                         SEQUENCE LISTING

<110>  VIB VZW
       KATHOLIEKE UNIVERSITEIT LEUVEN, K.U.LEUVEN R&D
 
<120>  TUMOR MINIMAL RESIDUAL DISEASE STRATIFICATION

<130>  JM/MelaDX/624

<150>  GB 1802312.7
<151>  2018-02-13

<160>  70    

<170>  PatentIn version 3.5

<210>  1
<211>  37
<212>  PRT
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  37-residue amphipathic peptide

<400>  1

Asp Trp Leu Lys Ala Phe Tyr Asp Lys Val Ala Glu Lys Leu Lys Glu 
1               5                   10                  15      


Ala Phe Pro Asp Trp Ala Lys Ala Ala Tyr Asp Lys Ala Ala Glu Lys 
            20                  25                  30          


Ala Lys Glu Ala Ala 
        35          


<210>  2
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  siRNA

<400>  2
gaaccuauug auggauuaat t                                                 21


<210>  3
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  siRNA

<400>  3
ccuucacuau caguuggaat t                                                 21


<210>  4
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  siRNA

<400>  4
gcaacauuca aguuaagcat t                                                 21


<210>  5
<211>  58
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  shRNA

<400>  5
ccgggaagtt acatattagg ccatactcga gtatggccta atatgtaact tctttttg         58


<210>  6
<211>  58
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  shRNA

<400>  6
ccggccgacg ttaatctgaa aggaactcga gttcctttca gattaacgtc ggtttttg         58


<210>  7
<211>  58
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  shRNA

<400>  7
ccgggccata atcgacacat ataaactcga gtttatatgt gtcgattatg gctttttg         58


<210>  8
<211>  58
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  shRNA

<400>  8
ccggcctgct tatccagaag acaatctcga gattgtcttc tggataagca ggtttttg         58


<210>  9
<211>  58
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  shRNA

<400>  9
ccggccattg gtgatgagaa ggcaactcga gttgccttct catcaccaat ggtttttg         58


<210>  10
<211>  57
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  shRNA

<400>  10
ccgggcagat gaagatcatc gaaatctcga gatttcgatg atcttcatct gcttttt          57


<210>  11
<211>  57
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  shRNA

<400>  11
ccggccgctg tcaaacatgt ggttactcga gtaaccacat gtttgacagc ggttttt          57


<210>  12
<211>  57
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  shRNA

<400>  12
ccgggctggt ttccaaacag aggatctcga gatcctctgt ttggaaacca gcttttt          57


<210>  13
<211>  57
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  shRNA

<400>  13
ccggcagcag ttacaagcct tcaaactcga gtttgaaggc ttgtaactgc tgttttt          57


<210>  14
<211>  57
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  shRNA

<400>  14
ccggctatga agaatacacc agcaactcga gttgctggtg tattcttcat agttttt          57


<210>  15
<211>  57
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  shRNA

<400>  15
ccggcgggat tggaaacatg aactactcga gtagttcatg tttccaatcc cgttttt          57


<210>  16
<211>  57
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  shRNA

<400>  16
ccgggagtcc taactgagct ggtttctcga gaaaccagct cagttaggac tcttttt          57


<210>  17
<211>  57
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  shRNA

<400>  17
ccgggcctac accaagcaga agtatctcga gatacttctg cttggtgtag gcttttt          57


<210>  18
<211>  57
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  shRNA

<400>  18
ccggctatca gaagtgcctt gtcatctcga gatgacaagg cacttctgat agttttt          57


<210>  19
<211>  57
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  shRNA

<400>  19
ccgggcgagc cattgtactc tttaactcga gttaaagagt acaatggctc gcttttt          57


<210>  20
<211>  57
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  shRNA

<400>  20
ccggctttag gttctttgct gcattctcga gaatgcagca aagaacctaa agttttt          57


<210>  21
<211>  57
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  shRNA

<400>  21
ccgggcggtc tgcatgaagg aatttctcga gaaattcctt catgcagacc gcttttt          57


<210>  22
<211>  57
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  shRNA

<400>  22
ccggcgaaag aaggagaccc gttatctcga gataacgggt ctccttcttt cgttttt          57


<210>  23
<211>  57
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  shRNA

<400>  23
ccggcgaaat cctctatgtc aacatctcga gatgttgaca tagaggattt cgttttt          57


<210>  24
<211>  57
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  shRNA

<400>  24
ccgggctgtg aagacgatga agattctcga gaatcttcat cgtcttcaca gcttttt          57


<210>  25
<211>  20
<212>  DNA
<213>  artificial sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  25
catgtacatc atcgcccagt                                                   20


<210>  26
<211>  19
<212>  DNA
<213>  artificial sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  26
caccatcagc caggtcatt                                                    19


<210>  27
<211>  21
<212>  DNA
<213>  artificial sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  27
tcatccctgt ctattgctcc a                                                 21


<210>  28
<211>  20
<212>  DNA
<213>  artificial sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  28
tgttctgctt gcagctgttc                                                   20


<210>  29
<211>  20
<212>  DNA
<213>  artificial sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  29
gaccgggtgc ccagcgagta                                                   20


<210>  30
<211>  19
<212>  DNA
<213>  artificial sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  30
cagccgggac cgacacagg                                                    19


