                         SEQUENCE LISTING

<110>  SCHNEEWIND, OLAF
       MISSIAKIS, DOMINIQUE
       MCADOW, MOLLY
       KEUN KIM, HWAN
 
<120>  METHODS AND COMPOSITINS FOR INHIBITING STAPHYLOCOCCUS 
       AGGLUTINATION IN BLOOD

<130>  ARCD.P0505WO

<140>  UNKNOWN
<141>  2012-07-13

<150>  61/508,430
<151>  2011-07-15

<150>  61/530,869
<151>  2011-09-02

<160>  16    

<170>  PatentIn version 3.5

<210>  1
<211>  2802
<212>  DNA
<213>  Staphylococcus aureus

<400>  1
atgaatatga agaaaaaaga aaaacacgca attcggaaaa aatcgattgg cgtggcttca       60

gtgcttgtag gtacgttaat cggttttgga ctactcagca gtaaagaagc agatgcaagt      120

gaaaatagtg ttacgcaatc tgatagcgca agtaacgaaa gcaaaagtaa tgattcaagt      180

agcgttagtg ctgcacctaa aacagacgac acaaacgtga gtgatactaa aacatcgtca      240

aacactaata atggcgaaac gagtgtggcg caaaatccag cacaacagga aacgacacaa      300

tcatcatcaa caaatgcaac tacggaagaa acgccggtaa ctggtgaagc tactactacg      360

acaacgaatc aagctaatac accggcaaca actcaatcaa gcaatacaaa tgcggaggaa      420

ttagtgaatc aaacaagtaa tgaaacgact tctaatgata ctaatacagt atcatctgta      480

aattcacctc aaaattctac aaatgcggaa aatgtttcaa caacgcaaga tacttcaact      540

gaagcaacac cttcaaacaa tgaatcagct ccacagagta cagatgcaag taataaagat      600

gtagttaatc aagcggttaa tacaagtgcg cctagaatga gagcatttag tttagcggca      660

gtagctgcag atgcaccggc agctggcaca gatattacga atcagttgac gaatgtgaca      720

gttggtattg actctggtac gactgtgtat ccgcaccaag caggttatgt caaactgaat      780

tatggttttt cagtgcctaa ttctgctgtt aaaggtgaca cattcaaaat aactgtacct      840

aaagaattaa acttaaatgg tgtaacttca actgctaaag tgccaccaat tatggctgga      900

gatcaagtat tggcaaatgg tgtaatcgat agtgatggta atgttattta tacatttaca      960

gactatgtaa atactaaaga tgatgtaaaa gcaactttga ccatgcccgc ttatattgac     1020

cctgaaaatg ttaaaaagac aggtaatgtg acattggcta ctggcatagg tagtacaaca     1080

gcaaacaaaa cagtattagt agattatgaa aaatatggta agttttataa cttatctatt     1140

aaaggtacaa ttgaccaaat cgataaaaca aataatacgt atcgtcagac aatttatgtc     1200

aatccaagtg gagataacgt tattgcgccg gttttaacag gtaatttaaa accaaatacg     1260

gatagtaatg cattaataga tcagcaaaat acaagtatta aagtatataa agtagataat     1320

gcagctgatt tatctgaaag ttactttgtg aatccagaaa actttgagga tgtcactaat     1380

agtgtgaata ttacattccc aaatccaaat caatataaag tagagtttaa tacgcctgat     1440

gatcaaatta caacaccgta tatagtagtt gttaatggtc atattgatcc gaatagcaaa     1500

ggtgatttag ctttacgttc aactttatat gggtataact cgaatataat ttggcgctct     1560

atgtcatggg acaacgaagt agcatttaat aacggatcag gttctggtga cggtatcgat     1620

aaaccagttg ttcctgaaca acctgatgag cctggtgaaa ttgaaccaat tccagaggat     1680

tcagattctg acccaggttc agattctggc agcgattcta attcagatag cggttcagat     1740

tcgggtagtg attctacatc agatagtggt tcagattcag cgagtgattc agattcagca     1800

agtgattcag actcagcgag tgattcagat tcagcaagcg attccgactc agcgagcgat     1860

tccgactcag acaatgactc ggattcagat agcgattctg actcagacag tgactcagat     1920

