                         SEQUENCE LISTING

<110>  California Institute of Technology
 
<120>  MEMBRANE-BASED, IN-GEL LOOP-MEDIATED ISOTHERMAL AMPLIFICATION 
       (LAMP) SYSTEM AND METHOD FOR DETECTING MICROBES

<130>  00016-147WO1

<140>  Not yet assigned
<141>  2021-10-22

<150>  US 63/117,932
<151>  2020-11-24

<160>  86    

<170>  PatentIn version 3.5

<210>  1
<211>  23
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  F3 Primer N gene

<400>  1
gtcattttgc tgaataagca tat                                               23


<210>  2
<211>  18
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  B3 Primer N gene

<400>  2
gagtcagcac tgctcatg                                                     18


<210>  3
<211>  44
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  FIP Primer N gene

<400>  3
taaggcttga gtttcatcag ccttacgcat acaaaacatt ccca                        44


<210>  4
<211>  45
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  BIP Primer N gene

<400>  4
cagagacaga agaaacagca aactgattgt tgcaattgtt tggag                       45


<210>  5
<211>  25
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  LB Primer N gene

<400>  5
gtgactcttc ttcctgctgc agatt                                             25


<210>  6
<211>  15
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  FAM-BIP

<400>  6
tttcttctgt ctctg                                                        15


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<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  F3 Primer N gene

<400>  7
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<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  B3 Primer N gene

<400>  8
gccttgtcct cgagggaat                                                    19


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<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  FIP Primer N gene

<400>  9
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<210>  10
<211>  41
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  BIP Primer N gene

<400>  10
cgcgatcaaa acaacgtcgg cccttgccat gttgagtgag a                           41


<210>  11
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  LF Primer N gene

<400>  11
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<210>  12
<211>  25
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  LB Primer N gene

<400>  12
ttacccaata atactgcgtc ttggt                                             25


<210>  13
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  F3 Primer N gene

<400>  13
ccagaatgga gaacgcagtg                                                   20


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<211>  18
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  B3 Primer N gene

<400>  14
ccgtcaccac cacgaatt                                                     18


<210>  15
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<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  FIP Primer N gene

<400>  15
agcggtgaac caagacgcag ggcgcgatca aaacaacg                               38


<210>  16
<211>  41
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  BIP Primer N gene

<400>  16
aattccctcg aggacaaggc gagctcttcg gtagtagcca a                           41


<210>  17
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  LF Primer N gene

<400>  17
ttattgggta aaccttgggg c                                                 21


<210>  18
<211>  24
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  LB Primer N gene

<400>  18
taacaccaat agcagtccag atga                                              24


<210>  19
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  F3 Primer ORF1ab

<400>  19
tccagatgag gatgaagaag a                                                 21


<210>  20
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  B3 Primer ORF1ab

<400>  20
agtctgaaca actggtgtaa g                                                 21


<210>  21
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<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  FIP Primer ORF1ab

<400>  21
agagcagcag aagtggcaca ggtgattgtg aagaagaaga g                           41


<210>  22
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<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  BIP Primer ORF1ab

<400>  22
tcaacctgaa gaagagcaag aactgattgt cctcactgcc                             40


<210>  23
<211>  22
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  LF Primer ORF1ab

<400>  23
ctcatattga gttgatggct ca                                                22


<210>  24
<211>  22
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  LB Primer ORF1ab

<400>  24
acaaactgtt ggtcaacaag ac                                                22


<210>  25
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  F3 Primer ORF1a

<400>  25
ctgcacctca tggtcatgtt                                                   20


<210>  26
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<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  B3 Primer ORF1a

<400>  26
agctcgtcgc ctaagtcaa                                                    19


<210>  27
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<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  FIP Primer ORF1a

<400>  27
gagggacaag gacaccaagt gtatggttga gctggtagca ga                          42


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<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  BIP Primer ORF1a

<400>  28
ccagtggctt accgcaaggt tttagatcgg cgccgtaac                              39


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<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  LF Primer ORF1a

<400>  29
ccgtactgaa tgccttcgag t                                                 21


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<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
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<400>  30
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<210>  31
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<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  F3 Primer ORF1a

<400>  31
tcatcaaacg ttcggatgct                                                   20


<210>  32
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<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  B3 Primer ORF1a

<400>  32
tatggccacc agctcctt                                                     18


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<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
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cgaccgtact gaatgccttc gagaactgca cctcatggtc at                          42


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<212>  DNA
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<220>
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agacacttgg tgtccttgtc ccagaagaac cttgcggtaa gc                          42


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<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
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ctgctaccag ctcaaccata ac                                                22


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<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  LB Primer ORF1a

<400>  36
tcatgtgggc gaaataccag t                                                 21


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<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  F3 Primer ORF1a

<400>  37
ctgcacctca tggtcatgtt                                                   20


<210>  38
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<213>  Artificial Sequence

<220>
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gagggacaag gacaccaagt gtggtagcag aactcgaagg c                           41


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<211>  39
<212>  DNA
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<400>  40
ccagtggctt accgcaaggt tttagatcgg cgccgtaac                              39


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<211>  21
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  LF Primer ORF1a

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accactacga ccgtactgaa t                                                 21


