                         SEQUENCE LISTING

<110>  NUCLEIN, LLC
 
<120>  APPARATUS AND METHODS FOR MOLECULAR DIAGNOSTICS

<130>  NCNL.P0007WO

<140>  Filed Concurrently Herewith
<141>  2021-11-16

<150>  63/114,987
<151>  2020-11-17

<150>  63/117,317
<151>  2020-11-23

<160>  78    

<170>  PatentIn version 3.5

<210>  1
<211>  243
<212>  DNA
<213>  Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2

<400>  1
tggaagaaac taagttcctc acagaaaact tgttacttta tattgacatt aatggcaatc       60

ttcatccaga ttctgccact cttgttagtg acattgacat cactttctta aagaaagatg      120

ctccatatat agtgggtgat gttgttcaag agggtgtttt aactgctgtg gttataccta      180

ctaaaaaggc tggtggcact actgaaatgc tagcgaaagc tttgagaaaa gtgccaacag      240

aca                                                                    243


<210>  2
<211>  157
<212>  DNA
<213>  Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2

<400>  2
ttggtggtgc atcgtgttgt ctgtactgcc gttgccacat agatcatcca aatcctaaag       60

gattttgtga cttaaaaggt aagtatgtac aaatacctac aacttgtgct aatgaccctg      120

tgggttttac acttaaaaac acagtctgta ccgtctg                               157


<210>  3
<211>  290
<212>  DNA
<213>  Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2

<400>  3
aaagtgacac ttgcagatgc tggcttcatc aaacaatatg gtgattgcct tggtgatatt       60

gctgctagag acctcatttg tgcacaaaag tttaacggcc ttactgtttt gccacctttg      120

ctcacagatg aaatgattgc tcaatacact tctgcactgt tagcgggtac aatcacttct      180

ggttggacct ttggtgcagg tgctgcatta caaataccat ttgctatgca aatggcttat      240

aggtttaatg gtattggagt tacacagaat gttctctatg agaaccaaaa                 290


<210>  4
<211>  249
<212>  DNA
<213>  Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2

<400>  4
aaagtgacac ttgcagatgc tggcttcatc aaacaatatg gtgattgcct tggtgatatt       60

gctgctagag acctcatttg tgcacaaaag tttaacggcc ttactgtttt gccacctttg      120

ctcacagatg aaatgattgc tcaatacact tctgcactgt tagcgggtac aatcacttct      180

ggttggacct ttggtgcagg tgctgcatta caaataccat ttgctatgca aatggcttat      240

aggtttaat                                                              249


<210>  5
<211>  153
<212>  DNA
<213>  Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2

<400>  5
gctttcttat tacaaattgg gagcttcgca gcgtgtagca ggtgactcag gttttgctgc       60

atacagtcgc tacaggattg gcaactataa attaaacaca gaccattcca gtagcagtga      120

caatattgct ttgcttgtac agtaagtgac aac                                   153


<210>  6
<211>  132
<212>  DNA
<213>  Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2

<400>  6
attggctact accgaagagc taccagacga attcgtggtg gtgacggtaa aatgaaagat       60

ctcagtccaa gatggtattt ctactaccta ggaactgggc cagaagctgg acttccctat      120

ggtgctaaca aa                                                          132


<210>  7
<211>  104
<212>  DNA
<213>  Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2

<400>  7
caagccttac cgcagagaca gaagaaacag caaactgtga ctcttcttcc tgctgcagat       60

ttggatgatt tctccaaaca attgcaacaa tccatgagca gtgc                       104


<210>  8
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  S1 forward primer

<400>  8
ttgccacctt tgctcacaga                                                   20


<210>  9
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  S1 reverse primer

<400>  9
caccaaaggt ccaaccagaa                                                   20


<210>  10
<211>  26
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  S1 probe

<400>  10
acacttctgc actgttagcg ggtaca                                            26


<210>  11
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  N2 forward primer

<400>  11
ccgcagagac agaagaaaca g                                                 21


<210>  12
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  N2 reverse primer

<400>  12
gcactgctca tggattgttg                                                   20


<210>  13
<211>  27
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  N2 probe

<400>  13
aactgtgact cttcttcctg ctgcaga                                           27


<210>  14
<211>  23
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  S2 forward primer

<400>  14
gcacaaaagt ttaacggcct tac                                               23


