                         SEQUENCE LISTING

<110>  ST GEORGE'S HOSPITAL MEDICAL SCHOOL
 
<120>  DETECTION AND ANTIBIOTIC RESISTANCE PROFILING OF MICROORGANISMS

<130>  N414496WO

<150>  GB1902887.7
<151>  2019-03-04

<160>  33    

<170>  PatentIn version 3.5

<210>  1
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  NG_gyrA_F primer

<400>  1
atccgccacg accacaaatt                                                   20


<210>  2
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  NG_gyrA_R primer

<400>  2
atattggaca gtgcgacggc                                                   20


<210>  3
<211>  42
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  NG_gyrA_BC_F primer

<400>  3
tttctgttgg tgctgatatt gcatccgcca cgaccacaaa tt                          42


<210>  4
<211>  42
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  NG_gyrA_BC_R primer

<400>  4
acttgcctgt cgctctatct tcatattgga cagtgcgacg gc                          42


<210>  5
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  CT_OMP1_F primer

<400>  5
tttgccgctt tgagttctgc t                                                 21


<210>  6
<211>  26
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  CT_OMP1_R primer

<400>  6
caataccgca agattttcta gatttc                                            26


<210>  7
<211>  43
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  CT_OMP1_BC_F primer

<400>  7
tttctgttgg tgctgatatt gctttgccgc tttgagttct gct                         43


<210>  8
<211>  48
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  CT_OMP1_BC_R primer

<400>  8
acttgcctgt cgctctatct tccaataccg caagattttc tagatttc                    48


<210>  9
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Mg 23S_1992F primer

<400>  9
ccatctcttg actgtctcgg                                                   20


<210>  10
<211>  19
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Mg 23S_2679R primer

<400>  10
tctcgtacta gaagcaaag                                                    19


<210>  11
<211>  42
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Mg 23S_BC_1992F primer

<400>  11
tttctgttgg tgctgatatt gcccatctct tgactgtctc gg                          42


<210>  12
<211>  44
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Mg 23S_BC_2679R

<400>  12
acttgcctgt cgctctatct tctcctctcg tactagaagc aaag                        44


<210>  13
<211>  27
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  TV_NTR6_F primer

<400>  13
cttcattgaa tttattcgtt caaaatt                                           27


<210>  14
<211>  26
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  TV_NTR6_R

<400>  14
ttattcaatg tatgtaacct ttctaa                                            26


<210>  15
<211>  49
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  TV_NTR6_BC_F primer

<400>  15
tttctgttgg tgctgatatt gccttcattg aatttattcg ttcaaaatt                   49


<210>  16
<211>  48
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  TV_NTR6_BC_R primer

<400>  16
acttgcctgt cgctctatct tcttattcaa tgtatgtaac ctttctaa                    48


<210>  17
<211>  28
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  T. vaginalis specific repeat DNA fragment forward primer

<400>  17
aaagatgggt gttttaagct agataagg                                          28


<210>  18
<211>  22
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  T. vaginalis specific repeat DNA fragment reverse primer

<400>  18
tctgtgccgt cttcaagtat gc                                                22


<210>  19
<211>  26
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  T. vaginalis specific repeat DNA fragment probe


<220>
<221>  misc_feature
<222>  (1)..(1)
<223>  6FAM

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (26)..(26)
<223>  BHQ1

<400>  19
agttcatgtc ctctccaagc gtaagt                                            26


<210>  20
<211>  24
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  MgPa adhesin gene MG_F primer

<400>  20
gagaaatacc ttgatggtca gcaa                                              24


<210>  21
<211>  33
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  MgPa adhesin gene MG_R primer

<400>  21
gttaatatca tataaagctc taccgttgtt atc                                    33


<210>  22
<211>  18
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  MgPa adhesin gene MG probe


<220>
<221>  misc_feature
<222>  (1)..(1)
<223>  6FAM

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (18)..(18)
<223>  MGBNFQ

<400>  22
actttgcaat cagaaggt                                                     18


<210>  23
<211>  25
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  cryptic plasmid CT_F primer

<400>  23
catgaaaact cgttccgaaa tagaa                                             25


<210>  24
<211>  25
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  cryptic plasmid CT_R primer

<400>  24
tcagagcttt acctaacaac gcata                                             25


<210>  25
<211>  18
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  cryptic plasmid probe


<220>
<221>  misc_feature
<222>  (1)..(1)
<223>  6FAM

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (18)..(18)
<223>  MGBNFQ

<400>  25
tcgcatgcaa gatatcga                                                     18


<210>  26
<211>  18
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  opa gene NG_F primer

<400>  26
ttgaaacacc gcccggaa                                                     18


<210>  27
<211>  23
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  opa gene NG_R primer

<400>  27
tttcggctcc ttattcggtt tga                                               23


<210>  28
<211>  27
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  opa gene NG probe


<220>
<221>  misc_feature
<222>  (1)..(1)
<223>  6FAM

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (27)..(27)
<223>  BHQ1

<400>  28
ccgatataat ccgcccttca acatcag                                           27


<210>  29
<211>  15
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  NG gyrA antimicrobial reistance region WT

<400>  29
tccgcagttt acgac                                                        15


<210>  30
<211>  15
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  NG gyrA antimicrobial resistance region in samples 58, 59 and 60

<400>  30
ttcgcagttt acgcc                                                        15


<210>  31
<211>  15
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  MG 23S rRNA antimicrobial resistance region

<400>  31
cgggacggaa agacc                                                        15


<210>  32
<211>  15
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  TV ntr6 antimicrobial resistance region wild type

<400>  32
aatgcaaaag cagac                                                        15


<210>  33
<211>  15
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  TV ntr6 antimicrobial resistance region samples 17 and 34

<400>  33
aatgcaatag cagac                                                        15


