                         SEQUENCE LISTING

<110>  REGENTS OF THE UNIVERSITY OF MINNESOTA
 
<120>  METHODS INVOLVING EDITING POLYNUCLEOTIDES THAT ENCODE T CELL 
       RECEPTOR

<130>  110.05230201

<150>  62/244,826
<151>  2015-10-22

<160>  55    

<170>  PatentIn version 3.5
10:23 AM 10/21/2016
<210>  1
<211>  149
<212>  DNA
<213>  artificial

<220>
<223>  PCR fragment

<400>  1
agcgctctcg tacagagttg gcattataat acgactcact ataggggaga atcaaaatcg       60

gtgaatgttt tagagctaga aatagcaagt taaaataagg ctagtccgtt atcaacttga      120

aaaagtggca ccgagtcggt gcttttttt                                        149


<210>  2
<211>  21
<212>  DNA
<213>  artificial

<220>
<223>  primer

<400>  2
agcgctctcg tacagagttg g                                                 21


<210>  3
<211>  23
<212>  DNA
<213>  artificial

<220>
<223>  primer

<400>  3
aaaaaaagca ccgactcggt gcc                                               23


<210>  4
<211>  100
<212>  RNA
<213>  artificial

<220>
<223>  guide RNA

<400>  4
gagaaucaaa aucggugaau guuuuagagc uagaaauagc aaguuaaaau aaggcuaguc       60

cguuaucaac uugaaaaagu ggcaccgagu cggugcuuuu                            100


<210>  5
<211>  100
<212>  RNA
<213>  artificial

<220>
<223>  modified guideRNA


<220>
<221>  misc_feature
<222>  (1)..(1)
<223>  2'OMe

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (1)..(2)
<223>  phosphorothioate

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (2)..(3)
<223>  phosphorothioate

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (97)..(97)
<223>  2'OMe

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (97)..(98)
<223>  phosphorothioate

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (98)..(99)
<223>  phosphorothioate

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (99)..(100)
<223>  phosphorothioate

<400>  5
gagaaucaaa aucggugaau guuuuagagc uagaaauagc aaguuaaaau aaggcuaguc       60

cguuaucaac uugaaaaagu ggcaccgagu cggugcuuuu                            100


<210>  6
<211>  20
<212>  DNA
<213>  artificial

<220>
<223>  primer

<400>  6
atcacgagca gctggtttct                                                   20


<210>  7
<211>  20
<212>  DNA
<213>  artificial

<220>
<223>  primer

<400>  7
cccgtgtcat tctctggact                                                   20


<210>  8
<211>  19
<212>  DNA
<213>  artificial

<220>
<223>  primer

<400>  8
aagcaaggcc agtttctca                                                    19


<210>  9
<211>  21
<212>  DNA
<213>  artificial

<220>
<223>  primer

<400>  9
ttaggatgtg cccaggttat g                                                 21


<210>  10
<211>  20
<212>  DNA
<213>  artificial

<220>
<223>  primer

<400>  10
agctctagga cgatgaggga                                                   20


<210>  11
<211>  20
<212>  DNA
<213>  artificial

<220>
<223>  primer

<400>  11
cctatcccac cagcatccaa                                                   20


<210>  12
<211>  20
<212>  DNA
<213>  artificial

<220>
<223>  primer

<400>  12
cagcatcagc actgcacttt                                                   20


<210>  13
<211>  20
<212>  DNA
<213>  artificial

<220>
<223>  primer

<400>  13
tgctgtaggg cctggtttac                                                   20


<210>  14
<211>  20
<212>  DNA
<213>  artificial

<220>
<223>  primer

<400>  14
ctgcttccat cttgcctcac                                                   20


<210>  15
<211>  20
<212>  DNA
<213>  artificial

<220>
<223>  primer

<400>  15
tatccccagc acccagtaag                                                   20


<210>  16
<211>  25
<212>  DNA
<213>  artificial

<220>
<223>  primer

<400>  16
tccattgtgt aatgaagatg atttg                                             25


<210>  17
<211>  23
<212>  DNA
<213>  artificial

<220>
<223>  primer

<400>  17
tgcaacaaaa taggaacacc ttt                                               23


<210>  18
<211>  23
<212>  DNA
<213>  artificial

<220>
<223>  primer

<400>  18
tgcctatatt ttcttctgtg aga                                               23


<210>  19
<211>  21
<212>  DNA
<213>  artificial

<220>
<223>  primer

<400>  19
agacctagaa ttgccaaaac a                                                 21


