                         SEQUENCE LISTING

<110>  The Board of Trustees of the Leland Stanford Junior 
       University
 
<120>  MICRO RNAS TO TREAT STROKE, ISCHEMIC BRAIN INJURY, TRAUMATIC 
       BRAIN INJURY, AND NEURODEGENERATIVE DISEASE

<130>  S10-467

<160>  122   

<170>  PatentIn version 3.5

<210>  1
<211>  23
<212>  RNA
<213>  Mus musculus

<400>  1
aacauucaac gcugucggug agu                                               23


<210>  2
<211>  23
<212>  RNA
<213>  Mus musculus

<400>  2
aacauucauu gcugucggug ggu                                               23


<210>  3
<211>  22
<212>  RNA
<213>  Mus musculus

<400>  3
aacauucaac cugucgguga gu                                                22


<210>  4
<211>  23
<212>  RNA
<213>  Mus musculus

<400>  4
aacauucauu guugucggug ggu                                               23


<210>  5
<211>  23
<212>  RNA
<213>  Artificial

<220>
<223>  miR-181a seed mutant

<400>  5
auguuaguac gcugucggug agu                                               23


<210>  6
<211>  23
<212>  RNA
<213>  Artificial

<220>
<223>  miR-181b seed mutant

<400>  6
auguaaguuu gcugucggug ggu                                               23


<210>  7
<211>  22
<212>  RNA
<213>  Artificial

<220>
<223>  miR-181c seed mutant

<400>  7
aagugaguuc cugucgguga gu                                                22


<210>  8
<211>  23
<212>  RNA
<213>  Artificial

<220>
<223>  miR-181d seed mutant

<400>  8
auguaaguau guugucggug ggu                                               23


<210>  9
<211>  23
<212>  RNA
<213>  Artificial

<220>
<223>  miR-181a Antagomir


<220>
<221>  modified_base
<222>  (1)..(1)
<223>  am

<220>
<221>  modified_base
<222>  (2)..(2)
<223>  cm

<220>
<221>  modified_base
<222>  (3)..(3)
<223>  um

<220>
<221>  modified_base
<222>  (4)..(4)
<223>  cm

<220>
<221>  modified_base
<222>  (5)..(5)
<223>  am

<220>
<221>  modified_base
<222>  (6)..(7)
<223>  cm

<220>
<221>  modified_base
<222>  (8)..(8)
<223>  gm

<220>
<221>  modified_base
<222>  (9)..(9)
<223>  am

<220>
<221>  modified_base
<222>  (10)..(10)
<223>  cm

<220>
<221>  modified_base
<222>  (11)..(11)
<223>  am

<220>
<221>  modified_base
<222>  (12)..(12)
<223>  gm

<220>
<221>  modified_base
<222>  (13)..(13)
<223>  cm

<220>
<221>  modified_base
<222>  (14)..(14)
<223>  gm

<220>
<221>  modified_base
<222>  (15)..(16)
<223>  um

<220>
<221>  modified_base
<222>  (17)..(17)
<223>  gm

<220>
<221>  modified_base
<222>  (18)..(19)
<223>  am

<220>
<221>  modified_base
<222>  (20)..(20)
<223>  um

<220>
<221>  modified_base
<222>  (21)..(21)
<223>  gm

<220>
<221>  modified_base
<222>  (22)..(23)
<223>  um

<400>  9
acucaccgac agcguugaau guu                                               23


<210>  10
<211>  23
<212>  RNA
<213>  Artificial

<220>
<223>  miR-181a Mismatch


<220>
<221>  modified_base
<222>  (1)..(1)
<223>  am

<220>
<221>  modified_base
<222>  (2)..(2)
<223>  gm

<220>
<221>  modified_base
<222>  (3)..(3)
<223>  um

<220>
<221>  modified_base
<222>  (4)..(4)
<223>  cm

<220>
<221>  modified_base
<222>  (5)..(5)
<223>  am

<220>
<221>  modified_base
<222>  (6)..(6)
<223>  gm

<220>
<221>  modified_base
<222>  (7)..(7)
<223>  cm

<220>
<221>  modified_base
<222>  (8)..(8)
<223>  gm

<220>
<221>  modified_base
<222>  (9)..(9)
<223>  am

<220>
<221>  modified_base
<222>  (10)..(10)
<223>  gm

<220>
<221>  modified_base
<222>  (11)..(11)
<223>  am

<220>
<221>  modified_base
<222>  (12)..(12)
<223>  gm

<220>
<221>  modified_base
<222>  (13)..(14)
<223>  cm

<220>
<221>  modified_base
<222>  (15)..(16)
<223>  um

<220>
<221>  modified_base
<222>  (17)..(17)
<223>  gm

<220>
<221>  modified_base
<222>  (18)..(18)
<223>  am

<220>
<221>  modified_base
<222>  (19)..(20)
<223>  um

<220>
<221>  modified_base
<222>  (21)..(21)
<223>  gm

<220>
<221>  modified_base
<222>  (22)..(23)
<223>  um

<400>  10
agucagcgag agccuugauu guu                                               23


