                         SEQUENCE LISTING

<110>  F. Hoffmann-La Roche AG
       Roche Diagnostics GmbH
       Roche Molecular Systems, Inc.
 
<120>  COMPOSITIONS AND METHODS FOR RAPID IDENTIFICATION AND PHENOTYPIC 
       ANTIMICROBIAL SUSCEPTIBILITY TESTING OF BACTERIA AND FUNGI

<130>  P35710-WO-HS

<150>  US 62/938,144
<151>  2019-11-20

<160>  134   

<170>  PatentIn version 3.5

<210>  1
<211>  19
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Enterobacteriales rplP Forward Primer RM_ENTF


<220>
<221>  modified_base
<222>  (19)..(19)
<223>  t-butylbenzyl-dC

<400>  1
taatcggcag tttcgctgc                                                    19


<210>  2
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Enterobacteriales rplP Reverse Primer RM_ENTRP


<220>
<221>  modified_base
<222>  (20)..(20)
<223>  t-butylbenzyl-dA

<400>  2
gttcccggac aaaccgatca                                                   20


<210>  3
<211>  33
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Enterobacteriales rplP Probe 1 RM_ETP02


<220>
<221>  misc_feature
<223>  5`-Cy5.5

<220>
<221>  misc_feature
<223>  3`-Phosphate

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (11)..(12)
<223>  BHQ-2 Quencher

<400>  3
ttcacgggcc agctcttccg gaacaccgtc cat                                    33


<210>  4
<211>  33
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Enterobacteriales rplP Probe 2 RM_ETP02B


<220>
<221>  misc_feature
<223>  5`-Cy5.5

<220>
<221>  misc_feature
<223>  3`-Phosphate

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (11)..(12)
<223>  BHQ-2 Quencher

<400>  4
ctggatcagg gcaacccaat actccacgtt acc                                    33


<210>  5
<211>  24
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Enterobacteriales rplP Forward Primer SEGP2891

<400>  5
aattccgtaa aatgcacaaa ggcc                                              24


<210>  6
<211>  23
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Enterobacteriales rplP Reverse Primer SEGP2892

<400>  6
gcttaactgc acgggtcata gca                                               23


<210>  7
<211>  30
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Enterobacteriales rplP Probe SEGP2893


<220>
<221>  misc_feature
<223>  5`-FAM

<220>
<221>  misc_feature
<223>  3`-Blocker

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (9)..(10)
<223>  ZEN Quencher

<400>  7
tggtcgtctg actgcacgtc agatcgaagc                                        30


<210>  8
<211>  27
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Enterobacteriales gyrB Forward Primer SEGP1899

<400>  8
tgtcgaattc ttatgactcc tccagta                                           27


<210>  9
<211>  17
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Enterobacteriales gyrB Reverse Primer SEGP1901

<400>  9
cgcgagcgct tcgtcga                                                      17


<210>  10
<211>  30
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Enterobacteriales gyrB Probe SEGP2016


<220>
<221>  misc_feature
<223>  5`-HEX

<220>
<221>  misc_feature
<223>  3`-Blocker

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (9)..(10)
<223>  ZEN Quencher

<400>  10
ccggtctgca ccacatggta ttcgaggtgg                                        30


<210>  11
<211>  24
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Enterobacteriales rpoB Forward Primer SEGP2799

<400>  11
tggtaaacgt ccacaagttc tgga                                              24


<210>  12
<211>  23
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Enterobacteriales rpoB Reverse Primer 1 SEGP2800

<400>  12
catactgccc ttcaggatct tgc                                               23


<210>  13
<211>  25
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Enterobacteriales rpoB Reverse Primer 2 SEGP2802

<400>  13
gtagctgaca tattgcagtt cagca                                             25


<210>  14
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Enterobacteriales rpoB Reverse Primer 3 SEGP2821

<400>  14
ccgttctgac cgtccggatc                                                   20