tccgacagtg actcagattc agatagcgat tctgactcag acagtgactc agattcagat     1980

agcgattcag attcagatag cgattcagat tccgacagtg attccgactc agacagcgat     2040

tctgactccg acagtgattc cgactcagac agcgattcag attccgacag tgattccgac     2100

tcagatagcg attccgactc agatagcgac tcagattcag acagcgattc agattcagac     2160

agcgattcag attcagatag cgattcagat tccgacagtg actcagattc cgacagtgac     2220

tcggattcag atagcgattc agattccgac agtgactcag attccgacag tgactcagac     2280

tcagacagtg attcggattc agcgagtgat tcggattcag atagtgattc cgactccgac     2340

agtgactcgg attcagatag cgactcagac tcggatagcg actcggattc agatagcgat     2400

tcggactcag atagcgattc agaatcagac agcgattcag aatcagacag cgattcagat     2460

tcagacagcg actcagacag tgactcagat tcagatagtg actcggattc agcgagtgat     2520

tcagactcag gtagtgactc cgattcatca agtgattccg actcagaaag tgattcaaat     2580

agcgattccg agtcaggttc taacaataat gtagttccgc ctaattcacc taaaaatggt     2640

actaatgctt ctaataaaaa tgaggctaaa gatagtaaag aaccattacc agatacaggt     2700

tctgaagatg aagcaaatac gtcactaatt tggggattat tagcatcaat aggttcatta     2760

ctacttttca gaagaaaaaa agaaaataaa gataagaaat aa                        2802


<210>  2
<211>  933
<212>  PRT
<213>  Staphylococcus aureus

<400>  2

Met Asn Met Lys Lys Lys Glu Lys His Ala Ile Arg Lys Lys Ser Ile 
1               5                   10                  15      


Gly Val Ala Ser Val Leu Val Gly Thr Leu Ile Gly Phe Gly Leu Leu 
            20                  25                  30          


Ser Ser Lys Glu Ala Asp Ala Ser Glu Asn Ser Val Thr Gln Ser Asp 
        35                  40                  45              


Ser Ala Ser Asn Glu Ser Lys Ser Asn Asp Ser Ser Ser Val Ser Ala 
    50                  55                  60                  


Ala Pro Lys Thr Asp Asp Thr Asn Val Ser Asp Thr Lys Thr Ser Ser 
65                  70                  75                  80  


Asn Thr Asn Asn Gly Glu Thr Ser Val Ala Gln Asn Pro Ala Gln Gln 
                85                  90                  95      


Glu Thr Thr Gln Ser Ser Ser Thr Asn Ala Thr Thr Glu Glu Thr Pro 
            100                 105                 110         


Val Thr Gly Glu Ala Thr Thr Thr Thr Thr Asn Gln Ala Asn Thr Pro 
        115                 120                 125             


Ala Thr Thr Gln Ser Ser Asn Thr Asn Ala Glu Glu Leu Val Asn Gln 
    130                 135                 140                 


Thr Ser Asn Glu Thr Thr Ser Asn Asp Thr Asn Thr Val Ser Ser Val 
145                 150                 155                 160 


Asn Ser Pro Gln Asn Ser Thr Asn Ala Glu Asn Val Ser Thr Thr Gln 
                165                 170                 175     


Asp Thr Ser Thr Glu Ala Thr Pro Ser Asn Asn Glu Ser Ala Pro Gln 
            180                 185                 190         


Ser Thr Asp Ala Ser Asn Lys Asp Val Val Asn Gln Ala Val Asn Thr 
        195                 200                 205             