<210>  31
<211>  20
<212>  DNA
<213>  artificial sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  31
atgctggaag ggttcttctc                                                   20


<210>  32
<211>  20
<212>  DNA
<213>  artificial sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  32
tttcattctg gtgtgccatc                                                   20


<210>  33
<211>  20
<212>  DNA
<213>  artificial sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  33
ctgcctgctt atccagatcc                                                   20


<210>  34
<211>  20
<212>  DNA
<213>  artificial sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  34
cctcacactt gaggctgatg                                                   20


<210>  35
<211>  20
<212>  DNA
<213>  artificial sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  35
accttggaaa gtgccttgac                                                   20


<210>  36
<211>  21
<212>  DNA
<213>  artificial sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  36
ctcacagtgc acaatactga c                                                 21


<210>  37
<211>  23
<212>  DNA
<213>  artificial sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  37
ccctaccact gggtacagat gga                                               23


<210>  38
<211>  23
<212>  DNA
<213>  artificial sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  38
cttcaagaca cagacagcca gga                                               23


<210>  39
<211>  20
<212>  DNA
<213>  artificial sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  39
cctcttcatc ttgggctttg                                                   20


<210>  40
<211>  19
<212>  DNA
<213>  artificial sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  40
agcccctcct actccacag                                                    19


<210>  41
<211>  20
<212>  DNA
<213>  artificial sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  41
tggggcacct ggagttaatg                                                   20


<210>  42
<211>  20
<212>  DNA
<213>  artificial sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  42
atcttaaagt cccgtccggc                                                   20


<210>  43
<211>  19
<212>  DNA
<213>  artificial sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  43
cgaatgcctc aatgcgtct                                                    19


<210>  44
<211>  20
<212>  DNA
<213>  artificial sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  44
cccatttttc gatttggctc                                                   20


<210>  45
<211>  21
<212>  DNA
<213>  artificial sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  45
cccttgaggc ctacaccaag c                                                 21


<210>  46
<211>  21
<212>  DNA
<213>  artificial sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  46
cacacctgcc caggggtcat c                                                 21


<210>  47
<211>  22
<212>  DNA
<213>  artificial sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  47
tccaccaggc agcaagaata cg                                                22


<210>  48
<211>  22
<212>  DNA
<213>  artificial sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  48
ggagttgcta cggaaaccac tg                                                22


<210>  49
<211>  26
<212>  DNA
<213>  artificial sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  49
gggaaatggg aggggtgcaa aagagg                                            26


<210>  50
<211>  26
<212>  DNA
<213>  artificial sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  50
ttgcgtgagt gtggatggga ttggtg                                            26


<210>  51
<211>  19
<212>  DNA
<213>  artificial sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  51
ccagtacccg cacctgcac                                                    19


<210>  52
<211>  21
<212>  DNA
<213>  artificial sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  52
ctttcgttca gcagcctcca g                                                 21


<210>  53
<211>  25
<212>  DNA
<213>  artificial sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  53
cattgttatg ctggaaatgc tagaa                                             25


<210>  54
<211>  23
<212>  DNA
<213>  artificial sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  54
ggcttgctgt atgtggtact tgg                                               23


<210>  55
<211>  20
<212>  DNA
<213>  artificial sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  55
ggctggaccg agagagtttc                                                   20


<210>  56
<211>  20
<212>  DNA
<213>  artificial sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  56
tgctgttgtg cttaacccct                                                   20


<210>  57
<211>  24
<212>  DNA
<213>  artificial sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  57
ggtggtcgct aggtatgaat aacc                                              24


<210>  58
<211>  19
<212>  DNA
<213>  artificial sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  58
tccaccttcg atgtcggaa                                                    19


<210>  59
<211>  19
<212>  DNA
<213>  artificial sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  59
tgcacctacg gatgcactg                                                    19


<210>  60
<211>  20
<212>  DNA
<213>  artificial sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  60
cgatggacgg gatcttaggc                                                   20


<210>  61
<211>  24
<212>  DNA
<213>  artificial sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  61
gtggtagcac cttcaaagaa atcc                                              24


<210>  62
<211>  22
<212>  DNA
<213>  artificial sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  62
gcaacttcct cacgggtgtg tc                                                22


<210>  63
<211>  20
<212>  DNA
<213>  artificial sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  63
atggcaaata gaggaagcgg                                                   20


<210>  64
<211>  21
<212>  DNA
<213>  artificial sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  64
tggagaatag atcgaagcaa g                                                 21


<210>  65
<211>  21
<212>  DNA
<213>  artificial sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  65
aatctgtcat gctggtctgc c                                                 21


<210>  66
<211>  20
<212>  DNA
<213>  artificial sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  66
aggagatttg tttggcgtgc                                                   20


<210>  67
<211>  19
<212>  DNA
<213>  artificial sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  67
atttgggtcg cggttcttg                                                    19


<210>  68
<211>  21
<212>  DNA
<213>  artificial sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  68
tgccttgaca ttctcgatgg t                                                 21


<210>  69
<211>  24
<212>  DNA
<213>  artificial sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  69
acttttggta cattgtggct tcaa                                              24


<210>  70
<211>  20
<212>  DNA
<213>  artificial sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  70
ccgccaggac aaaccagtat                                                   20


