                         SEQUENCE LISTING

<110>  NEW YORK UNIVERSITY
 
<120>  METHODS FOR MANIPULATING IMMUNE RESPONSES BY ALTERING MICROBIOTA

<130>  243735.123

<150>  61/833,356
<151>  2013-06-10

<150>  61/926,046
<151>  2014-01-10

<160>  57    

<170>  PatentIn version 3.5

<210>  1
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  1
caacaacccc tttgccaaag                                                   20


<210>  2
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  2
tcccccaagc agttgacagt                                                   20


<210>  3
<211>  19
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  3
agaaccggcc ccttatgaa                                                    19


<210>  4
<211>  18
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  4
agttcgcgca ggatgtcc                                                     18


<210>  5
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  5
cacccaggaa agacagcaac c                                                 21


<210>  6
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  6
gcaagagctc ttgtccattg a                                                 21


<210>  7
<211>  18
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  7
ccgctgagag ggcttcac                                                     18


<210>  8
<211>  22
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  8
tgcaggagta ggccacatta ca                                                22


<210>  9
<211>  25
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  9
gatgcattca tgagtattgc caagt                                             25


<210>  10
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  10
gtggaccact cggatgagct c                                                 21


<210>  11
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  11
tcggcatttt gaacgagctc                                                   20


<210>  12
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  12
gaaaagcccg aaagagtctc                                                   20


<210>  13
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  13
atgacatgaa ccgacccttc                                                   20


<210>  14
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  14
tgtgttggtt gtagagggca                                                   20


<210>  15
<211>  15
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  15
atgcctggct cagac                                                        15


<210>  16
<211>  19
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  16
gtcctgcatt aaggagtcg                                                    19


<210>  17
<211>  22
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  17
cagcagcgat catccctcaa ag                                                22


<210>  18
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  18
caggaccagg atctcttgct g                                                 21


<210>  19
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  19
gagttcatgg tgctgtcttc c                                                 21


<210>  20
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  20
gagttcatgg tgctgtcttc c                                                 21


<210>  21
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  21
catgcaggag gtggtacctt                                                   20


<210>  22
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  22
cagacgcaag catttctcag                                                   20


<210>  23
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  23
aggtgttggc attctcacaa g                                                 21


<210>  24
<211>  23
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  24
gcttatcatg tttacaggtt ccc                                               23


<210>  25
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  25
tcaggtgcaa ggtgaagttg                                                   20


<210>  26
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  26
ggccactgtt accactgctt                                                   20


<210>  27
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  27
aaggaagctc tcagtcgtca a                                                 21


<210>  28
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  28
gagtcaggtt tcctggtcga g                                                 21


<210>  29
<211>  26
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  29
gaactttgta taccatttgt cagacg                                            26


<210>  30
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  30
ctgggtggca gtaacaacct                                                   20


<210>  31
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  31
agtaaccgag gcctgtcctt                                                   20


<210>  32
<211>  19
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  32
gtcactcggc aactcagga                                                    19


<210>  33
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  33
catcaccggt cagaaaacaa                                                   20


<210>  34
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  34
gtcaccatgg ccaatgtagg                                                   20


<210>  35
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  35
tcagaacttc agtggctgga                                                   20


<210>  36
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  36
gaggccaatt ttgtctccac                                                   20


<210>  37
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  37
tggtgaaggt cggtgtgaac                                                   20


<210>  38
<211>  24
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  38
ccatgtagtt gaggtcaatg aacg                                              24


<210>  39
<211>  60
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  39
aatgatacgg cgaccaccga gatctacact atggtaattg tgtgccagcm gccgcggtaa       60


<210>  40
<211>  68
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer


<220>
<221>  misc_feature
<222>  (25)..(36)
<223>  n is a, c, g, or t

<400>  40
caagcagaag acggcatacg agatnnnnnn nnnnnnagtc agtcagccgg actachvggg       60

twtctaat                                                                68


<210>  41
<211>  31
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  41
tatggtaatt gtgtgccagc mgccgcggta a                                      31


<210>  42
<211>  32
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  42
agtcagtcag ccggactach vgggtwtcta at                                     32


<210>  43
<211>  32
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  43
attagawacc cbdgtagtcc ggctgactga ct                                     32


<210>  44
<211>  24
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  44
gaaggaagct aactggaaaa actc                                              24


<210>  45
<211>  22
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  45
caggccccca gcacaaccta ct                                                22


<210>  46
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  46
tggctggaaa gatggagaca a                                                 21


<210>  47
<211>  22
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  47
aaagctctct cttgcatcac tg                                                22


<210>  48
<211>  23
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  48
tgccatcatt ctttgcatct tga                                               23


<210>  49
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  49
ccgtgaactt ctgaacagcc t                                                 21


<210>  50
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  50
cattcgaacg tctgccctat                                                   20


<210>  51
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  51
cctccaatgg atcctcgtta                                                   20


<210>  52
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  52
gacgctgagg catgagagca t                                                 21


<210>  53
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  53
gacggcacgg attgttattc a                                                 21


<210>  54
<211>  19
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  54
gtgccagcmg ccgcggtaa                                                    19


<210>  55
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  55
ggactachvg ggtwtctaat                                                   20


<210>  56
<211>  17
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  56
ctcctggaaa cgggtgg                                                      17


<210>  57
<211>  22
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  57
ggtgttcttc ccgatatcta ca                                                22