Ser Ala Pro Arg Met Arg Ala Phe Ser Leu Ala Ala Val Ala Ala Asp 
    210                 215                 220                 


Ala Pro Ala Ala Gly Thr Asp Ile Thr Asn Gln Leu Thr Asn Val Thr 
225                 230                 235                 240 


Val Gly Ile Asp Ser Gly Thr Thr Val Tyr Pro His Gln Ala Gly Tyr 
                245                 250                 255     


Val Lys Leu Asn Tyr Gly Phe Ser Val Pro Asn Ser Ala Val Lys Gly 
            260                 265                 270         


Asp Thr Phe Lys Ile Thr Val Pro Lys Glu Leu Asn Leu Asn Gly Val 
        275                 280                 285             


Thr Ser Thr Ala Lys Val Pro Pro Ile Met Ala Gly Asp Gln Val Leu 
    290                 295                 300                 


Ala Asn Gly Val Ile Asp Ser Asp Gly Asn Val Ile Tyr Thr Phe Thr 
305                 310                 315                 320 


Asp Tyr Val Asn Thr Lys Asp Asp Val Lys Ala Thr Leu Thr Met Pro 
                325                 330                 335     


Ala Tyr Ile Asp Pro Glu Asn Val Lys Lys Thr Gly Asn Val Thr Leu 
            340                 345                 350         


Ala Thr Gly Ile Gly Ser Thr Thr Ala Asn Lys Thr Val Leu Val Asp 
        355                 360                 365             


Tyr Glu Lys Tyr Gly Lys Phe Tyr Asn Leu Ser Ile Lys Gly Thr Ile 
    370                 375                 380                 


Asp Gln Ile Asp Lys Thr Asn Asn Thr Tyr Arg Gln Thr Ile Tyr Val 
385                 390                 395                 400 


Asn Pro Ser Gly Asp Asn Val Ile Ala Pro Val Leu Thr Gly Asn Leu 
                405                 410                 415     


Lys Pro Asn Thr Asp Ser Asn Ala Leu Ile Asp Gln Gln Asn Thr Ser 
            420                 425                 430         


Ile Lys Val Tyr Lys Val Asp Asn Ala Ala Asp Leu Ser Glu Ser Tyr 
        435                 440                 445             


Phe Val Asn Pro Glu Asn Phe Glu Asp Val Thr Asn Ser Val Asn Ile 
    450                 455                 460                 


Thr Phe Pro Asn Pro Asn Gln Tyr Lys Val Glu Phe Asn Thr Pro Asp 
465                 470                 475                 480 


Asp Gln Ile Thr Thr Pro Tyr Ile Val Val Val Asn Gly His Ile Asp 
                485                 490                 495     


Pro Asn Ser Lys Gly Asp Leu Ala Leu Arg Ser Thr Leu Tyr Gly Tyr 
            500                 505                 510         


Asn Ser Asn Ile Ile Trp Arg Ser Met Ser Trp Asp Asn Glu Val Ala 
        515                 520                 525             


Phe Asn Asn Gly Ser Gly Ser Gly Asp Gly Ile Asp Lys Pro Val Val 
    530                 535                 540                 


Pro Glu Gln Pro Asp Glu Pro Gly Glu Ile Glu Pro Ile Pro Glu Asp 
545                 550                 555                 560 


Ser Asp Ser Asp Pro Gly Ser Asp Ser Gly Ser Asp Ser Asn Ser Asp 
                565                 570                 575     


Ser Gly Ser Asp Ser Gly Ser Asp Ser Thr Ser Asp Ser Gly Ser Asp 
            580                 585                 590         


Ser Ala Ser Asp Ser Asp Ser Ala Ser Asp Ser Asp Ser Ala Ser Asp 
        595                 600                 605             


Ser Asp Ser Ala Ser Asp Ser Asp Ser Ala Ser Asp Ser Asp Ser Asp 
    610                 615                 620                 


Asn Asp Ser Asp Ser Asp Ser Asp Ser Asp Ser Asp Ser Asp Ser Asp 
625                 630                 635                 640 