<210>  15
<211>  44
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Enterobacteriales rpoB Probe 1 SEGP2804


<220>
<221>  misc_feature
<223>  5`-FAM

<220>
<221>  misc_feature
<223>  3`-Blocker

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (9)..(10)
<223>  ZEN Quencher

<400>  15
tatctccttt ctatccagct tgactcgttt cagaagttta tcga                        44


<210>  16
<211>  44
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Enterobacteriales rpoB Probe 2 SEGP2822


<220>
<221>  misc_feature
<223>  5`-FAM

<220>
<221>  misc_feature
<223>  3`-Blocker

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (9)..(10)
<223>  ZEN Quencher

<400>  16
tctcctttct atccagctgg attcattcca gaaattcatt gaac                        44


<210>  17
<211>  18
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  A. Baumannii ompA Forward Primer RM_AFP01

<400>  17
ttggtggtca cttgaagc                                                     18


<210>  18
<211>  19
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  A. Baumannii ompA Reverse Primer RM_ARP02

<400>  18
tttctggctt gtattggtc                                                    19


<210>  19
<211>  27
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  A. Baumannii ompA Probe RM_P02


<220>
<221>  misc_feature
<223>  5`-HEX

<220>
<221>  misc_feature
<223>  3`-Phosphate

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (7)..(8)
<223>  BHQ-2 Quencher

<400>  19
actccagttg ctccacaacc acaagag                                           27


<210>  20
<211>  30
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  A. Baumannii ompA Forward Primer SEGP2603

<400>  20
ttatctttag ctcgtgctaa ctctgttaaa                                        30


<210>  21
<211>  27
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  A. Baumannii ompA Reverse Primer SEGP2606

<400>  21
gcacgacctt ctttagtttt gttgtca                                           27


<210>  22
<211>  36
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  A. Baumannii ompA Probe SEGP2769


<220>
<221>  misc_feature
<223>  5`-ATTO

<220>
<221>  misc_feature
<223>  3`-Phosphate

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (8)..(9)
<223>  BHQ-2 Quencher

<400>  22
tctactcaag gtttcgcttg ggatcaaccg attgct                                 36


<210>  23
<211>  26
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  A. Baumannii rpoB Forward Primer SEGP2590

<400>  23
catactcata taccgaaaag aaacgg                                            26


<210>  24
<211>  26
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  A. Baumannii rpoB Reverse Primer SEGP2593

<400>  24
ctatactcaa caaattctaa agcagc                                            26


<210>  25
<211>  19
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  A. Baumannii rpoB Probe SEGP2594


<220>
<221>  misc_feature
<223>  5`-FAM

<220>
<221>  misc_feature
<223>  3`-Blocker

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (9)..(10)
<223>  ZEN Quencher

<400>  25
cgcgaagata tcggtctcc                                                    19


<210>  26
<211>  32
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  A. Baumannii gyrB Forward Primer SEGP2626

<400>  26
acagaacaaa ccaatgaaaa ggcttatgat tc                                     32


<210>  27
<211>  23
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  A. Baumannii gyrB Reverse Primer SEGP2628

<400>  27
accatatggt gtaaaccggt acc                                               23


<210>  28
<211>  42
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  A. Baumannii gyrB Probe SEGP2629


<220>
<221>  misc_feature
<223>  5`-FAM

<220>
<221>  misc_feature
<223>  3`-Blocker

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (9)..(10)
<223>  ZEN Quencher

<400>  28
aaagtattac gtggattaga tgcagttcgt aaacgtccgg gt                          42


<210>  29
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  A Baumannii Gene X Forward Primer SEGP1813

<400>  29
accctaacgc tactgcacgt                                                   20


<210>  30
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  A. Baumannii Gene X Reverse Primer SEGP1815

<400>  30
ggttgatccc aagcgaaacc t                                                 21


<210>  31
<211>  23
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  A. Baumannii Gene X Probe SEGP1951


