                         SEQUENCE LISTING

<110>  UNIVERSITY OF FLORIDA RESEARCH FOUNDATION, INCORPORATED
 
<120>  INDEXING BASED DEEP DNA SEQUENCING TO IDENTIFY RARE SEQUENCES

<130>  UF.1258XPCT

<150>  US 62/272,857
<151>  2015-12-30

<160>  44    

<170>  PatentIn version 3.5

<210>  1
<211>  61
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  primer


<220>
<221>  misc_feature
<222>  (31)..(37)
<223>  n is a, c, g, or t

<400>  1
tgactcacga gtcatcgact gcaggcagat nnnnnnnbhv hbagcaatay acygggccac       60

a                                                                       61


<210>  2
<211>  62
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  primer


<220>
<221>  misc_feature
<222>  (31)..(37)
<223>  n is a, c, g, or t

<400>  2
tgactcacga gtcatcgact gcaggcagat nnnnnnnddh hhgacctcat rgttgtctct       60

ag                                                                      62


<210>  3
<211>  25
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  primer

<400>  3
atggcatggg atatgatgat gaact                                             25


<210>  4
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  primer

<400>  4
atyacrgcrt aygcccagca                                                   20


<210>  5
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  primer

<400>  5
tgactcacga gtcatcgact                                                   20


<210>  6
<211>  52
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  primer

<400>  6
ctacacgacg ctcttccgat ctcgtgtaca gcatrgcgta yttytccatg gt               52


<210>  7
<211>  52
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  primer

<400>  7
ctacacgacg ctcttccgat cttgactgac gcatrgcgta yttytccatg gt               52


<210>  8
<211>  51
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  primer

<400>  8
ctacacgacg ctcttccgat ctctagctag catrgcgtay ttytccatgg t                51


<210>  9
<211>  51
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  primer

<400>  9
ctacacgacg ctcttccgat ctactgtcag catrgcgtay ttytccatgg t                51


<210>  10
<211>  50
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  primer

<400>  10
ctacacgacg ctcttccgat ctgtagtggc atrgcgtayt tytccatggt                  50


<210>  11
<211>  50
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  primer

<400>  11
ctacacgacg ctcttccgat ctcatgcggc atrgcgtayt tytccatggt                  50


<210>  12
<211>  49
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  primer

<400>  12
ctacacgacg ctcttccgat ctgcagtgca trgcgtaytt ytccatggt                   49


<210>  13
<211>  49
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  primer

<400>  13
ctacacgacg ctcttccgat cttagctgca trgcgtaytt ytccatggt                   49


<210>  14
<211>  48
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  primer

<400>  14
ctacacgacg ctcttccgat ctagtagcat rgcgtaytty tccatggt                    48


<210>  15
<211>  50
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  primer

<400>  15
ctacacgacg ctcttccgat ctcgtgatga gtggagggyg aggtycagat                  50


<210>  16
<211>  50
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  primer

<400>  16
ctacacgacg ctcttccgat ctacatcgtg gtggagggyg aggtycagat                  50


<210>  17
<211>  49
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  primer

<400>  17
ctacacgacg ctcttccgat ctgcctaagg tggagggyga ggtycagat                   49


<210>  18
<211>  49
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  primer

<400>  18
ctacacgacg ctcttccgat cttggtcacg tggagggyga ggtycagat                   49


<210>  19
<211>  48
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  primer

<400>  19
ctacacgacg ctcttccgat ctgactgtgt ggagggygag gtycagat                    48


<210>  20
<211>  48
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  primer

<400>  20
ctacacgacg ctcttccgat ctcactgtgt ggagggygag gtycagat                    48


<210>  21
<211>  47
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  primer

<400>  21
ctacacgacg ctcttccgat ctagtgagtg gagggygagg tycagat                     47


<210>  22
<211>  47
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  primer

<400>  22
ctacacgacg ctcttccgat cttcaaggtg gagggygagg tycagat                     47


<210>  23
<211>  46
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  primer

<400>  23
ctacacgacg ctcttccgat cttcatgtgg agggygaggt ycagat                      46


<210>  24
<211>  48
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  primer

<400>  24
tgctgaaccg ctcttccgat ctgtcagcat catcgactgc aggcagat                    48


<210>  25
<211>  48
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  primer

<400>  25
tgctgaaccg ctcttccgat cttagtcacg catcgactgc aggcagat                    48


<210>  26
<211>  48
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  primer

<400>  26
tgctgaaccg ctcttccgat ctacgagtgc catcgactgc aggcagat                    48


<210>  27
<211>  48
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  primer

<400>  27
tgctgaaccg ctcttccgat ctgaccactt catcgactgc aggcagat                    48


<210>  28
<211>  47
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  primer

<400>  28
tgctgaaccg ctcttccgat ctcagagctc atcgactgca ggcagat                     47


<210>  29
<211>  47
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  primer

<400>  29
tgctgaaccg ctcttccgat ctagcatgtc atcgactgca ggcagat                     47


<210>  30
<211>  47
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  primer

<400>  30
tgctgaaccg ctcttccgat cttatcgtgc atcgactgca ggcagat                     47


<210>  31
<211>  47
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  primer

<400>  31
tgctgaaccg ctcttccgat ctgtacatcc atcgactgca ggcagat                     47


<210>  32
<211>  46
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  primer

<400>  32
tgctgaaccg ctcttccgat ctattggcca tcgactgcag gcagat                      46


<210>  33
<211>  46
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  primer

<400>  33
tgctgaaccg ctcttccgat ctgatctgca tcgactgcag gcagat                      46


<210>  34
<211>  46
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  primer

<400>  34
tgctgaaccg ctcttccgat ctcgacaaca tcgactgcag gcagat                      46


<210>  35
<211>  46
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  primer

<400>  35
tgctgaaccg ctcttccgat cttcgataca tcgactgcag gcagat                      46


<210>  36
<211>  45
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  primer

<400>  36
tgctgaaccg ctcttccgat ctctgatcat cgactgcagg cagat                       45


<210>  37
<211>  45
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  primer

<400>  37
tgctgaaccg ctcttccgat ctgtacgcat cgactgcagg cagat                       45


<210>  38
<211>  44
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  primer

<400>  38
tgctgaaccg ctcttccgat ctaagccatc gactgcaggc agat                        44


<210>  39
<211>  44
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  primer

<400>  39
tgctgaaccg ctcttccgat cttacccatc gactgcaggc agat                        44


<210>  40
<211>  44
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  primer

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tgctgaaccg ctcttccgat ctgtctcatc gactgcaggc agat                        44


<210>  41
<211>  44
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  primer

<400>  41
tgctgaaccg ctcttccgat ctctaccatc gactgcaggc agat                        44


<210>  42
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<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  primer

<400>  42
aatgatacgg cgaccaccga gatctacact ctttccctac acgacgctct tccgatct         58


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<211>  61
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  primer

<400>  43
caagcagaag acggcatacg agatcggtct cggcattcct gctgaaccgc tcttccgatc       60

t                                                                       61


<210>  44
<211>  13
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  primer

<400>  44
ctgacgacct acg                                                          13