Ser Asp Ser Asp Ser Asp Ser Asp Ser Asp Ser Asp Ser Asp Ser Asp 
                645                 650                 655     


Ser Asp Ser Asp Ser Asp Ser Asp Ser Asp Ser Asp Ser Asp Ser Asp 
            660                 665                 670         


Ser Asp Ser Asp Ser Asp Ser Asp Ser Asp Ser Asp Ser Asp Ser Asp 
        675                 680                 685             


Ser Asp Ser Asp Ser Asp Ser Asp Ser Asp Ser Asp Ser Asp Ser Asp 
    690                 695                 700                 


Ser Asp Ser Asp Ser Asp Ser Asp Ser Asp Ser Asp Ser Asp Ser Asp 
705                 710                 715                 720 


Ser Asp Ser Asp Ser Asp Ser Asp Ser Asp Ser Asp Ser Asp Ser Asp 
                725                 730                 735     


Ser Asp Ser Asp Ser Asp Ser Asp Ser Asp Ser Asp Ser Asp Ser Asp 
            740                 745                 750         


Ser Asp Ser Asp Ser Asp Ser Asp Ser Asp Ser Asp Ser Asp Ser Ala 
        755                 760                 765             


Ser Asp Ser Asp Ser Asp Ser Asp Ser Asp Ser Asp Ser Asp Ser Asp 
    770                 775                 780                 


Ser Asp Ser Asp Ser Asp Ser Asp Ser Asp Ser Asp Ser Asp Ser Asp 
785                 790                 795                 800 


Ser Asp Ser Asp Ser Asp Ser Glu Ser Asp Ser Asp Ser Glu Ser Asp 
                805                 810                 815     


Ser Asp Ser Asp Ser Asp Ser Asp Ser Asp Ser Asp Ser Asp Ser Asp 
            820                 825                 830         


Ser Asp Ser Asp Ser Ala Ser Asp Ser Asp Ser Gly Ser Asp Ser Asp 
        835                 840                 845             


Ser Ser Ser Asp Ser Asp Ser Glu Ser Asp Ser Asn Ser Asp Ser Glu 
    850                 855                 860                 


Ser Gly Ser Asn Asn Asn Val Val Pro Pro Asn Ser Pro Lys Asn Gly 
865                 870                 875                 880 


Thr Asn Ala Ser Asn Lys Asn Glu Ala Lys Asp Ser Lys Glu Pro Leu 
                885                 890                 895     


Pro Asp Thr Gly Ser Glu Asp Glu Ala Asn Thr Ser Leu Ile Trp Gly 
            900                 905                 910         


Leu Leu Ala Ser Ile Gly Ser Leu Leu Leu Phe Arg Arg Lys Lys Glu 
        915                 920                 925             


Asn Lys Asp Lys Lys 
    930             


<210>  3
<211>  43
<212>  DNA
<213>  Staphylococcus aureus

<400>  3
cgcggatcca tagtaacaaa ggattatagt gggaaatcac aag                         43


<210>  4
<211>  39
<212>  DNA
<213>  Staphylococcus aureus

<400>  4
tcccccgggt tattttgtta ctctaggccc atatgtcgc                              39


<210>  5
<211>  32
<212>  DNA
<213>  Staphylococcus aureus

<400>  5
cgcggatccg tggtttctgg ggagaagaat cc                                     32


<210>  6
<211>  36
<212>  DNA
<213>  Staphylococcus aureus

<400>  6
tcccccgggt ttgcagccat gcattaatta tttgcc                                 36


<210>  7
<211>  27
<212>  DNA
<213>  Staphylococcus aureus

<400>  7
cgcggatcca aggtcaaatc gaccgtt                                           27


<210>  8
<211>  38
<212>  DNA
<213>  Staphylococcus aureus

<400>  8
cggggtacct tatttcttat ctttattttc tttttttc                               38