<210>  11
<211>  19
<212>  DNA
<213>  Artificial

<220>
<223>  BCL2 PCR forward primer

<400>  11
tcaggcaaat ggtcgaatc                                                    19


<210>  12
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial

<220>
<223>  BCL2 PCR reverse primer

<400>  12
caagaagcag cttgaaggag                                                   20


<210>  13
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial

<220>
<223>  BCL2L11 PCR forward primer

<400>  13
gtcatgtccc tctcttggtg                                                   20


<210>  14
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Artificial

<220>
<223>  BCL2L11 PCR reverse primer

<400>  14
gtcctaccaa aaacgagaga g                                                 21


<210>  15
<211>  23
<212>  DNA
<213>  Artificial

<220>
<223>  MCL1 PCR forward primer

<400>  15
gaacataaga gggaagtctt gga                                               23


<210>  16
<211>  24
<212>  DNA
<213>  Artificial

<220>
<223>  MCL1 PCR reverse primer

<400>  16
gggttattta ggttcaaagt tttg                                              24


<210>  17
<211>  15
<212>  RNA
<213>  Mus musculus

<400>  17
cguuggaaug uacuu                                                        15


<210>  18
<211>  15
<212>  RNA
<213>  Mus musculus

<400>  18
uguugugaau guaaa                                                        15


<210>  19
<211>  15
<212>  RNA
<213>  Mus musculus

<400>  19
gacuaagaau guaau                                                        15


<210>  20
<211>  15
<212>  RNA
<213>  Artificial

<220>
<223>  BCL2 3' UTR seed mutant

<400>  20
cguugcuuac aacuu                                                        15


<210>  21
<211>  15
<212>  RNA
<213>  Artificial

<220>
<223>  BCL2L11 3' UTR seed mutant

<400>  21
uguugacuua caaaa                                                        15


<210>  22
<211>  15
<212>  RNA
<213>  Artificial

<220>
<223>  MCL1 3' UTR seed mutant

<400>  22
gacuaacuua caaau                                                        15


<210>  23
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial

<220>
<223>  HSPA5 3' UTR PCR forward primer

<400>  23
gtgcactgat ctgctagagc                                                   20


<210>  24
<211>  32
<212>  DNA
<213>  Artificial

<220>
<223>  HSPA5 3' UTR PCR reverse primer

<400>  24
cttaaatttt agttatctaa aataaaagat gg                                     32


<210>  25
<211>  27
<212>  DNA
<213>  Artificial

<220>
<223>  HSPA9 3' UTR PCR forward primer

<400>  25
taatagcaga aattttgaag ccagaag                                           27


<210>  26
<211>  22
<212>  DNA
<213>  Artificial

<220>
<223>   HSPA9 3' UTR PCR reverse primer

<400>  26
ggaacccaga tttctttccc ta                                                22


<210>  27
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial

<220>
<223>  HSPA1A 3' UTR PCR forward primer

<400>  27
tagaggcctc tgctggctct                                                   20


<210>  28
<211>  27
<212>  DNA
<213>  Artificial

<220>
<223>  HSPA1A 3' UTR PCR reverse primer

<400>  28
tggcaagtga ttttgaagtt tattttc                                           27


<210>  29
<211>  15
<212>  RNA
<213>  Mus musculus

<400>  29
gucucgaaug uaauu                                                        15


<210>  30
<211>  15
<212>  RNA
<213>  Artificial

<220>
<223>  Mutant HSPA5 3' UTR with 6 substitutions

<400>  30
gucuccuuac aaauu                                                        15


<210>  31
<211>  22
<212>  RNA
<213>  Mus musculus

<400>  31
uagcaccauc ugaaaucggu ua                                                22


<210>  32
<211>  23
<212>  RNA
<213>  Mus musculus

<400>  32
uagcaccauu ugaaaucagu guu                                               23


