                         SEQUENCE LISTING

<110>  The Translational Genomics Research Institute
 
<120>  DETECTION AND TREATMENT OF RESIDUAL DISEASE USING CIRCULATING 
       TUMOR DNA ANALYSIS

<130>  91482.243PCT

<150>  62/866,543
<151>  2019-06-25

<160>  23    

<170>  PatentIn version 3.5

<210>  1
<211>  53
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Hairpin oligonucleotide


<220>
<221>  misc_feature
<222>  (10)..(18)
<223>  A 9 bp unique molecular identifier/ N= A, T, C, or G.

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (36)..(41)
<223>  N= A, T, C, or G.

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (36)..(41)
<223>  N= A, T, C, or G.

<400>  1
tgctctttgn nnnnnnnngt cagatcggaa gagcannnnn nctgcccata gag              53


<210>  2
<211>  17
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  2
cgctcttccg atctctg                                                      17


<210>  3
<211>  37
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer sequence

<400>  3
gtgactggag ttcagacgtg tgctcttccg atctgac                                37


<210>  4
<211>  67
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer sequence


<220>
<221>  misc_feature
<223>  N= A, T, G, or C

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (25)..(30)
<223>  n is a, c, g, or t

<400>  4
caagcagaag acggcatacg agatnnnnnn gtgactggag ttcagacgtg tgctcttccg       60

atctgac                                                                 67


<210>  5
<211>  61
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer sequence

<400>  5
aatgatacgg cgaccaccga gatctacact ctttccctac acgacgctct tccgatctct       60

g                                                                       61


<210>  6
<211>  36
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer sequence

<400>  6
acactctttc cctacacgac gctcttccga tctctg                                 36


<210>  7
<211>  37
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer sequence

<400>  7
gtgactggag ttcagacgtg tgctcttccg atctgac                                37


<210>  8
<211>  25
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer sequence

<400>  8
aggtgccatc attcttgagg aggaa                                             25


<210>  9
<211>  17
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer sequence

<400>  9
ccgccaggtc ttgatgt                                                      17


<210>  10
<211>  26
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer sequence

<400>  10
tgtcataggg actctggatc ccagaa                                            26


<210>  11
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer sequence

<400>  11
agttaaaatt cccgtcgcta t                                                 21


<210>  12
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer sequence

<400>  12
cgtggacaac ccccacgtgt                                                   20


<210>  13
<211>  15
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer sequence

<400>  13
ccaccgtgca gctca                                                        15


<210>  14
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer sequence

<400>  14
tggctgagtc ctggcgctgt                                                   20


<210>  15
<211>  19
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer sequence

<400>  15
tttcaggatg gtggatgtg                                                    19


<210>  16
<211>  22
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer sequence

<400>  16
tgcaaaaata tcccccggct tg                                                22


<210>  17
<211>  22
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer sequence

<400>  17
ggatgggtaa aacctatcat ca                                                22


<210>  18
<211>  26
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer sequence

<400>  18
gggaagtgag gacgtacact gccttt                                            26


<210>  19
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer sequence

<400>  19
acatagttcg aatcatgcat g                                                 21


<210>  20
<211>  28
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer sequence

<400>  20
gctggacaac aaaaatggat tggatctt                                          28


<210>  21
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer sequence

<400>  21
cttccacaca attaaacagc a                                                 21


<210>  22
<211>  30
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer sequence

<400>  22
acacttacac atcactttgc gtggtgtaga                                        30


<210>  23
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer sequence

<400>  23
tgatcaaaaa gggattcaat t                                                 21