<210>  9
<211>  121
<212>  PRT
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Synthetic peptide

<400>  9

Gln Val Gln Leu Lys Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Ala Pro Ser Gln 
1               5                   10                  15      


Ser Leu Ser Ile Thr Cys Ala Ile Ser Gly Phe Ser Leu Ser Arg Tyr 
            20                  25                  30          


Ser Val His Trp Val Arg Gln Pro Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Leu 
        35                  40                  45              


Gly Met Ile Trp Gly Gly Gly Asn Thr Asp Tyr Asn Ser Ala Leu Lys 
    50                  55                  60                  


Ser Arg Leu Ser Ile Ser Lys Asp Asn Ser Lys Ser Gln Val Phe Leu 
65                  70                  75                  80  


Lys Met Asn Ser Leu Gln Thr Asp Asp Thr Ala Met Tyr Tyr Cys Ala 
                85                  90                  95      


Arg Lys Gly Glu Phe Tyr Tyr Gly Tyr Asp Gly Phe Val Tyr Trp Gly 
            100                 105                 110         


Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ala 
        115                 120     


<210>  10
<211>  118
<212>  PRT
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Synthetic peptide

<400>  10

Gln Val His Leu Lys Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Ala Pro Ser Gln 
1               5                   10                  15      


Ser Leu Ser Ile Thr Cys Thr Val Ser Gly Phe Ser Leu Ser Arg Tyr 
            20                  25                  30          


Asn Ile His Trp Val Arg Gln Pro Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Leu 
        35                  40                  45              


Gly Met Ile Trp Gly Gly Glu Asn Thr Asp Tyr Asn Ser Ala Leu Lys 
    50                  55                  60                  


Ser Arg Leu Ser Ile Ser Lys Asp Asn Ser Lys Ser Gln Val Phe Leu 
65                  70                  75                  80  


Lys Met Asn Ser Leu Gln Thr Asp Asp Thr Ala Met Tyr Tyr Cys Ala 
                85                  90                  95      


Ser Ala Tyr Tyr Gly Asn Ser Trp Phe Ala Tyr Trp Gly Gln Gly Thr 
            100                 105                 110         


Leu Val Thr Val Ser Ala 
        115             


<210>  11
<211>  115
<212>  PRT
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Synthetic peptide

<400>  11

Gln Val Gln Leu Lys Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Ala Pro Ser Gln 
1               5                   10                  15      


Ser Leu Ser Ile Thr Cys Thr Val Ser Gly Phe Ser Leu Ser Arg Tyr 
            20                  25                  30          


Ser Val His Trp Val Arg Gln Pro Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Leu 
        35                  40                  45              


Gly Met Ile Trp Gly Gly Gly Ser Thr Asp Tyr Asn Ser Ala Leu Lys 
    50                  55                  60                  


Ser Arg Leu Asn Ile Ser Lys Asp Asn Ser Lys Ser Gln Val Phe Leu 
65                  70                  75                  80  


Lys Met Asn Ser Leu Gln Thr Asp Asp Thr Ala Met Tyr Tyr Cys Ala 
                85                  90                  95      


Arg Arg Leu Trp Tyr Phe Asp Val Trp Gly Ala Gly Thr Thr Val Thr 
            100                 105                 110         


Val Ser Ser 
        115 


<210>  12
<211>  118
<212>  PRT
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Synthetic peptide

<400>  12

Gln Val Gln Leu Lys Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Ala Pro Ser Gln 
1               5                   10                  15      


Ser Leu Ser Ile Thr Cys Thr Val Ser Gly Phe Ser Leu Ser Arg Tyr 
            20                  25                  30          


Ser Val His Trp Val Arg Gln Pro Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Leu 
        35                  40                  45              


Gly Met Ile Trp Gly Gly Gly Asn Thr Asp Tyr Asn Ser Ala Leu Lys 
    50                  55                  60                  


Ser Arg Leu Ser Ile Thr Lys Asp Asn Ser Lys Ser Gln Val Phe Leu 
65                  70                  75                  80  