<210>  33
<211>  22
<212>  RNA
<213>  Mus musculus

<400>  33
uagcaccauu ugaaaucggu ua                                                22


<210>  34
<211>  22
<212>  RNA
<213>  Artificial

<220>
<223>  miR-29a seed mutant

<400>  34
uuugugguuc ugaaaucggu ua                                                22


<210>  35
<211>  23
<212>  RNA
<213>  Artificial

<220>
<223>  miR-29b seed mutant

<400>  35
uuugugguuu ugaaaucagu guu                                               23


<210>  36
<211>  22
<212>  RNA
<213>  Artificial

<220>
<223>  miR-29C seed mutant

<400>  36
uuugugguuu ugaaaucggu ua                                                22


<210>  37
<211>  23
<212>  RNA
<213>  Mus musculus

<400>  37
auugcauggu gcuagugggc ccu                                               23


<210>  38
<211>  22
<212>  RNA
<213>  Mus musculus

<400>  38
ggcugcuggu gcuggcugcc cg                                                22


<210>  39
<211>  22
<212>  RNA
<213>  Mus musculus

<400>  39
ggccccuggu gcuucccccc cu                                                22


<210>  40
<211>  23
<212>  RNA
<213>  Mus musculus

<400>  40
agacauuggu gcuauaauga aga                                               23


<210>  41
<211>  22
<212>  RNA
<213>  Mus musculus

<400>  41
ucccaaggug cuaacauugc ug                                                22


<210>  42
<211>  23
<212>  RNA
<213>  Mus musculus

<400>  42
uaaccauggu gcuauucacu ggg                                               23


<210>  43
<211>  23
<212>  RNA
<213>  Artificial

<220>
<223>  BAK1 3' UTR seed mutant

<400>  43
auugcaacca cgaugugggc ccu                                               23


<210>  44
<211>  22
<212>  RNA
<213>  Artificial

<220>
<223>  BBC3-1 3' UTR seed mutant

<400>  44
ggcugcacca cgaggcugcc cg                                                22


<210>  45
<211>  22
<212>  RNA
<213>  Artificial

<220>
<223>  BBC3-2 3'UTR seed mutant

<400>  45
ggccccacca cgaucccccc cu                                                22


<210>  46
<211>  23
<212>  RNA
<213>  Artificial

<220>
<223>  BMF 3' UTR seed mutant

<400>  46
agacauacca cgauuaauga aga                                               23


<210>  47
<211>  22
<212>  RNA
<213>  Artificial

<220>
<223>  BCL2L2 3' UTR seed mutant

<400>  47
ucccaaccac gauacauugc ug                                                22


<210>  48
<211>  23
<212>  RNA
<213>  Artificial

<220>
<223>  MCL1 3' UTR seed mutant

<400>  48
uaaccaacca cgauuucacu ggg                                               23


<210>  49
<211>  19
<212>  DNA
<213>  Artificial

<220>
<223>  BAK1 PCrR forward primer

<400>  49
ctcccaaggg tgccctttg                                                    19


<210>  50
<211>  19
<212>  DNA
<213>  Artificial

<220>
<223>  BAK1 PCR reverse primer

<400>  50
cagggtgagg ggattgcac                                                    19


<210>  51
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Artificial

<220>
<223>  BBC3 PCR forward primer

<400>  51
actttttctg caccatgtag c                                                 21


<210>  52
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Artificial

<220>
<223>  BBC3 PCR reverse primer

<400>  52
tgtccttaca ggtagtgcca g                                                 21


<210>  53
<211>  23
<212>  DNA
<213>  Artificial

<220>
<223>  BMF PCR forward primer

<400>  53
gatacaggaa gaagctagga ctg                                               23


<210>  54
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial

<220>
<223>  BMF PCR reverse primer

<400>  54
catcaggatg tgcagcctag                                                   20


<210>  55
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial

<220>
<223>  BCL2L2 PCR forward primer

<400>  55
gaccattcca gctctgagtc                                                   20


<210>  56
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Artificial

<220>
<223>  BCL2L2 PCR reverse primer

<400>  56
agtgcaacct tctctcaaaa g                                                 21


<210>  57
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial

<220>
<223>  MCL1 PCR forward primer

<400>  57
ttgtgagtgc aataggggac                                                   20


<210>  58
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Artificial

<220>
<223>  MCL1 PCR reverse primer

<400>  58
cattaacttg cagttggtcc t                                                 21


