                         SEQUENCE LISTING

<110>  F. Hoffmann-La Roche AG
       Roche Diagnostics GmbH
       Roche Molecular Systems, Inc.
 
<120>  COMPOSITIONS AND METHODS FOR DETECTING SEVERE ACUTE RESPIRATORY 
       SYNDROME CORONAVIRUS 2 (SARS-COV-2), INFLUENZA A AND INFLUENZA B

<130>  P35962-WO-HS

<160>  45    

<170>  PatentIn version 3.5

<210>  1
<211>  23
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Forward primer NCOV-1F.A


<220>
<221>  modified_base
<222>  (23)..(23)
<223>  t-butylbenzyl dA

<400>  1
tgattgttac gatggtggct gta                                               23


<210>  2
<211>  25
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Forward primer NCOV-2F


<220>
<221>  modified_base
<222>  (25)..(25)
<223>  t-butylbenzyl dA

<400>  2
ttcatccgga gttgttaatc cagta                                             25


<210>  3
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Forward primer NCOV-3F.A


<220>
<221>  modified_base
<222>  (20)..(20)
<223>  t-butylbenzyl dA

<400>  3
cccatgcttc agtcagctga                                                   20


<210>  4
<211>  25
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Forward primer SARBV-1F.A


<220>
<221>  modified_base
<222>  (25)..(25)
<223>  t-butylbenzyl dA

<400>  4
tcttgctttc gtggtattct tgcta                                             25


<210>  5
<211>  27
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Forward primer SARBV-1F2.A


<220>
<221>  modified_base
<222>  (27)..(27)
<223>  t-butylbenzyl dA

<400>  5
gaacttatgt actcattcgt ttcggaa                                           27


<210>  6
<211>  19
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Forward primer SARBV-2F.A


<220>
<221>  modified_base
<222>  (19)..(19)
<223>  t-butylbenzyl dA

<400>  6
ccgtctgcgg aatgtggaa                                                    19


<210>  7
<211>  25
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Reverse primer NCOV-1R.A


<220>
<221>  modified_base
<222>  (25)..(25)
<223>  t-butylbenzyl dA

<400>  7
agtgcatctt gatcctcata actca                                             25


<210>  8
<211>  30
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Reverse primer NCOV-1R1.A


<220>
<221>  modified_base
<222>  (30)..(30)
<223>  t-butylbenzyl dA

<400>  8
gcatcttgat cctcataact cattgaatca                                        30


<210>  9
<211>  31
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Reverse primer NCOV-1R2.A


<220>
<221>  modified_base
<222>  (31)..(31)
<223>  t-butylbenzyl dA

<400>  9
actcattgaa tcataataaa gtctagcctt a                                      31


<210>  10
<211>  27
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Reverse primer NCOV-2R


<220>
<221>  modified_base
<222>  (27)..(27)
<223>  t-butylbenzyl dA

<400>  10
acgaatgagt acataagttc gtactca                                           27


<210>  11
<211>  24
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Reverse primer NCOV-2R1.A


<220>
<221>  modified_base
<222>  (24)..(24)
<223>  t-butylbenzyl dA

<400>  11
tctcttccga aacgaatgag taca                                              24


<210>  12
<211>  23
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Reverse primer NCOV-2R2.A


<220>
<221>  modified_base
<222>  (23)..(23)
<223>  t-butylbenzyl dA

<400>  12
cctgtctctt ccgaaacgaa tga                                               23


<210>  13
<211>  28
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Reverse primer NCOV-3R1.A


<220>
<221>  modified_base
<222>  (28)..(28)
<223>  t-butylbenzyl dA

<400>  13
gcaaaaccag ctactttatc attgtaga                                          28


<210>  14
<211>  28
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Reverse primer NCOV-3R2.A


<220>
<221>  modified_base
<222>  (28)..(28)
<223>  t-butylbenzyl dA

<400>  14
tcattgtaga tgtcaaaagc cctgtata                                          28


<210>  15
<211>  26
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Reverse primer SARBV-1R.A


<220>
<221>  modified_base
<222>  (26)..(26)
<223>  t-butylbenzyl dA

<400>  15
ctcacgttaa caatattgca gcagta                                            26


<210>  16
<211>  25
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Reverse primer SARBV-1R1.A


<220>
<221>  modified_base
<222>  (25)..(25)
<223>  t-butylbenzyl dA

<400>  16
aactcacgtt aacaatattg cagca                                             25


