                         SEQUENCE LISTING

<110>  The Translational Genomics Research Institute
 
<120>  Methods and Kits for the Detection of SARS-COV-2

<130>  91482.247PCT

<150>  62/989,556
<151>  2020-03-13

<160>  59    

<170>  PatentIn version 3.5

<210>  1
<211>  19
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  1
ctcgaggmca rggcgttcc                                                    19


<210>  2
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  2
cgtckggtag ctcttcggta g                                                 21


<210>  3
<211>  22
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Probe

<400>  3
accaatagca gtccagatga cc                                                22


<210>  4
<211>  25
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Probe

<400>  4
aattaacacc aatagcagtc cagat                                             25


<210>  5
<211>  26
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  5
gcttctggcc cagttcctag gtagta                                            26


<210>  6
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  6
cccgcattac gtttggtgga c                                                 21


<210>  7
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Probe

<400>  7
cctcagattc aactggcagt a                                                 21


<210>  8
<211>  25
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  8
cgtggtggtg acggtaaaat gaaag                                             25


<210>  9
<211>  22
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  9
cccctactgc tgcctggagt tg                                                22


<210>  10
<211>  23
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Probe

<400>  10
tcagtccaag atggtatttc tac                                               23


<210>  11
<211>  18
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  11
cggcagtcaa gcctcttc                                                     18


<210>  12
<211>  23
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  12
tgctgcctgg agttgaattt ctt                                               23


<210>  13
<211>  23
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Probe

<400>  13
tcgttcctca tcacgtagtc gca                                               23


<210>  14
<211>  24
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  14
gggctgaaca tgtcaacaac tcat                                              24


<210>  15
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  15
cgccgaggag aattagtctg a                                                 21


<210>  16
<211>  25
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Probe

<400>  16
tgagtgtgac atacccattg gtgca                                             25


<210>  17
<211>  94
<212>  DNA
<213>  Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2

<400>  17
gggctgaaca tgtcaacaac tcatatgagt gtgacatacc cattggtgca ggtatatgcg       60

ctagttatca gactcagact aattctcctc ggcg                                   94


<210>  18
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  18
ttcagcgttc ttcggaatgt c                                                 21


<210>  19
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  19
tggcacctgt gtaggtcaac                                                   20


<210>  20
<211>  23
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Probe

<400>  20
cgcattggca tggaagtcac acc                                               23


<210>  21
<211>  77
<212>  DNA
<213>  Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2

<400>  21
ttcagcgttc ttcggaatgt cgcgcattgg catggaagtc acaccttcgg gaacgtggtt       60

gacctacaca ggtgcca                                                      77


<210>  22
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  22
ggtttycgcc tggtacgatt                                                   20


<210>  23
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  23
gggtccacgt gattgagaac                                                   20


<210>  24
<211>  22
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Probe

<400>  24
tgcctcaagg ctattatgtt ga                                                22


<210>  25
<211>  104
<212>  DNA
<213>  Human Coronavirus HKU1

<400>  25
ggtttccgcc tggtacgatt ttgcctcaag gctattatgt tgaaggctca ggaaggtctg       60

cttctaatag tcgaccaggt tcacgttctc aatcacgtgg accc                       104


<210>  26
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  26
aggacaaggt gtgcctattg c                                                 21


<210>  27
<211>  19
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  27
gttgacgctg gttgccatc                                                    19


<210>  28
<211>  18
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Probe

<400>  28
ccaggagtcc cagctact                                                     18


<210>  29
<211>  101
<212>  DNA
<213>  Human Coronavirus OC43

<400>  29
aggacaaggt gtgcctattg caccaggagt cccagctact gaagctaagg ggtactggta       60

cagacacaac agacgttctt ttaaaacagc cgatggcaac c                          101


<210>  30
<211>  24
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  30
ccacacttgg gtaagtttct tgag                                              24


<210>  31
<211>  24
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  31
cagttgcagg tgaagtttgw gatg                                              24


<210>  32
<211>  25
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Probe

<400>  32
cattcactag agaaatgcaa caaca                                             25


<210>  33
<211>  118
<212>  DNA
<213>  Human Coronavirus 229E

<400>  33
ccacacttgg gtaagtttct tgaggagtta aatgcattca ctagagaaat gcaacaacat       60

cctcttctta accctagtgc actagaattc aacccatctc aaacttcacc tgcaactg        118


<210>  34
<211>  23
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  34
aagccttctc agttgaagaa acc                                               23


<210>  35
<211>  22
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  35
cacgaggacc aaagcactga at                                                22


<210>  36
<211>  19
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Probe

<400>  36
tcgttggaag cgtgttcct                                                    19


<210>  37
<211>  82
<212>  DNA
<213>  Human Coronavirus NL63


<220>
<221>  misc_feature
<222>  (46)..(51)
<223>  n is a, c, g, or t

<400>  37
aagccttctc agttgaagaa acctcgttgg aagcgtgttc ctaccnnnnn ngaaaatgtt       60

attcagtgct ttggtcctcg tg                                                82


<210>  38
<211>  36
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  38
acccaactga atggagcctc gaggmcargg cgttcc                                 36


<210>  39
<211>  40
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  39
acgcacttga cttgtcttcc gtckggtagc tcttcggtag                             40


<210>  40
<211>  45
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  40
acgcacttga cttgtcttcg cttctggccc agttcctagg tagta                       45


<210>  41
<211>  38
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  41
acccaactga atggagcccc gcattacgtt tggtggac                               38


<210>  42
<211>  38
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  42
acgcacttga cttgtcttct ggcaggagca gttgtgaa                               38


<210>  43
<211>  39
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  43
acccaactga atggagctgg caaccctgtg tacttcctt                              39


<210>  44
<211>  37
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  44
acgcacttga cttgtcttcc ggcagtcaag cctcttc                                37


<210>  45
<211>  40
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  45
acccaactga atggagctgc tgcctggagt tgaatttctt                             40


<210>  46
<211>  43
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  46
acgcacttga cttgtcttcg ggctgaacat gtcaacaact cat                         43


<210>  47
<211>  38
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  47
acccaactga atggagccgc cgaggagaat tagtctga                               38


<210>  48
<211>  40
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  48
acgcacttga cttgtcttct tcagcgttct tcggaatgtc                             40


<210>  49
<211>  37
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  49
acccaactga atggagctgg cacctgtgta ggtcaac                                37


<210>  50
<211>  39
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  50
acgcacttga cttgtcttcg gtttycgcct ggtacgatt                              39


<210>  51
<211>  37
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  51
acccaactga atggagcggg tccacgtgat tgagaac                                37


<210>  52
<211>  40
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  52
acgcacttga cttgtcttca ggacaaggtg tgcctattgc                             40


<210>  53
<211>  36
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  53
acccaactga atggagcgtt gacgctggtt gccatc                                 36


<210>  54
<211>  43
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  54
acgcacttga cttgtcttcc cacacttggg taagtttctt gag                         43


<210>  55
<211>  41
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  55
acccaactga atggagccag ttgcaggtga agtttgwgat g                           41


<210>  56
<211>  42
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  56
acgcacttga cttgtcttca agccttctca gttgaagaaa cc                          42


<210>  57
<211>  39
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  57
acccaactga atggagccac gaggaccaaa gcactgaat                              39


<210>  58
<211>  17
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Universal Tail

<400>  58
acccaactga atggagc                                                      17


<210>  59
<211>  19
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Universal Tail

<400>  59
acgcacttga cttgtcttc                                                    19