<210>  59
<211>  12
<212>  RNA
<213>  Homo sapiens

<400>  59
uuuggaaugu ac                                                           12


<210>  60
<211>  13
<212>  RNA
<213>  Homo sapiens

<400>  60
guugugaaug uaa                                                          13


<210>  61
<211>  14
<212>  RNA
<213>  Homo sapiens

<400>  61
cuaagaaugu aaug                                                         14


<210>  62
<211>  12
<212>  RNA
<213>  Pan troglodytes

<400>  62
uuuggaaugu ac                                                           12


<210>  63
<211>  13
<212>  RNA
<213>  Pan troglodytes

<400>  63
guugugaaug uaa                                                          13


<210>  64
<211>  14
<212>  RNA
<213>  Pan troglodytes

<400>  64
cuaagaaugu aaug                                                         14


<210>  65
<211>  12
<212>  RNA
<213>  Macaca mulatta

<400>  65
uuucgaaugu ac                                                           12


<210>  66
<211>  13
<212>  RNA
<213>  Macaca mulatta

<400>  66
cuugugaaug uaa                                                          13


<210>  67
<211>  14
<212>  RNA
<213>  Macaca mulatta

<400>  67
cuaagaaugu aaug                                                         14


<210>  68
<211>  12
<212>  RNA
<213>  Mus musculus

<400>  68
guuggaaugu ac                                                           12


<210>  69
<211>  13
<212>  RNA
<213>  Mus musculus

<400>  69
guugugaaug uaa                                                          13


<210>  70
<211>  14
<212>  RNA
<213>  Mus musculus

<400>  70
cuaagaaugu aaua                                                         14


<210>  71
<211>  12
<212>  RNA
<213>  Rattus norvegicus

<400>  71
guuggaaugu ac                                                           12


<210>  72
<211>  13
<212>  RNA
<213>  Rattus norvegicus

<400>  72
guugugaaug uaa                                                          13


<210>  73
<211>  12
<212>  RNA
<213>  Cambarellus patzcuarensis

<400>  73
uuuagaaugu ac                                                           12


<210>  74
<211>  13
<212>  RNA
<213>  Cambarellus patzcuarensis

<400>  74
guugugaaug uaa                                                          13


<210>  75
<211>  14
<212>  RNA
<213>  Cambarellus patzcuarensis

<400>  75
caaagaaugu aaca                                                         14


<210>  76
<211>  12
<212>  RNA
<213>  Oncorhynchus

<400>  76
uuuggaaugu ac                                                           12


<210>  77
<211>  13
<212>  RNA
<213>  Oncorhynchus

<400>  77
guccugaaug uaa                                                          13


<210>  78
<211>  14
<212>  RNA
<213>  Oncorhynchus

<400>  78
ccaggaaugu aaug                                                         14


<210>  79
<211>  12
<212>  RNA
<213>  Scatophagus argus

<400>  79
uuuggaaugu ac                                                           12


<210>  80
<211>  13
<212>  RNA
<213>  Scatophagus argus

<400>  80
guugugaaug uaa                                                          13


<210>  81
<211>  14
<212>  RNA
<213>  Scatophagus argus

<400>  81
cuaagaaugu aaua                                                         14


<210>  82
<211>  12
<212>  RNA
<213>  Euonymus europaeus

<400>  82
guuggaaugu au                                                           12


<210>  83
<211>  13
<212>  RNA
<213>  Euonymus europaeus

<400>  83
guugugaaug uaa                                                          13


<210>  84
<211>  14
<212>  RNA
<213>  Euonymus europaeus

<400>  84
cuaagaaugu aaua                                                         14


<210>  85
<211>  12
<212>  RNA
<213>  Canis familiaris

<400>  85
uuuggaaugu ac                                                           12


<210>  86
<211>  13
<212>  RNA
<213>  Canis familiaris

<400>  86
guugugaaug uaa                                                          13


<210>  87
<211>  14
<212>  RNA
<213>  Canis familiaris

<400>  87
cuaagaaugu aaua                                                         14


<210>  88
<211>  12
<212>  RNA
<213>  Felis catus

<400>  88
uucagaaugu ac                                                           12


<210>  89
<211>  13
<212>  RNA
<213>  Felis catus

<400>  89
guugugaaug uaa                                                          13


<210>  90
<211>  14
<212>  RNA
<213>  Felis catus

<400>  90
cuaagaaugu aaua                                                         14