<210>  17
<211>  30
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Reverse primer SARBV-1R2.A


<220>
<221>  modified_base
<222>  (30)..(30)
<223>  t-butylbenzyl dA

<400>  17
ttttactaga ctcacgttaa caatattgca                                        30


<210>  18
<211>  22
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Reverse primer SARBV-2R.A


<220>
<221>  modified_base
<222>  (22)..(22)
<223>  t-butylbenzyl dA

<400>  18
acttacaccg caaacccgtt ta                                                22


<210>  19
<211>  18
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Reverse primer SARBV-2R1.A


<220>
<221>  modified_base
<222>  (18)..(18)
<223>  t-butylbenzyl dA

<400>  19
gtgccgcacg gtgtaaga                                                     18


<210>  20
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Reverse primer SARBV-2R2.A


<220>
<221>  modified_base
<222>  (21)..(21)
<223>  t-butylbenzyl dA

<400>  20
gtgtaagacg ggctgcactt a                                                 21


<210>  21
<211>  36
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Probe WUHAN-4P


<220>
<221>  misc_feature
<223>  5` FAM

<220>
<221>  misc_feature
<223>  3` Spacer-C3 Blocker

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (6)..(7)
<223>  BHQ-2 Quencher

<400>  21
tcatcgtcaa caacctagac aaatcagctg gttttc                                 36


<210>  22
<211>  31
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Probe NCOV-2P


<220>
<221>  misc_feature
<223>  5` FAM

<220>
<221>  misc_feature
<223>  3` Spacer-C3 Blocker

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (8)..(9)
<223>  BHQ-2 Quencher

<400>  22
cgacgacgac tactagcgtg cctttgtaag c                                      31


<210>  23
<211>  30
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Probe NCOV-3P8Q


<220>
<221>  misc_feature
<223>  5` FAM

<220>
<221>  misc_feature
<223>  3` Spacer-C3 Blocker

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (8)..(9)
<223>  BHQ-2 Quencher

<400>  23
cgtgcggcac aggcactagt actgatgtcg                                        30


<210>  24
<211>  30
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Probe SARBV-P1


<220>
<221>  misc_feature
<223>  5` HEX

<220>
<221>  misc_feature
<223>  3` Spacer-C3 Blocker

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (8)..(9)
<223>  BHQ-2 Quencher

<400>  24
agccatcctt actgcgcttc gattgtgtgc                                        30


<210>  25
<211>  30
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Probe SARBV-P1_6Q.P


<220>
<221>  misc_feature
<223>  5` HEX-Thr

<220>
<221>  misc_feature
<223>  3` Phosphate

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (6)..(7)
<223>  BHQ-2 Quencher

<400>  25
agccatcctt actgcgcttc gattgtgtgc                                        30


<210>  26
<211>  30
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Probe SARBV-P2


<220>
<221>  misc_feature
<223>  5` HEX-Thr

<220>
<221>  misc_feature
<223>  3` Spacer-C3 Blocker

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (7)..(8)
<223>  BHQ-2 Quencher

<400>  26
atggctgtag ttgtgaccaa ctccgcgaac                                        30


<210>  27
<211>  30
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Forward primer NCOV-1-FN1.A


<220>
<221>  modified_base
<222>  (30)..(30)
<223>  t-butylbenzyl dA

<400>  27
ctttgattgt tacgatggtg gctgtattaa                                        30


<210>  28
<211>  28
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Forward primer NCOV-1-FN3.A


<220>
<221>  modified_base
<222>  (28)..(28)
<223>  t-butylbenzyl dA

<400>  28
tactttgatt gttacgatgg tggctgta                                          28


<210>  29
<211>  31
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Forward primer NCOV-2-FN2.A


<220>
<221>  modified_base
<222>  (31)..(31)
<223>  t-butylbenzyl dA

<400>  29
tactttgatt gttacgatgg tggctgtatt a                                      31


<210>  30
<211>  29
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Forward primer NCOV-4-FN4.A


<220>
<221>  modified_base
<222>  (29)..(29)
<223>  t-butylbenzyl dA

<400>  30
ttgttacgat ggtggctgta ttaatgcta                                         29


<210>  31
<211>  27
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Forward primer NCOV-4-FN5.A


<220>
<221>  modified_base
<222>  (27)..(27)
<223>  t-butylbenzyl dA

<400>  31
gatggtggct gtattaatgc taaccaa                                           27