<210>  20
<211>  20
<212>  DNA
<213>  artificial

<220>
<223>  primer

<400>  20
tggtcaagtg tcgagtttgt                                                   20


<210>  21
<211>  20
<212>  DNA
<213>  artificial

<220>
<223>  primer

<400>  21
atccagtcac cttccaccag                                                   20


<210>  22
<211>  20
<212>  DNA
<213>  artificial

<220>
<223>  primer

<400>  22
aggccatagt cacccaaaca                                                   20


<210>  23
<211>  20
<212>  DNA
<213>  artificial

<220>
<223>  primer

<400>  23
ttgggttctt ggtcacgaag                                                   20


<210>  24
<211>  26
<212>  DNA
<213>  artificial

<220>
<223>  primer

<400>  24
gccgaggagt cttgtaaatg taatgg                                            26


<210>  25
<211>  25
<212>  DNA
<213>  artificial

<220>
<223>  primer

<400>  25
tcacttgtca attaatccag cttcc                                             25


<210>  26
<211>  24
<212>  DNA
<213>  artificial

<220>
<223>  primer

<400>  26
tacctcggta cgaaaccaca cagg                                              24


<210>  27
<211>  39
<212>  DNA
<213>  artificial

<220>
<223>  polynucleotide

<400>  27
aaatccagtg acaagtctgt ctgcctattc accgatttt                              39


<210>  28
<211>  55
<212>  DNA
<213>  artificial

<220>
<223>  polynucleotide

<400>  28
tatggacttc aagagcaaca gtgctgtggc ctggagcaac aaatctgact ttgca            55


<210>  29
<211>  55
<212>  DNA
<213>  artificial

<220>
<223>  polynucleotide

<400>  29
atacctgaag ttctcgttgt cacgacaccg gacctcgttg tttagactga aacgt            55


<210>  30
<211>  39
<212>  DNA
<213>  artificial

<220>
<223>  polynucleotide

<400>  30
gaagcaagga gcaccaaagt atgcctattc tacaagaaa                              39


<210>  31
<211>  39
<212>  DNA
<213>  artificial

<220>
<223>  polynucleotide

<400>  31
ggcattacat aatgataaag tgtcctattc aacaagaaa                              39


<210>  32
<211>  20
<212>  DNA
<213>  artificial

<220>
<223>  nuclease sequence

<400>  32
tgtctgccta ttcaccgatt                                                   20


<210>  33
<211>  17
<212>  DNA
<213>  artificial

<220>
<223>  nuclease sequence

<400>  33
ttgtcccaca gatatcc                                                      17


<210>  34
<211>  39
<212>  DNA
<213>  artificial

<220>
<223>  MT sequence

<400>  34
aaatccagtg acaagtctgt ctgcctattc accgatttt                              39


<210>  35
<211>  101
<212>  DNA
<213>  Homo sapiens

<400>  35
ttgtcccaca gatatccaga accctgaccc tgccgtgtac cagctgagag actctaaatc       60

cagtgacaag tctgtctgcc tattcaccga ttttgattct c                          101


<210>  36
<211>  101
<212>  DNA
<213>  Homo sapiens

<400>  36
aacagggtgt ctataggtct tgggactggg acggcacatg gtcgactctc tgagatttag       60

gtcactgttc agacagacgg ataagtggct aaaactaaga g                          101


<210>  37
<211>  17
<212>  DNA
<213>  artificial

<220>
<223>  nuclease sequence

<400>  37
ggcacatggt cgactct                                                      17


<210>  38
<211>  23
<212>  DNA
<213>  artificial

<220>
<223>  CRISPR/Cas9 sequence

<400>  38
ggataagtgg ctaaaactaa gag                                               23


<210>  39
<211>  20
<212>  DNA
<213>  artificial

<220>
<223>  nuclease sequence

<400>  39
aatgtgtcac aaagtaagga                                                   20


<210>  40
<211>  22
<212>  DNA
<213>  artificial

<220>
<223>  TALEN sequence

<400>  40
tatggacttc aagagcaaca gt                                                22


<210>  41
<211>  15
<212>  DNA
<213>  artificial

<220>
<223>  nuclease sequence

<400>  41
gactttgcat gtgca                                                        15


<210>  42
<211>  42
<212>  DNA
<213>  Homo sapiens

<400>  42
aatgtgtcac aaagtaagga ttctgatgtg tatatcacag ac                          42


<210>  43
<211>  61
<212>  DNA
<213>  Homo sapiens

<400>  43
atacctgaag ttctcgttgt cacgacaccg gacctcgttg tttagactga aacgtacacg       60

t                                                                       61


<210>  44
<211>  18
<212>  DNA
<213>  artificial

<220>
<223>  TALEN sequence

<400>  44
ttgtttagac tgaaacgt                                                     18