<220>
<221>  misc_feature
<223>  5`-ATTO

<220>
<221>  misc_feature
<223>  3`-Phosphate

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (8)..(9)
<223>  BHQ-2 Quencher

<400>  31
tcgaaggtca cacagataac act                                               23


<210>  32
<211>  18
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  P. Aeruginosa tuf Forward Primer SEGP2341

<400>  32
ccgtgcagaa gctggtag                                                     18


<210>  33
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  P. Aeruginosa tuf Reverse Primer SEGP2342

<400>  33
gagatcgaga acacgtcttc g                                                 21


<210>  34
<211>  24
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  P. Aeruginosa tuf Probe SEGP2343


<220>
<221>  misc_feature
<223>  5`-FAM

<220>
<221>  misc_feature
<223>  3`-Blocker

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (9)..(10)
<223>  ZEN Quencher

<400>  34
ttccggagcc ggttcgtgcc atcg                                              24


<210>  35
<211>  23
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  P. Aeruginosa gyrB Forward Primer SEGP2630

<400>  35
ggagtacaac atcgacaagc tgc                                               23


<210>  36
<211>  18
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  P. Aeruginosa gyrB Reverse Primer SEGP2631

<400>  36
cgctcgatca gctcgggc                                                     18


<210>  37
<211>  36
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  P. Aeruginosa gyrB Probe SEGP2632


<220>
<221>  misc_feature
<223>  5`-FAM

<220>
<221>  misc_feature
<223>  3`-Blocker

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (9)..(10)
<223>  ZEN Quencher

<400>  37
cacaacatca tcatcatgac cgatgctgac gtcgac                                 36


<210>  38
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  P. Aeruginosa rpoB Forward Primer SEGP2634

<400>  38
ggcgtgctga agatcgtcaa                                                   20


<210>  39
<211>  19
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  P. Aeruginosa rpoB Reverse Primer SEGP2637

<400>  39
accggcatga tcaccgaga                                                    19


<210>  40
<211>  25
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  P. Aeruginosa rpoB Probe SEGP2640


<220>
<221>  misc_feature
<223>  5`-FAM

<220>
<221>  misc_feature
<223>  3`-Blocker

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (9)..(10)
<223>  ZEN Quencher

<400>  40
cgcatccagc cgggcgacaa gatgg                                             25


<210>  41
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  S. Maltophilia fdnG Forward Primer SEGP2532

<400>  41
ccaagctcga caagccgtac                                                   20


<210>  42
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  S. Maltophilia fdnG Reverse Primer SEGP2538

<400>  42
gcttggagaa cgcgctgatc                                                   20


<210>  43
<211>  29
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  S. Maltophilia fdnG Probe SEGP2544


<220>
<221>  misc_feature
<223>  5`-FAM

<220>
<221>  misc_feature
<223>  3`-Blocker

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (9)..(10)
<223>  ZEN Quencher

<400>  43
tgcaggcgta cgagctgatg aacgaaggc                                         29


<210>  44
<211>  19
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  S. Maltophilia gyrB Forward Primer SEGP2578

<400>  44
tgcagtggac cgactccta                                                    19


<210>  45
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  S. Maltophilia gyrB Reverse Primer SEGP2579

<400>  45
ctgcttggcg atgccgttct                                                   20


<210>  46
<211>  22
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  S. Maltophilia gyrB Probe SEGP2580


<220>
<221>  misc_feature
<223>  5`-FAM

<220>
<221>  misc_feature
<223>  3`-Blocker

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (9)..(10)
<223>  ZEN Quencher

<400>  46
gacgatgtac tgcttcacca ac                                                22


<210>  47
<211>  18
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  S. Maltophilia tuf Forward Primer SEGP2572

<400>  47
gcaccaagcc gcacgtca                                                     18


<210>  48
<211>  18
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  S. Maltophilia tuf Reverse Primer SEGP2573

<400>  48
gtgcgcggtc gagatcgt                                                     18


