                         SEQUENCE LISTING

<110>  THE TRUSTEES OF THE UNIVERSITY OF PENNSYLVANIA
       Asangani, Irfan
 
<120>  TREATMENT OF CANCER WITH CDK INHIBITORS

<130>  P-585580-PC

<150>  62/838,271
<151>  2019-04-24

<160>  41    

<170>  PatentIn version 3.5

<210>  1
<211>  37
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  MED1 (T1032A) fwd primer

<400>  1
gttcttctaa cagacctttt gccccaccta ccagtac                                37


<210>  2
<211>  37
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  MED1 (T1032A) rev primer

<400>  2
gtactggtag gtggggcaaa aggtctgtta gaagaac                                37


<210>  3
<211>  38
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  MED1 (T1457A) fwd primer

<400>  3
gccatagtaa gtcaccagca tatgcccccc agaatctg                               38


<210>  4
<211>  38
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  MED1 (T1457A) rev primer

<400>  4
cagattctgg ggggcatatg ctggtgactt actatggc                               38


<210>  5
<211>  38
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  MED1 (T1457D) fwd pimer

<400>  5
gccatagtaa gtcaccagca tatgaccccc agaatctg                               38


<210>  6
<211>  38
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  MED1 (T1457D) rev primer

<400>  6
cagattctgg gggtcatatg ctggtgactt actatggc                               38


<210>  7
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  zbtb16_qPCR_fwd primer

<400>  7
cagttttcga aggaggatgc                                                   20


<210>  8
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  zbtb16_qPCR_rev primer

<400>  8
cccacacagc agacagaaga                                                   20


<210>  9
<211>  24
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  erg_qPCR_fwd primer

<400>  9
cgcagagtta tcgtgccagc agat                                              24


<210>  10
<211>  24
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  erg_qPCR_rev primer

<400>  10
ccatattctt tcaccgccca ctcc                                              24


<210>  11
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  psa (klk3)_qPCR_fwd primer

<400>  11
acgctggaca gggggcaaaa g                                                 21


<210>  12
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  psa (klk3)_qPCR_rev primer

<400>  12
gggcagggca catggttcac t                                                 21


<210>  13
<211>  25
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  tmprss2_qPCR_fwd primer

<400>  13
caggagtgta cgggaatgtg atggt                                             25


<210>  14
<211>  24
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  tmprss2_qPCR_rev primer

<400>  14
gattagccgt ctgccctcat ttgt                                              24


<210>  15
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  fkbp5_qPCR_fwd primer

<400>  15
tctcatgtct ccccagttcc                                                   20


<210>  16
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  fkbp5_qPCR_rev primer

<400>  16
ttctggcttt cacgtctgtg                                                   20


<210>  17
<211>  19
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  slc45a3_qPCR_fwd primer

<400>  17
tcgtgggcga ggggctgta                                                    19


<210>  18
<211>  25
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  slc45a3_qPCR_rev primer

<400>  18
catccgaacg ccttcatcat agtgt                                             25


<210>  19
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  ar_qPCR_fwd primer

<400>  19
cagtggatgg gctgaaaaat                                                   20


<210>  20
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  ar_qPCR_rev primer

<400>  20
ggagcttggt gagctggtag                                                   20


<210>  21
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  gapdh_qPCR_fwd primer

<400>  21
tgcaccacca actgcttagc                                                   20


<210>  22
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  gapdh_qPCR_rev primer

<400>  22
ggcatggact gtggtcatga g                                                 21


<210>  23
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  KLK3 fwd primer

<400>  23
acgctggaca gggggcaaaa g                                                 21


<210>  24
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  KLK3 rev primer

<400>  24
gggcagggca catggttcac t                                                 21


<210>  25
<211>  25
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  TMPRSS2 fwd primer

<400>  25
caggagtgta cgggaatgtg atggt                                             25


<210>  26
<211>  24
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  TMPRSS2 rev primer

<400>  26
gattagccgt ctgccctcat ttgt                                              24


<210>  27
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  FKBP5 fwd primer

<400>  27
tctcatgtct ccccagttcc                                                   20


<210>  28
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  FKBP5 rev primer

<400>  28
ttctggcttt cacgtctgtg                                                   20


<210>  29
<211>  19
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  SLC45A3 fwd primer

<400>  29
tcgtgggcga ggggctgta                                                    19


<210>  30
<211>  25
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  SLC45A3 rev primer

<400>  30
catccgaacg ccttcatcat agtgt                                             25


<210>  31
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  ZBTB16 fwd primer

<400>  31
cagttttcga aggaggatgc                                                   20


<210>  32
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  ZBTB16 rev primer

<400>  32
cccacacagc agacagaaga                                                   20


<210>  33
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  GAPDH fwd primer

<400>  33
tgcaccacca actgcttagc                                                   20


<210>  34
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  GAPDH rev primer

<400>  34
ggcatggact gtggtcatga g                                                 21


<210>  35
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  AR fwd primer

<400>  35
cagtggatgg gctgaaaaat                                                   20


<210>  36
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  AR rev primer

<400>  36
ggagcttggt gagctggtag                                                   20


<210>  37
<211>  24
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  ERG fwd primer

<400>  37
cgcagagtta tcgtgccagc agat                                              24


<210>  38
<211>  24
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  ERG rev primer

<400>  38
ccatattctt tcaccgccca ctcc                                              24


<210>  39
<211>  4
<212>  PRT
<213>  Homo sapiens


<220>
<221>  MISC_FEATURE
<222>  (1)..(1)
<223>  Xaa = Ser or Thr

<220>
<221>  MISC_FEATURE
<222>  (3)..(3)
<223>  Xaa can be any naturally occurring amino acid

<220>
<221>  MISC_FEATURE
<222>  (4)..(4)
<223>  Xaa = Lys or Arg

<400>  39

Xaa Pro Xaa Xaa 
1               


<210>  40
<211>  7
<212>  PRT
<213>  Homo sapiens

<400>  40

Tyr Ser Pro Thr Ser Thr Ser 
1               5           


<210>  41
<211>  7
<212>  PRT
<213>  Homo sapiens

<400>  41

Tyr Ser Pro Thr Ser Pro Ser 
1               5           


