                         SEQUENCE LISTING

<110>  University of Notre Dame
 
<120>  A METHOD AND COMPOSITION FOR DETECTION OF ONCOGENIC HPV

<130>  UND-023707 WO ORD

<150>  US 61/867,380
<151>  2013-08-19

<150>  US 61/942,485
<151>  2014-02-20

<160>  29    

<170>  PatentIn version 3.5

<210>  1
<211>  23
<212>  RNA
<213>  Homo sapiens

<400>  1
ucuuugguua ucuagcugua uga                                               23


<210>  2
<211>  23
<212>  RNA
<213>  Homo sapiens

<400>  2
caaagugcuc auagugcagg uag                                               23


<210>  3
<211>  22
<212>  RNA
<213>  Homo sapiens

<400>  3
cauugcacuu gucucggucu ga                                                22


<210>  4
<211>  23
<212>  RNA
<213>  Homo sapiens

<400>  4
caaagugcug uucgugcagg uag                                               23


<210>  5
<211>  21
<212>  RNA
<213>  Homo sapiens

<400>  5
uaaagugcug acagugcaga u                                                 21


<210>  6
<211>  21
<212>  RNA
<213>  Homo sapiens

<400>  6
agcuacaucu ggcuacuggg u                                                 21


<210>  7
<211>  22
<212>  RNA
<213>  Homo sapiens

<400>  7
aaaagcuggg uugagagggc ga                                                22


<210>  8
<211>  23
<212>  RNA
<213>  Homo sapiens

<400>  8
cgcauccccu agggcauugg ugu                                               23


<210>  9
<211>  22
<212>  RNA
<213>  Homo sapiens

<400>  9
aauugcacgg uauccaucug ua                                                22


<210>  10
<211>  22
<212>  RNA
<213>  Homo sapiens

<400>  10
ucguaccgug aguaauaaug cg                                                22


<210>  11
<211>  21
<212>  RNA
<213>  Homo sapiens

<400>  11
ugagaugaag cacuguagcu c                                                 21


<210>  12
<211>  23
<212>  RNA
<213>  Homo sapiens

<400>  12
guccaguuuu cccaggaauc ccu                                               23


<210>  13
<211>  22
<212>  RNA
<213>  Homo sapiens

<400>  13
acaguagucu gcacauuggu ua                                                22


<210>  14
<211>  23
<212>  RNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  miR-9-5p primer

<400>  14
ucauacagcu agauaaccaa aga                                               23


<210>  15
<211>  22
<212>  RNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  miR-20b-5p primer

<400>  15
cuaccugcac uaugagcauu ug                                                22


<210>  16
<211>  22
<212>  RNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  miR-25-3p primer

<400>  16
ucagaccgag acaagugcaa ug                                                22


<210>  17
<211>  23
<212>  RNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  miR-93-5p primer

<400>  17
cuaccugcac gaacagcacu uug                                               23


<210>  18
<211>  21
<212>  RNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  miR-106b-5p primer

<400>  18
aucugcacug ucagcacuuu a                                                 21


<210>  19
<211>  21
<212>  RNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  miR-222-3p primer

<400>  19
acccaguagc cagauguagc u                                                 21


<210>  20
<211>  22
<212>  RNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  miR-320a primer

<400>  20
ucgcccucuc aacccagcuu uu                                                22


<210>  21
<211>  23
<212>  RNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  miR-324-5p primer

<400>  21
acaccaaugc ccuaggggau gcg                                               23


<210>  22
<211>  22
<212>  RNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  miR-363-3p primer

<400>  22
uacagaugga uaccgugcaa uu                                                22


<210>  23
<211>  22
<212>  RNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  miR-126-3p primer

<400>  23
cgcauuauua cucacgguac ga                                                22


<210>  24
<211>  21
<212>  RNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  miR-143-3p primer

<400>  24
gagcuacagu gcuucaucuc a                                                 21


<210>  25
<211>  23
<212>  RNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  miR-145 5p primer

<400>  25
agggauuccu gggaaaacug gac                                               23


<210>  26
<211>  22
<212>  RNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  miR-100a-3p primer

<400>  26
uaaccaaugu gcagacuacu gu                                                22


<210>  27
<211>  23
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  LNA probe

<400>  27
tcatacagct agataaccaa aga                                               23


<210>  28
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  LNA probe

<400>  28
atctgcactg tcagcacttt a                                                 21


<210>  29
<211>  23
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  LNA probe

<400>  29
gaacaggtag tctgaacact ggg                                               23