<210>  49
<211>  18
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  S. Maltophilia tuf Probe SEGP2574


<220>
<221>  misc_feature
<223>  5`-FAM

<220>
<221>  misc_feature
<223>  3`-Blocker

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (9)..(10)
<223>  ZEN Quencher

<400>  49
caagaccacg ctgaccgc                                                     18


<210>  50
<211>  22
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Enterococcus tuf Forward Primer SEGP1632

<400>  50
gacaaaccat tcatgatgcc ag                                                22


<210>  51
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Enterococcus tuf Reverse Primer SEGP1631

<400>  51
aacttcgtca ccaacgcgaa c                                                 21


<210>  52
<211>  22
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Enterococcus tuf Probe SEGP1633


<220>
<221>  misc_feature
<223>  5`-HEX

<220>
<221>  misc_feature
<223>  3`-Blocker

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (9)..(10)
<223>  ZEN Quencher

<400>  52
ctggacgtgg tactgttgct ac                                                22


<210>  53
<211>  23
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Enterococcus rpoB Forward Primer SEGP2522

<400>  53
ccgtccagtg gtagcaagta tca                                               23


<210>  54
<211>  25
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Enterococcus rpoB Reverse Primer SEGP2525

<400>  54
accatagtga gagtagtgaa cgtca                                             25


<210>  55
<211>  32
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Enterococcus rpoB Probe SEGP2770


<220>
<221>  misc_feature
<223>  5`-HEX

<220>
<221>  misc_feature
<223>  3`-Blocker

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (9)..(10)
<223>  ZEN Quencher

<400>  55
ttgactcgtg accgtgccgg ttatgaagtt cg                                     32


<210>  56
<211>  25
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Enterococcus ddl Forward Primer 1 SEGP1624

<400>  56
cgtagcattc tatgattatg aagcc                                             25


<210>  57
<211>  23
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Enterococcus ddl Forward Primer 2 SEGP1627

<400>  57
gacaggaaag aaactaggag gac                                               23


<210>  58
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Enterococcus ddl Reverse Primer 1 SEGP1625

<400>  58
catcgtgtaa gctaacttcg                                                   20


<210>  59
<211>  18
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Enterococcus ddl Reverse Primer 2 SEGP1628

<400>  59
aaacagacac atcgtgct                                                     18


<210>  60
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Enterococcus ddl Probe 1 SEGP1626


<220>
<221>  misc_feature
<223>  5`-HEX

<220>
<221>  misc_feature
<223>  3`-Blocker

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (9)..(10)
<223>  ZEN Quencher

<400>  60
cagattccag ccgaagtgcc                                                   20


<210>  61
<211>  22
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Enterococcus ddl Probe 2 SEGP1629


<220>
<221>  misc_feature
<223>  5`-HEX

<220>
<221>  misc_feature
<223>  3`-Blocker

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (9)..(10)
<223>  ZEN Quencher

<400>  61
cacttctgcc gccatacaac aa                                                22


<210>  62
<211>  33
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Enterococcus gyrB Forward Primer 1 SEGP2882

<400>  62
agcaacgatc ctgaaaaatg cgaattgttc atc                                    33


<210>  63
<211>  33
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Enterococcus gyrB Forward Primer 2 SEGP2884

<400>  63
agtaaagatc cggaaaaatg cgaattattt atc                                    33


<210>  64
<211>  24
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Enterococcus gyrB Reverse Primer 1 SEGP2885

<400>  64
aaagaccgga tctcttcatt tgcc                                              24


<210>  65
<211>  24
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Enterococcus gyrB Reverse Primer 2 SEGP2886

<400>  65
aatgaccgaa tttcttcatt ggct                                              24


<210>  66
<211>  40
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Enterococcus gyrB Probe SEGP2888


<220>
<221>  misc_feature
<223>  5`-FAM

<220>
<221>  misc_feature
<223>  3`-Blocker

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (9)..(10)
<223>  ZEN Quencher