<210>  45
<211>  19
<212>  DNA
<213>  artificial

<220>
<223>  nuclease sequence

<400>  45
acgacaccgg acctcgttg                                                    19


<210>  46
<211>  90
<212>  DNA
<213>  artificial

<220>
<223>  polynucleotide

<400>  46
tagctgaagc tccagggtaa ggtgaaaatt cagttacagg aggagacccc cgaacagggt       60

gagatattag agaagtaaaa gagctggatc                                        90


<210>  47
<211>  89
<212>  RNA
<213>  artificial

<220>
<223>  polynucleotide

<400>  47
guuuuagagc uagaaauagc aaguaaaaua aggcuagucc guuaucaacu ugaaaaaagu       60

gaguggcacc gagucggugg ugcuuuuuu                                         89


<210>  48
<211>  23
<212>  DNA
<213>  artificial

<220>
<223>  guide RNA target sequence

<400>  48
cctattcacc gattttgatt ctc                                               23


<210>  49
<211>  23
<212>  DNA
<213>  artificial

<220>
<223>  guide RNA

<400>  49
ggataagtgg ctaaaactaa gag                                               23


<210>  50
<211>  20
<212>  DNA
<213>  artificial

<220>
<223>  polynucleotide

<400>  50
taagtggcta aaactaagag                                                   20


<210>  51
<211>  61
<212>  DNA
<213>  Homo sapiens

<400>  51
tatggacttc aagagcaaca gtgctgtggc ctggagcaac aaatctgact ttgcatgtgc       60

a                                                                       61


<210>  52
<211>  310
<212>  DNA
<213>  Kunjin virus

<400>  52
ctgcttactg gcttatcgaa attaatacga ctcactatag ggaaggcaaa actaacatga       60

aacaaggcta aaagtcagat cggcgaaagt cgccacttcg ccgaggagtg caatctgtga      120

ggccccagga ggactgggtg ttcactgccg tataggcagg agaatcaaaa tcggtgaatg      180

tttaagagct atgctggaaa cagcatagca agtttaaata aggctagtcc gttatcaact      240

tgaaaaagtg gcaccgagtc ggtgcttttt ttgtttaaac ccgctgatca gcctcgactg      300

tgccttctag                                                             310


<210>  53
<211>  314
<212>  DNA
<213>  Kunjin virus

<400>  53
ctgcttactg gcttatcgaa attaatacga ctcactatag ggagccaagg caaaactaac       60

atgaaacaag gctaaaagtc agatcggcga aagtcgccac ttcgccgagg agtgcaatct      120

gtgaggcccc aggaggactg ggtgttcact gccgtatagg caggagaatc aaaatcggtg      180

aatgtttaag agctatgctg gaaacagcat agcaagttta aataaggcta gtccgttatc      240

aacttgaaaa agtggcaccg agtcggtgct ttttttgttt aaacccgctg atcagcctcg      300

actgtgcctt ctag                                                        314


<210>  54
<211>  451
<212>  DNA
<213>  Dengue virus

<400>  54
ctgcttactg gcttatcgaa attaatacga ctcactatag ggaaggcaaa actaacatga       60

aacaaggcta aaaacatgaa acaaggctaa aagtcaggtc ggatcaagcc atagtacgga      120

aaaaactatg ctacctgtga gccccgtcca aggacgttaa aagaagtcag gccatcacaa      180

atgccacagc ttgagtaaac tgtgcagcct gtagctccac ctgagaaggt gtaaaaaatc      240

tgggaggcca caaaccatgg aagctgtacg catggcgtag gttcactgcc gtataggcag      300

gagaatcaaa atcggtgaat gtttaagagc tatgctggaa acagcatagc aagtttaaat      360

aaggctagtc cgttatcaac ttgaaaaagt ggcaccgagt cggtgctttt tttgtttaaa      420

cccgctgatc agcctcgact gtgccttcta g                                     451


<210>  55
<211>  462
<212>  DNA
<213>  Dengue virus

<400>  55
ctgcttactg gcttatcgaa attaatacga ctcactatag ggataatttc tggaaggcaa       60

aactaacatg aaacaaggct aaaaacatga aacaaggcta aaagtcaggt cggatcaagc      120

catagtacgg aaaaaactat gctacctgtg agccccgtcc aaggacgtta aaagaagtca      180

ggccatcaca aatgccacag cttgagtaaa ctgtgcagcc tgtagctcca cctgagaagg      240

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