<210>  15
<211>  25
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  S2 reverse primer

<400>  15
cgctaacagt gcagaagtgt attga                                             25


<210>  16
<211>  27
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  S2 probe

<400>  16
tgccaccttt gctcacagat gaaatga                                           27


<210>  17
<211>  23
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  S-M30 forward primer

<400>  17
tgtcatgatg gaaaagcaca ctt                                               23


<210>  18
<211>  22
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  S-M30 reverse primer

<400>  18
accagtgtgt gccatttgaa ac                                                22


<210>  19
<211>  17
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  S-M30 probe

<400>  19
cctcgtgaag gtgtctt                                                      17


<210>  20
<211>  25
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  OR1ab-1 forward primer

<400>  20
ttgctgcagt cataacaaga gaagt                                             25


<210>  21
<211>  25
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  ORF1ab-1 reverse primer

<400>  21
ttgctgcagt cataacaaga gaagt                                             25


<210>  22
<211>  26
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  ORF1ab-1 probe

<400>  22
tttgcctggc acgatattac gcacaa                                            26


<210>  23
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  ORF1ab-2 forward primer

<400>  23
gtggtgcatc gtgttgtctg t                                                 21


<210>  24
<211>  25
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  ORF1ab-2 reverse primer

<400>  24
agggtcatta gcacaagttg taggt                                             25


<210>  25
<211>  26
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  ORF1ab-2 probe

<400>  25
ctgccgttgc cacatagatc atccaa                                            26


<210>  26
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  ORF1ab-M9 forward primer

<400>  26
tgacaaagct tgcccattga                                                   20


<210>  27
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  ORF1ab-M9 reverse primer

<400>  27
gcacgacaaa acccacttct c                                                 21


<210>  28
<211>  16
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  ORF1ab-M9 probe

<400>  28
tgctgcagtc ataaca                                                       16


<210>  29
<211>  22
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  ORF1ab-M16 forward primer

<400>  29
gggatcagac ataccaccca aa                                                22


<210>  30
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  ORF1ab-M16 reverse primer

<400>  30
tttgcacaat gcagaatgca                                                   20


<210>  31
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  ORF1ab-M16 probe

<400>  31
tgtgttaact gtttggatga c                                                 21


<210>  32
<211>  23
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  ORF1ab-M22 forward primer

<400>  32
ccgcgaagaa gctataagac atg                                               23


<210>  33
<211>  19
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  ORF1ab-M22 reverse primer

<400>  33
gacacccctc gacatcgaa                                                    19


<210>  34
<211>  15
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  ORF1ab-M22 probe

<400>  34
acgtgcatgg attgg                                                        15


<210>  35
<211>  24
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  M-1 forward primer

<400>  35
cattgcttct ttcagactgt ttgc                                              24


<210>  36
<211>  26
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  M-1 reverse primer

<400>  36
gcacgttgag aagaatgtta gtttct                                            26


<210>  37
<211>  25
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  M-1 probe

<400>  37
cgtacgcgtt ccatgtggtc attca                                             25


<210>  38
<211>  18
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  M-M35 forward primer

<400>  38
gcttcgcagc gtgtagca                                                     18


<210>  39
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  M-M35 reverse primer

<400>  39
tgccaatcct gtagcgactg t                                                 21


<210>  40
<211>  17
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  M-M35 probe

<400>  40
tgactcaggt tttgctg                                                      17


<210>  41
<211>  22
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  N-M36 forward primer

<400>  41
accgaagagc taccagacga at                                                22


<210>  42
<211>  25
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  N-M36 reverse primer

<400>  42
ccatcttgga ctgagatctt tcatt                                             25


<210>  43
<211>  16
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  N-M36 probe

<400>  43
cgtggtggtg acggta                                                       16


<210>  44
<211>  63
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  IPC1 template

<400>  44
cgctaacggg cgattctata agaatgcaca ttgcgtcgat tcataagatg tctcgaccgc       60

atg                                                                     63


<210>  45
<211>  19
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  IPC1 forward primer

<400>  45
cgctaacggg cgattctat                                                    19


<210>  46
<211>  24
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  IPC1 probe

<400>  46
aagaatgcac attgcgtcga ttca                                              24


<210>  47
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  IPC1 Reverse primer

