                         SEQUENCE LISTING

<110>  CONSORCIO CENTRO DE INVESTIGACIN BIOMDICA EN RED
       FUNDACI INSTITUT MAR DINVESTIGACIONS MDIQUES (IMIM)
 
<120>  Genomic predictor of outcome in cancer

<130>  P5635PC00

<150>  EP21382269.5
<151>  2021-03-31

<160>  71    

<170>  PatentIn version 3.5

<210>  1
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  TP53 primer

<400>  1
ctttgaggtg cgtgtttgtg                                                   20


<210>  2
<211>  18
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  TP53 primer

<400>  2
gggcagtgct cgcttagt                                                     18


<210>  3
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  CDKN1A primer

<400>  3
ccgaagtcag ttccttgtgg a                                                 21


<210>  4
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  CDKN1A primer

<400>  4
tggtgtctcg gtgacaaagt                                                   20


<210>  5
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  MDM2 primer

<400>  5
gccattgaac cttgtgtgat t                                                 21


<210>  6
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  MDM2 primer

<400>  6
ggcagggctt attccttttc                                                   20


<210>  7
<211>  18
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  PHLDA3 primer

<400>  7
cagctgtgga agcggaag                                                     18


<210>  8
<211>  18
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  PHLDA3 primer

<400>  8
gcgaagctga gctccttg                                                     18


<210>  9
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  PLK2 primer

<400>  9
aataacaaag tctacgccgc a                                                 21


<210>  10
<211>  23
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  PLK2 primer

<400>  10
tctttgtcaa tcttttccct ttg                                               23


<210>  11
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  ZMAT3 primer

<400>  11
ctagggcaaa gcgcaaatag                                                   20


<210>  12
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  ZMAT3 primer

<400>  12
gaccagccac tccaaaagag                                                   20


<210>  13
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  SESN1 primer

<400>  13
tgacctgatg cctttccttc                                                   20


<210>  14
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  SESN1 primer

<400>  14
cctggggctt agtaccttcc                                                   20


<210>  15
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  LAPTM5 primer

<400>  15
tcttttccat cgccttcatc                                                   20


<210>  16
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  LAPTM5 primer

<400>  16
ccttctggag catcttggag                                                   20


<210>  17
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  TIMP2 primer

<400>  17
ttccctccct caaagactga                                                   20


<210>  18
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  TIMP2 primer

<400>  18
caaagccacc tacctccaaa                                                   20


<210>  19
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  CRIP2 primer

<400>  19
cggtgggcag ctacatctat                                                   20


<210>  20
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  CRIP2 primer

<400>  20
ctgagcactc tcccagcaga                                                   20


<210>  21
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  KIFC3 primer

<400>  21
tgccatgtac gagtcagagc                                                   20


<210>  22
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  KIFC3 primer

<400>  22
cggttcttgt cctcttccag                                                   20


<210>  23
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  MRAS primer

<400>  23
accgagtttt cccatcagtg                                                   20


<210>  24
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  MRAS primer

<400>  24
tctctttccc tcccaggttt                                                   20


<210>  25
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  SERPINH1 primer

<400>  25
cttcatggtg actcggtcct                                                   20


<210>  26
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  SERPINH1 primer

<400>  26
cgatttgcag cttttccttc                                                   20


<210>  27
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  CD99L2 primer

<400>  27
cgggttgaca tgagaaaggt                                                   20


<210>  28
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  CD99L2 R

<400>  28
attctggctt tgatgctcgt                                                   20


<210>  29
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  TUBB6 primer

<400>  29
tgaggggcca caaaataaac                                                   20


<210>  30
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  TUBB6 primer

<400>  30
tataaggcaa cacggcacaa                                                   20


<210>  31
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  TPM2 primer

<400>  31
ggacagagga tgaggtggaa                                                   20


<210>  32
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  TPM2 primer

<400>  32
gcatcagtgg ccttcttctc                                                   20


<210>  33
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  GLIPR1 primer

<400>  33
cgccatcaca aactggtatg                                                   20


<210>  34
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  GLIPR1 primer

<400>  34
atctgcccaa acaacctgag                                                   20