<400>  66
ccaattcgtg ggaaaatctt gaatgttgag aaagcaagca                             40


<210>  67
<211>  27
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  S. Aureus CPE Forwad Primer SEGP1490

<400>  67
aagataagct tattgaacaa ggacatc                                           27


<210>  68
<211>  23
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  S. Aureus CPE Reverse Primer SEGP1491

<400>  68
cttgaggtga attgttgtga acc                                               23


<210>  69
<211>  30
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  S. Aureus CPE Probe SEGP1493


<220>
<221>  misc_feature
<223>  5`-HEX

<220>
<221>  misc_feature
<223>  3`-Blocker

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (9)..(10)
<223>  ZEN Quencher

<400>  69
ttaggaatca attatggaag tcgacctcgt                                        30


<210>  70
<211>  27
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  S. Aureus capN Forward Primer SEGP1490

<400>  70
aagataagct tattgaacaa ggacatc                                           27


<210>  71
<211>  23
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  S. Aureus capN Reverse Primer SEGP1491

<400>  71
cttgaggtga attgttgtga acc                                               23


<210>  72
<211>  30
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  S. Aureus capN Probe SEGP1492


<220>
<221>  misc_feature
<223>  5`-FAM

<220>
<221>  misc_feature
<223>  3`-Blocker

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (9)..(10)
<223>  ZEN Quencher

<400>  72
ttaggaatca attatggaag tcgacctcgt                                        30


<210>  73
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  S. Aureus gyrB Forward Primer SEGP2792

<400>  73
cacaagtcgc acgtacagtg                                                   20


<210>  74
<211>  29
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  S. Aureus gyrB Reverse Primer SEGP2793

<400>  74
attcttcagg acttttacta gagcaatcg                                         29


<210>  75
<211>  26
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  S. Aureus gyrB Probe SEGP2794


<220>
<221>  misc_feature
<223>  5`-FAM

<220>
<221>  misc_feature
<223>  3`-Blocker

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (9)..(10)
<223>  ZEN Quencher

<400>  75
taaatcagcg ttagatgtag caagtc                                            26


<210>  76
<211>  31
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  S. Aureus ddlA Forward Primer SEGP2932

<400>  76
atctactgat gagcttcatt tagaaaatgg a                                      31


<210>  77
<211>  24
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  S. Aureus ddlA Reverse Primer SEGP2933

<400>  77
tcaaaaagtc cttgaatcgt gcca                                              24


<210>  78
<211>  44
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  S. Aureus ddlA Probe SEGP2935


<220>
<221>  misc_feature
<223>  5`-FAM

<220>
<221>  misc_feature
<223>  3`-Blocker

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (9)..(10)
<223>  ZEN Quencher

<400>  78
cgcttgagat ttcacagcta ttgaaagaaa gtagttcagg acaa                        44


<210>  79
<211>  25
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  S. Aureus tuf Forward Primer SEGP1835

<400>  79
ccgtgttgaa cgtggtcaaa tcaaa                                             25


<210>  80
<211>  26
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  S. Aureus tuf Reverse Primer SEGP1836

<400>  80
agcagctaat acttgaccac gttgta                                            26


<210>  81
<211>  22
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  S. Aureus tuf Probe SEGP1838


<220>
<221>  misc_feature
<223>  5`-FAM

<220>
<221>  misc_feature
<223>  3`-Blocker

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (9)..(10)
<223>  ZEN Quencher

<400>  81
agactacgct gaagctggtg ac                                                22


<210>  82
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  S. Agalactiae sip Forward Primer SEGP2204

<400>  82
atcctgagac aacactgaca                                                   20


<210>  83
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  S. Agalactiae sip Reverse Primer SEGP2205

<400>  83
ttgctggtgt ttctattttc a                                                 21


<210>  84
<211>  25
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  S. Agalactiae sip Probe SEGP2206