<210>  32
<211>  29
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Probe SARBV-P1-N2_6Q.C3


<220>
<221>  misc_feature
<223>  5` HEX-Thr

<220>
<221>  misc_feature
<223>  3` Spacer-C3 Blocker

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (7)..(8)
<223>  BHQ-2 Quencher

<400>  32
atccttactg cgcttcgatt gtgtgcgta                                         29


<210>  33
<211>  25
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Forward primer FLUAF M1 121 146


<220>
<221>  modified_base
<222>  (25)..(25)
<223>  t-butylbenzyl dA

<400>  33
gctctcatgg aatggctaaa gacaa                                             25


<210>  34
<211>  18
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Reverse primer FLUA_RP4_A


<220>
<221>  modified_base
<222>  (18)..(18)
<223>  t-butylbenzyl dC

<400>  34
tggacaaagc gtctacgc                                                     18


<210>  35
<211>  31
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Probe FLUAP.H.C3_M1_212_181.6COU1.C


<220>
<221>  misc_feature
<223>  5` Coumarin

<220>
<221>  misc_feature
<223>  3` Spacer-C3 Blocker

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (6)..(7)
<223>  BHQ-2 Quencher

<400>  35
cactgggcac ggtgagcgtg aacacaaatc c                                      31


<210>  36
<211>  22
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Forward primer FLUBF NS1.749 770


<220>
<221>  modified_base
<222>  (22)..(22)
<223>  t-butylbenzyl dA

<400>  36
aagatggcca tcggatcctc aa                                                22


<210>  37
<211>  24
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Reverse primer FLUBR_NS1.865_842


<220>
<221>  modified_base
<222>  (24)..(24)
<223>  t-butylbenzyl dA

<400>  37
ggtgctcttg accaaattgg gata                                              24


<210>  38
<211>  32
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Probe FLUB_PRB2_11Q_JA270.C3


<220>
<221>  misc_feature
<223>  5` JA270-Thr

<220>
<221>  misc_feature
<223>  3` Spacer-C3 Blocker

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (11)..(12)
<223>  BHQ-2 Quencher

<400>  38
cattcaaagc caattcgagc agctgaaact gc                                     32


<210>  39
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Forward primer NCOV-F.core

<400>  39
ttgttacgat ggtggctgta                                                   20


<210>  40
<211>  31
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Forward primer NCOV-N3-F3.A


<220>
<221>  modified_base
<222>  (31)..(31)
<223>  t-butylbenzyl dC

<400>  40
ttttacactt aaaaacacag tctgtaccgt c                                      31


<210>  41
<211>  27
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Reverse primer NCOV-N3-R1.A


<220>
<221>  modified_base
<222>  (27)..(27)
<223>  t-butylbenzyl dA

<400>  41
aacccgttta aaaacgattg tgcatca                                           27


<210>  42
<211>  36
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Probe NCOV-4P-JA270-Q10.P


<220>
<221>  misc_feature
<223>  5` JA270-Thr

<220>
<221>  misc_feature
<223>  3` Spacer-C3 Blocker

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (10)..(11)
<223>  BHQ-2 Quencher

<400>  42
tcatcgtcaa caacctagac aaatcagctg gttttc                                 36


<210>  43
<211>  29
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Probe NCOV-N3-JA


<220>
<221>  misc_feature
<223>  5` JA270-Thr

<220>
<221>  misc_feature
<223>  3` Spacer-C3 Blocker

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (12)..(13)
<223>  BHQ-2 Quencher

<400>  43
tccgcgaacc catgcttcag tcagctgat                                         29


<210>  44
<211>  31
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Probe FLUAP.H.C3_M1_212_181.6


<220>
<221>  misc_feature
<223>  5` HEX-Thr

<220>
<221>  misc_feature
<223>  3` Spacer-C3 Blocker

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (6)..(7)
<223>  BHQ-2 Quencher

<400>  44
cactgggcac ggtgagcgtg aacacaaatc c                                      31


<210>  45
<211>  32
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Probe FLUB_THRBP2_K77


<220>
<221>  misc_feature
<223>  5` BHQ-2 Quencher

<220>
<221>  misc_feature
<223>  3` Spacer-C3 Blocker

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (2)..(2)
<223>  D-Locked Nucleic Acid

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (9)..(10)
<223>  DBCO-Thr

<400>  45
cattcaaagc caattcgagc agctgaaact gc                                     32