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<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  LB Primer ORF1a

<400>  42
ttcgtaagaa cggtaataaa ggagc                                             25


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<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  F3 Primer N gene

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tggctactac cgaagagct                                                    19


<210>  44
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<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  B3 Primer N gene

<400>  44
tgcagcattg ttagcaggat                                                   20


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<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  FIP Primer N gene

<400>  45
tctggcccag ttcctaggta gtccagacga attcgtggtg g                           41


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<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  LF Primer N gene

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<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  LB Primer N gene

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<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  F3 Primer N gene

<400>  49
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<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  B3 Primer N gene

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<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  FIP Primer N gene

<400>  51
tctggcccag ttcctaggta gttcgtggtg gtgacggtaa                             40


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<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  BIP Primer N gene

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agacggcatc atatgggttg cacgggtgcc aatgtgatct                             40


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<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  LF Primer N gene

<400>  53
ccatcttgga ctgagatctt tcatt                                             25


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<211>  21
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  LB Primer N gene

<400>  54
actgagggag ccttgaatac a                                                 21


<210>  55
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<213>  Artificial Sequence

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<223>  F3 Primer ORF1ab

<400>  55
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<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  B3 Primer ORF1ab

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<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  FIP Primer ORF1ab

<400>  57
tcagtactag tgcctgtgcc cacaatcgtt tttaaacggg t                           41


<210>  58
<211>  43
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  BIP Primer ORF1ab

<400>  58
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<210>  59
<211>  17
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  LF Primer ORF1ab

<400>  59
ctgcacttac accgcaa                                                      17


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<220>
<223>  LB Primer ORF1ab

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gtagctggtt ttgctaaatt cc                                                22


<210>  61
<211>  19
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  F3 Primer N gene

<400>  61
gttcctcatc acgtagtcg                                                    19


<210>  62
<211>  19
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  B3 Primer N gene

<400>  62
gtttggcctt gttgttgtt                                                    19


<210>  63
<211>  43
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  FIP Primer N gene

<400>  63
gccagccatt ctagcaggag caacagttaa gaaattcaac tcc                         43


<210>  64
<211>  40
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  BIP Primer N gene

<400>  64
gatgctgctc ttgctttgct accagacatt ttgctctcaa                             40


<210>  65
<211>  22
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  LB Primer N gene

<400>  65
gctgcttgac agattgaacc ag                                                22


<210>  66
<211>  23
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  F3 Primer N gene

<400>  66
gtcattttgc tgaataagca tat                                               23


<210>  67
<211>  18
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  B3 Primer N gene

<400>  67
gagtcagcac tgctcatg                                                     18


<210>  68
<211>  44
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  FIP Primer N gene

<400>  68
taaggcttga gtttcatcag ccttacgcat acaaaacatt ccca                        44


<210>  69
<211>  45
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  BIP Primer N gene

<400>  69
cagagacaga agaaacagca aactgattgt tgcaattgtt tggag                       45


<210>  70
<211>  25
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  LB Primer N gene

<400>  70
gtgactcttc ttcctgctgc agatt                                             25


<210>  71
<211>  15
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  QFIP 12nt probe

<400>  71
tttcttctgt ctctg                                                        15


<210>  72
<211>  17
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  qFIP17nt probe

<400>  72
atgaaactca agcctta                                                      17


<210>  73
<211>  10
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  qBIP10nt probe

<400>  73
tctgtctctg                                                              10


<210>  74
<211>  15
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  qBIP15nt probe

<400>  74
tttcttctgt ctctg                                                        15


<210>  75
<211>  18
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  F3 Primer E.coli

<400>  75
gccatctcct gatgacgc                                                     18


<210>  76
<211>  18
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  B3 Primer E.coli

<400>  76
atttaccgca gccagacg                                                     18


<210>  77
<211>  42
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  FIP Primer E.coli

<400>  77
cattttgcag ctgtacgctc gcagcccatc atgaatgttg ct                          42


<210>  78
<211>  40
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  BIP Primer E.coli

<400>  78
ctggggcgag gtcgtggtat tccgacaaac accacgaatt                             40


<210>  79
<211>  24
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  LF Primer E.coli

<400>  79
ctttgtaaca acctgtcatc gaca                                              24


<210>  80
<211>  25
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  LB Primer E.coli

<400>  80
atcaatctcg atatccatga aggtg                                             25


<210>  81
<211>  22
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  F3 Primer S.typhi

<400>  81
gacttgcctt taaaagatac ca                                                22


<210>  82
<211>  19
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  B3 Primer S.typhi

<400>  82
agagtgcgtt tgaacactt                                                    19


<210>  83
<211>  40
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  FIP Primer S.typhi

<400>  83
aacttgctgc tgaagagttg gaccgaatga ctcgaccatc                             40


<210>  84
<211>  38
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  BIP Primer S.typhi

<400>  84
cctggggcca aatggcatta tgcactaagt aaggctgg                               38


<210>  85
<211>  18
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  LF Primer S.typhi

<400>  85
tcggatggct tcgttcct                                                     18


<210>  86
<211>  25
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  LB Primer S.typhi

<400>  86
caagggtttc aagactaagt ggttc                                             25