<220>
<221>  misc_feature
<223>  5`-Cy5.5

<220>
<221>  misc_feature
<223>  3`-Phosphate

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (11)..(12)
<223>  BHQ-2 Quencher

<400>  84
atcagaagag tcatactgcc acttc                                             25


<210>  85
<211>  29
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  S. Agalactiae ddlA Forward Primer SEGP2947

<400>  85
cacaagaatt tgatgaaatg ccatcttca                                         29


<210>  86
<211>  33
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  S. Agalactiae ddlA Reverse Primer SEGP2949

<400>  86
acaattgcat tatcatcata gatatcactt gga                                    33


<210>  87
<211>  44
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  S. Agalactiae ddlA Probe SEGP2951


<220>
<221>  misc_feature
<223>  5`-FAM

<220>
<221>  misc_feature
<223>  3`-Blocker

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (9)..(10)
<223>  ZEN Quencher

<400>  87
taatgacaaa ccaaactgtt gatttagaca aaatggttcg tcca                        44


<210>  88
<211>  28
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Candida 18s rRNA Forward Primer SEGP1712

<400>  88
cgttttcatt aatcaagaac gaaagtta                                          28


<210>  89
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Candida 18s rRNA Reverse Primer SEGP1713

<400>  89
accgatccct agtcggcata                                                   20


<210>  90
<211>  33
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Candida 18s rRNA Probe SEGP1716


<220>
<221>  misc_feature
<223>  5`-FAM

<220>
<221>  misc_feature
<223>  3`-Blocker

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (9)..(10)
<223>  ZEN Quencher

<400>  90
agactacgac ggtatctgat catcttcgat ccc                                    33


<210>  91
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Candida 5.8s rRNA Forward Primer SEGP1718

<400>  91
acaacggatc tcttggttct c                                                 21


<210>  92
<211>  23
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Candida 5.8s rRNA Reverse Primer SEGP1719

<400>  92
gcaatgtgcg ttcaaagatt cga                                               23


<210>  93
<211>  30
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Candida 5.8s rRNA Probe SEGP1722.1


<220>
<221>  misc_feature
<223>  5`-FAM

<220>
<221>  misc_feature
<223>  3`-Phosphate

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (9)..(10)
<223>  BHQ-2 Quencher

<400>  93
tcgatgaaga acgcagcgaa atgcgatacg                                        30


<210>  94
<211>  19
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Generic Bacteria 16s rRNA Forward Primer SEGP1830

<400>  94
tcctacggga ggcagcagt                                                    19


<210>  95
<211>  26
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Generic Bacteria 16s rRNA Reverse Primer SEGP1831

<400>  95
ggactaccag ggtatctaat cctgtt                                            26


<210>  96
<211>  23
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Generic Bacteria 16s rRNA Probe SEGP1895.1


<220>
<221>  misc_feature
<223>  5`-CFR 635

<220>
<221>  misc_feature
<223>  3`-Phosphate

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (15)..(16)
<223>  BHQ-2 Quencher

<400>  96
cgtattaccg cggctgctgg cac                                               23


<210>  97
<211>  25
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Internal Control Forward Primer SEGP1952


<220>
<221>  modified_base
<222>  (25)..(25)
<223>  t-butylbenzyl-dC

<400>  97
acaaccgcgc catacatgtc aagac                                             25


<210>  98
<211>  24
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Internal Control Reverse Primer SEGP1953


<220>
<221>  modified_base
<222>  (24)..(24)
<223>  t-butylbenzyl-dC

<400>  98
gtcgggccgc ttatacagta ccac                                              24


<210>  99
<211>  33
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Internal Control Probe SEGP1954


<220>
<221>  misc_feature
<223>  5`-Cy5.5

<220>
<221>  misc_feature
<223>  3`-Phosphate

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (11)..(2)
<223>  BHQ-2 Quencher

<400>  99
tgcgcgtccc gttttgatac ttcgtaacgg tgc                                    33


