasas pagaderas a la OMPI. No se aceptan cheques. La OMPI devolverá al remitente el cheque recibido.
Para facturar los pagos en la cuenta corriente en la OMPI debe utilizarse el sistema seguro de pago electrónico por Internet o la función de pago en línea del sistema ePCT. (Nota: se requiere inicio de sesión con autenticación fuerte).
Si se presenta una solicitud ante la Oficina Internacional (RO/IB) en papel, hay que seleccionar "Authorization to charge Current account" (autorización para facturar en la cuenta corriente) e indicar el número de cuenta corriente en la hoja de cálculo de tasas del PCT del formulario de petitorio. 
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En lo que respecta a las tasas especiales y tasas suplementarias, hay que indicar el número de cuenta corriente en la OMPI y el número de solicitud PCT en su operación o correspondencia de ePCT. Debe incluirse el nombre del titular o solicitante, la referencia del expediente o el número de la solicitud internacional PCT (si procede).
La tarjeta de crédito se puede utilizar exclusivamente para abonar:
Puede utilizarse PayPal para el pago de:
| Método de transferencia | Divisa | |
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| Tasas a la RO/IB | Tasas especiales / Tasas de búsqueda suplementaria a la Oficina Internacional | |
| Transferencia bancaria | Francos suizos, dólares EE.UU. o euros | Francos suizos |
| Transferencia postal | Francos suizos | Francos suizos |
Cuando efectúe el pago, debe indicar los datos siguientes (a falta de ello se retrasará el trámite de su solicitud y/o se incurrirá en tasas adicionales):
Las comisiones que cobre el banco del cliente, o un banco intermediario, correrán a cargo del cliente.
Se acusa recibo de todos los pagos y se incluyen los datos de contacto del funcionario autorizado encargado de la tramitación. En caso de no recibirse acuse de recibo en un plazo de diez días debe contactarse con el funcionario autorizado.
Toda petición de reembolso debe remitirse al funcionario autorizado que se haya encargado de tramitar la solicitud. Para más información sobre los casos en los que se puede solicitar un reembolso de tasas, remítase a la Guía del solicitante del PCT.