<210>  91
<211>  12
<212>  RNA
<213>  Equus caballus

<400>  91
uuuggaaugu ac                                                           12


<210>  92
<211>  13
<212>  RNA
<213>  Equus caballus

<400>  92
guugugaaug uaa                                                          13


<210>  93
<211>  14
<212>  RNA
<213>  Equus caballus

<400>  93
cuaagaaugu aaua                                                         14


<210>  94
<211>  12
<212>  RNA
<213>  Dendragapus obscurus

<400>  94
uucggaaugu ac                                                           12


<210>  95
<211>  12
<212>  RNA
<213>  Dendragapus obscurus

<400>  95
uucggaaugu ac                                                           12


<210>  96
<211>  13
<212>  RNA
<213>  Dendragapus obscurus

<400>  96
guugugaaug uaa                                                          13


<210>  97
<211>  14
<212>  RNA
<213>  Dendragapus obscurus

<400>  97
cuaagaaugu aaua                                                         14


<210>  98
<211>  11
<212>  RNA
<213>  Embiotocidae

<400>  98
cugggaaugu a                                                            11


<210>  99
<211>  13
<212>  RNA
<213>  Embiotocidae

<400>  99
cuugugaaug uaa                                                          13


<210>  100
<211>  14
<212>  RNA
<213>  Embiotocidae

<400>  100
cuaagaaugu aaug                                                         14


<210>  101
<211>  12
<212>  RNA
<213>  Monodelphis domestica

<400>  101
uuuggaaugu ac                                                           12


<210>  102
<211>  14
<212>  RNA
<213>  Monodelphis domestica

<400>  102
cuaagaaugu aaua                                                         14


<210>  103
<211>  14
<212>  RNA
<213>  Monodelphis domestica

<400>  103
cuaagaaugu aaua                                                         14


<210>  104
<211>  12
<212>  RNA
<213>  Ornithorhynchus anatinus

<400>  104
uauggaaugu au                                                           12


<210>  105
<211>  13
<212>  RNA
<213>  Ornithorhynchus anatinus

<400>  105
guggugaaug uaa                                                          13


<210>  106
<211>  12
<212>  RNA
<213>  Gallus gallus

<400>  106
uugggaaugu aa                                                           12


<210>  107
<211>  13
<212>  RNA
<213>  Bos taurus

<400>  107
gaugugaaug uaa                                                          13


<210>  108
<211>  14
<212>  RNA
<213>  Bos taurus

<400>  108
cuaagaaugu aauc                                                         14


<210>  109
<211>  13
<212>  RNA
<213>  Larus californicus

<400>  109
guugugaaug uaa                                                          13


<210>  110
<211>  14
<212>  RNA
<213>  Larus californicus

<400>  110
cuaagaaugu aaua                                                         14


<210>  111
<211>  15
<212>  RNA
<213>  Homo sapiens

<400>  111
gucucgaaug uaauu                                                        15


<210>  112
<211>  15
<212>  RNA
<213>  Pan Troglodytes

<400>  112
gucucgaaug uaauu                                                        15


<210>  113
<211>  15
<212>  RNA
<213>  Macaca mulatta

<400>  113
gucucgaaug uaauu                                                        15


<210>  114
<211>  15
<212>  RNA
<213>  Mus musculus

<400>  114
gucucgaaug uaauu                                                        15


<210>  115
<211>  15
<212>  RNA
<213>  Rattus norvegicus

<400>  115
gucucgaaug uaauu                                                        15


<210>  116
<211>  15
<212>  RNA
<213>  Scatophagus argus

<400>  116
aucucgaaug uaauu                                                        15


<210>  117
<211>  15
<212>  RNA
<213>  Canis familiaris

<400>  117
gucucgaaug uaauu                                                        15


<210>  118
<211>  15
<212>  RNA
<213>  Felis catus

<400>  118
cucuugaaug uaguu                                                        15


<210>  119
<211>  15
<212>  RNA
<213>  Equus caballus

<400>  119
ggcucgaaug uaauu                                                        15


<210>  120
<211>  15
<212>  RNA
<213>  Bos taurus

<400>  120
gucucgaaug uaauu                                                        15


<210>  121
<211>  15
<212>  RNA
<213>  Ornithorhynchus anatinus

<400>  121
aucucgaaug uaauu                                                        15


<210>  122
<211>  17
<212>  RNA
<213>  Gallus gallus

<400>  122
aauuuggaau guaacuu                                                      17