<210>  100
<211>  23
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Streptococcus tuf Forward Primer SEGP1705

<400>  100
gtacagttgc ttcaggacgt atc                                               23


<210>  101
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Streptococcus tuf Reverse Primer SEGP1706

<400>  101
acgttcgatt tcatcacgtt g                                                 21


<210>  102
<211>  28
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Streptococcus tuf Probe SEGP1709.1


<220>
<221>  misc_feature
<223>  5`-ATTO

<220>
<221>  misc_feature
<223>  3`-Phosphate

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (7)..(8)
<223>  BHQ-2 Quencher

<400>  102
ttccgtaaac aacttgacga aggtcttg                                          28


<210>  103
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  blaKPC Forward Primer SEGP2124

<400>  103
gcgataccac gttccgtctg                                                   20


<210>  104
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  blaVIM Forward Primer SEGP2135

<400>  104
ccgagtggtg agtatccgac                                                   20


<210>  105
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  blaNDM Forward Primer SEGP2127

<400>  105
tttggcgatc tggttttccg                                                   20


<210>  106
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  blaOXA-48 Forward Primer SEGP2133

<400>  106
ggcacgtatg agcaagatgc                                                   20


<210>  107
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  blaKPC Reverse Primer SEGP2125

<400>  107
cggtcgtgtt tccctttagc                                                   20


<210>  108
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  blaVIM Reverse Primer SEGP2136

<400>  108
gaatgcgtgg gaatctcgtt c                                                 21


<210>  109
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  blaNDM Reverse Primer SEGP2128

<400>  109
atcaaaccgt tggaagcgac                                                   20


<210>  110
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  blaOXA-48 Reverse Primer SEGP2134

<400>  110
gtttgacaat acgctggctg c                                                 21


<210>  111
<211>  22
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  blaKPC Probe SEGP2126


<220>
<221>  misc_feature
<223>  5`-CFR 635

<220>
<221>  misc_feature
<223>  3`-Phosphate

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (14)..(15)
<223>  BHQ-2 Quencher

<400>  111
agcggcagca gtttgttgat tg                                                22


<210>  112
<211>  28
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  blaVIM Probe SEGP2137


<220>
<221>  misc_feature
<223>  5`-CFR 635

<220>
<221>  misc_feature
<223>  3`-Phosphate

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (15)..(16)
<223>  BHQ-2 Quencher

<400>  112
cgctgtatca atcaaaagca actcatca                                          28


<210>  113
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  blaNDM Probe SEGP2129


<220>
<221>  misc_feature
<223>  5`-CFR 635

<220>
<221>  misc_feature
<223>  3`-Phosphate

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (15)..(16)
<223>  BHQ-2 Quencher

<400>  113
agacattcgg tgcgagctgg c                                                 21


<210>  114
<211>  31
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  blaOXA-48 Probe SEGP2346


<220>
<221>  misc_feature
<223>  5`-CFR 635

<220>
<221>  misc_feature
<223>  3`-Phosphate

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (11)..(12)
<223>  BHQ-2 Quencher

<400>  114
tcgggcaatg tagacagttt ctggctcgac g                                      31


<210>  115
<211>  23
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  P. Stuartii citC Forward Primer SEGP2164

<400>  115
gccatcgtga tgaatgccaa tcc                                               23


<210>  116
<211>  24
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  P. Stuartii citC Reverse Primer SEGP2166

<400>  116
tcagagcctt tgtggatagt gaga                                              24


<210>  117
<211>  44
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  P. Stuartii citC Probe SEGP2167


<220>
<221>  misc_feature
<223>  5`-FAM

<220>
<221>  misc_feature
<223>  3`-Blocker

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (9)..(10)
<223>  ZEN Quencher

<400>  117
ttggctacat ttatttgtcg tcaaagaaga tacctcacgc ttcc                        44


<210>  118
<211>  24
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Salmonella invA Forward Primer SEGP2119