<210>  35
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  TSPAN4 primer

<400>  35
tgcctcctgc tcactttctt                                                   20


<210>  36
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  TSPAN4 primer

<400>  36
gtcttgctgg gcatacctgt                                                   20


<210>  37
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  ICAM1 primer

<400>  37
gaagtggccc tccatagaca                                                   20


<210>  38
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  ICAM1 primer

<400>  38
tcaagggttg gggtcagtag                                                   20


<210>  39
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  ARL4C primer

<400>  39
tgagtccctg cctattgtcc                                                   20


<210>  40
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  ARL4C primer

<400>  40
cagatgggct gctaggtttc                                                   20


<210>  41
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  VAMP5 primer

<400>  41
cctgaaggag aagccaaatg                                                   20


<210>  42
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  VAMP5 primer

<400>  42
gtcaagggag agcaaacacc                                                   20


<210>  43
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  GPC1 primer

<400>  43
ccctacgctc atctctggaa                                                   20


<210>  44
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  GPC1 primer

<400>  44
gaccttgtgg aggaaggaca                                                   20


<210>  45
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  COL18A1 F

<400>  45
gagggacaag tggactcagg                                                   20


<210>  46
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  COL18A1 primer

<400>  46
ttggcttcac atcacacaca                                                   20


<210>  47
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  AGMAT F

<400>  47
tctttctggg aacacagccc                                                   20


<210>  48
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  AGMAT R

<400>  48
cggttgtcac tttggggaga                                                   20


<210>  49
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  KCNK5 primer

<400>  49
gaggtgtgag tctgcggaag                                                   20


<210>  50
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  KCNK5 primer

<400>  50
gccctcgatg tagttccacc                                                   20


<210>  51
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  CDX1 primer

<400>  51
acctcctctc caatgcctgt                                                   20


<210>  52
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  CDX1 primer

<400>  52
agactcggac cagacctcct                                                   20


<210>  53
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  MYB primer

<400>  53
gctactgcct ggacgaactg                                                   20


<210>  54
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  MYB primer

<400>  54
gctggctggc ttttgaagac t                                                 21


<210>  55
<211>  19
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  HPRT1 primer

<400>  55
ataagccaga ctttgttgg                                                    19


<210>  56
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  HPRT1 primer

<400>  56
ataggactcc agatgtttcc                                                   20


<210>  57
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  TBP primer

<400>  57
ggaagtgaca ttatcaacgc                                                   20


<210>  58
<211>  19
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  TBP primer

<400>  58
ccaagaaaca gtgatgctg                                                    19


<210>  59
<211>  23
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  ACTB primer

<400>  59
gcaccacacc ttctacaatg agc                                               23


<210>  60
<211>  22
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  ACTB primer

<400>  60
tagcacagcc tggatagcaa cg                                                22


<210>  61
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  MDM2 primer ChIP-qPCR

<400>  61
gggcaggttg actcagcttt t                                                 21


<210>  62
<211>  22
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  MDM2 primer ChIP-qPCR

<400>  62
agctgggaaa atgcatggtt ta                                                22


<210>  63
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  BAX primer ChIP-qPCR

<400>  63
ggttcctggc tctctgatcc                                                   20


<210>  64
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  BAX primer ChIP-qPCR

<400>  64
aggctgggcc tgtatcctac                                                   20


<210>  65
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  CDKN1A primer ChIP-qPCR

<400>  65
agcaggctgt ggctctgatt                                                   20


<210>  66
<211>  23
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  CDKN1A primer ChIP-qPCR

<400>  66
caaaatagcc accagcctct tct                                               23


<210>  67
<211>  22
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  ZMAT3 primer ChIP-qPCR

<400>  67
caaattgcca caaacattct gc                                                22


<210>  68
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  ZMAT3 primer ChIP-qPCR

<400>  68
ctgggggaga cacatgctag a                                                 21


<210>  69
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  TP53 Guide 1

<400>  69
tcgacgctag gatctgactg                                                   20


<210>  70
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  TP53 Guide 2

<400>  70
accagcagct cctacaccgg                                                   20


<210>  71
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  TP53 Guide 3

<400>  71
ccattgttca atatcgtccg                                                   20