<400>  47
catgcggtcg agacatctta                                                   20


<210>  48
<211>  64
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  IPC2 template

<400>  48
atcaaggaaa tgtttcatga ccaagcgaaa ggccgctcta cggaatggat ttacgttact       60

gcct                                                                    64


<210>  49
<211>  22
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  IPC2 forward primer

<400>  49
atcaaggaaa tgtttcatga cc                                                22


<210>  50
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  IPC2 probe

<400>  50
aagcgaaagg ccgctctacg                                                   20


<210>  51
<211>  22
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  IPC2 reverse primer

<400>  51
aggcagtaac gtaaatccat tc                                                22


<210>  52
<211>  66
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  IPC3 template

<400>  52
ctgctttgat caacctccaa tacctcgtat cattgtgcac ctgccggtga ccactcaacg       60

atgtgg                                                                  66


<210>  53
<211>  23
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  IPC3 forward primer

<400>  53
ctgctttgat caacctccaa tac                                               23


<210>  54
<211>  24
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  IPC3 probe

<400>  54
ctcgtatcat tgtgcacctg ccgg                                              24


<210>  55
<211>  19
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  IPC3 reverse primer

<400>  55
ccacatcgtt gagtggtca                                                    19


<210>  56
<211>  71
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  IPC4 template

<400>  56
cgcatgcgca gggtatattt ggacagtatc gaatggactc tgatgaacct ttacaccgat       60

ctagaaacgg g                                                            71


<210>  57
<211>  19
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  IPC4 forward primer

<400>  57
cgcatgcgca gggtatatt                                                    19


<210>  58
<211>  29
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  IPC4 probe

<400>  58
tggacagtat cgaatggact ctgatgaac                                         29


<210>  59
<211>  23
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  IPC4 reverse primer

<400>  59
cccgtttcta gatcggtgta aag                                               23


<210>  60
<211>  72
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  IPC5 template

<400>  60
gaggcgaaga ttatcgtgtg tgccccgtta tggtcgagtt cggtcagagc gtcattgcga       60

gtagtcgttt gc                                                           72


<210>  61
<211>  22
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  IPC5 forward primer

<400>  61
gaggcgaaga ttatcgtgtg tg                                                22


<210>  62
<211>  24
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  IPC5 probe

<400>  62
cccgttatgg tcgagttcgg tcag                                              24


<210>  63
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  IPC5 reverse primer

<400>  63
gcaaacgact actcgcaatg a                                                 21


<210>  64
<211>  23
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Assay 1 forward primer

<400>  64
gatgcaaatc tgcaaaggaa aga                                               23


<210>  65
<211>  24
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Assay 1 probe

<400>  65
taagagggcc atatgacgtg gcaa                                              24


<210>  66
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Assay 1 reverse primer

<400>  66
cccaaacagc aagcctagat                                                   20


<210>  67
<211>  18
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Assay 2 forward primer

<400>  67
tggcggtgtt tgcagatt                                                     18


<210>  68
<211>  22
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Assay 2 probe

<400>  68
ttctgacctg aaggctctgc gc                                                22


<210>  69
<211>  22
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Assay 2 reverse primer

<400>  69
acaactgaat agccaaggtg ag                                                22


<210>  70
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Assay 3 forward primer

<400>  70
tgtctcggat ccatctcact                                                   20


<210>  71
<211>  24
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Assay 3 probe

<400>  71
tgagagcaac ttcttcaagg gccc                                              24


<210>  72
<211>  23
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Assay 3 reverse primer

<400>  72
aaactgcaac aacatcatag agc                                               23


<210>  73
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Assay 4 forward primer

<400>  73
actttgccaa ttgtacaggg a                                                 21


<210>  74
<211>  24
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Assay 4 probe

<400>  74
tgtctcggat ccatctcact gcaa                                              24


<210>  75
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Assay 4 reverse primer

<400>  75
gcccttgaag aagttgctct                                                   20


<210>  76
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Assay 5 forward primer

<400>  76
tatctagtgc tgcagaaagg c                                                 21


<210>  77
<211>  24
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Assay 5 probe

<400>  77
agggccatat gacgtggcaa atct                                              24


<210>  78
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Assay 5 reverse primer

<400>  78
cttggcgtca ctttcagaga                                                   20