<400>  118
tgaccatttc aatgggaact ctgc                                              24


<210>  119
<211>  23
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Salmonella invA Reverse Primer SEGP2121

<400>  119
agatcgccaa tcagtcctaa cga                                               23


<210>  120
<211>  30
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Salmonella invA Probe SEGP2120


<220>
<221>  misc_feature
<223>  5`-FAM

<220>
<221>  misc_feature
<223>  3`-Blocker

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (9)..(10)
<223>  ZEN Quencher

<400>  120
caaaggcgag cagccgctca gtattgagga                                        30


<210>  121
<211>  33
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  S. Agalactiae gyrB Forward Primer SEGP2921

<400>  121
accactgtat ttgattttga taaattagcc aaa                                    33


<210>  122
<211>  31
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  S. Agalactiae gyrB Reverse Primer SEGP2922

<400>  122
ttctcattga taaactcaac gtatgaacct a                                      31


<210>  123
<211>  44
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  S. Agalactiae gyrB Probe SEGP2923


<220>
<221>  misc_feature
<223>  5`-FAM

<220>
<221>  misc_feature
<223>  3`-Blocker

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (9)..(10)
<223>  ZEN Quencher

<400>  123
actaagaatc tccatttcag acaagcgaga aggtcaagaa gttg                        44


<210>  124
<211>  26
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  S. Pneumoniae tuf Forward Primer SEGP2777

<400>  124
gtgactctaa atacgaagac atcgtt                                            26


<210>  125
<211>  22
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  S. Pneumoniae tuf Reverse Primer SEGP2778

<400>  125
gcaatggttt gtcagtgtca cg                                                22


<210>  126
<211>  26
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  S. Pneumoniae tuf Probe SEGP2779


<220>
<221>  misc_feature
<223>  5`-FAM

<220>
<221>  misc_feature
<223>  3`-Blocker

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (9)..(10)
<223>  ZEN Quencher

<400>  126
tgaacacagt tgatgagtat atccca                                            26


<210>  127
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  S. Pyogenes speB Forward Primer SEGP2113

<400>  127
cggaagaagc cgtcagagac                                                   20


<210>  128
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  S. Pyogenes speB Reverse Primer SEGP2114

<400>  128
atggtgctga cggacgtaac                                                   20


<210>  129
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  S. Pyogenes speB Probe SEGP2115


<220>
<221>  misc_feature
<223>  5`-FAM

<220>
<221>  misc_feature
<223>  3`-Blocker

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (9)..(10)
<223>  ZEN Quencher

<400>  129
caccccaacc ccagttaaca                                                   20


<210>  130
<211>  18
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  P. aeruginosa O-antigen acetylase Forward Primer RM_PFP01

<400>  130
acgttttccc ttcgctga                                                     18


<210>  131
<211>  18
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  P. aeruginosa O-antigen acetylase Reverse Primer 1 RM_PRP02

<400>  131
gtacagtgac cagccatc                                                     18


<210>  132
<211>  19
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  P. aeruginosa O-antigen acetylase Reverse Primer 2 RM_PRP04

<400>  132
gcgaaacaat ccaggccat                                                    19


<210>  133
<211>  31
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  P. aeruginosa O-antigen acetylase Probe RM_P04


<220>
<221>  misc_feature
<223>  5` FAM_Thr

<220>
<221>  misc_feature
<223>  3` Phosphate

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (6)..(7)
<223>  BHQ-2 Quencher

<400>  133
cctacgtgaa tgcgctgttc gatgcgttgg c                                      31


<210>  134
<211>  33
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Candida 18s rRNA Probe SEGP1717


<220>
<221>  misc_feature
<223>  5`-HEX

<220>
<221>  misc_feature
<223>  3`-Blocker

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (9)..(10)
<223>  ZEN Quencher

<400>  134
agactacgac ggtatctgat catcttcgat ccc                                    33