Lys Met Asn Ser Leu Gln Thr Asp Asp Thr Ala Met Tyr Tyr Cys Ala 
                85                  90                  95      


Thr Ala Tyr Tyr Gly Asn Ser Trp Phe Ala Tyr Trp Gly Gln Gly Thr 
            100                 105                 110         


Leu Val Thr Val Ser Ala 
        115             


<210>  13
<211>  112
<212>  PRT
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Synthetic peptide

<400>  13

Asn Ile Met Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ala Val Ser Ala Gly 
1               5                   10                  15      


Glu Lys Val Thr Met Ser Cys Lys Ser Ser Gln Ser Val Leu Tyr Ser 
            20                  25                  30          


Ser Asn Gln Lys Asn Tyr Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln 
        35                  40                  45              


Ser Pro Lys Leu Leu Ile Tyr Trp Ala Ser Thr Arg Glu Ser Gly Val 
    50                  55                  60                  


Pro Asp Arg Phe Thr Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr 
65                  70                  75                  80  


Ile Ser Ser Val Gln Ala Glu Asp Leu Ala Val Tyr Tyr Cys His Gln 
                85                  90                  95      


Tyr Leu Ser Ser Tyr Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys 
            100                 105                 110         


<210>  14
<211>  112
<212>  PRT
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Synthetic peptide

<400>  14

Asn Ile Met Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ala Val Ser Ala Gly 
1               5                   10                  15      


Glu Lys Val Thr Met Ser Cys Lys Ser Ser Gln Ser Val Leu Tyr Ser 
            20                  25                  30          


Ser Asn Gln Lys Asn Tyr Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln 
        35                  40                  45              


Ser Pro Lys Leu Leu Ile Tyr Trp Ala Ser Thr Arg Glu Ser Gly Val 
    50                  55                  60                  


Pro Asp Arg Phe Thr Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr 
65                  70                  75                  80  


Ile Asn Ser Val Gln Ala Glu Asp Leu Ala Val Tyr Tyr Cys His Gln 
                85                  90                  95      


Tyr Leu Ser Ser His Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys 
            100                 105                 110         


<210>  15
<211>  112
<212>  PRT
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Synthetic peptide

<400>  15

Asn Ile Met Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ala Val Ser Ala Gly 
1               5                   10                  15      


Glu Lys Val Thr Met Ser Cys Lys Ser Ser Gln Ser Val Leu Tyr Ser 
            20                  25                  30          


Ser Asn Gln Lys Asn Tyr Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln 
        35                  40                  45              


Ser Pro Lys Leu Leu Ile Tyr Trp Ala Ser Thr Arg Glu Ser Gly Val 
    50                  55                  60                  


Pro Asp Arg Phe Thr Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr 
65                  70                  75                  80  


Ile Ser Ser Val Gln Ala Glu Asp Leu Ala Val Tyr Cys Cys His Gln 
                85                  90                  95      


Tyr Leu Ser Ser Tyr Thr Phe Gly Gly Gly Thr Glu Leu Glu Ile Lys 
            100                 105                 110         


<210>  16
<211>  112
<212>  PRT
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Synthetic peptide

<400>  16

Asn Ile Met Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ala Val Ser Ala Gly 
1               5                   10                  15      


Glu Lys Val Thr Met Ser Cys Arg Ser Ser Gln Ser Val Leu Tyr Ser 
            20                  25                  30          


Ser Asn Gln Lys Asn Tyr Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln 
        35                  40                  45              


Ser Pro Thr Leu Leu Ile Tyr Trp Ala Ser Thr Arg Glu Ser Gly Val 
    50                  55                  60                  


Pro Asp Arg Phe Thr Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr 
65                  70                  75                  80  


Ile Ser Ser Val Gln Ala Glu Asp Leu Ala Val Tyr Tyr Cys His Gln 
                85                  90                  95      


Tyr Leu Ser Ser Tyr Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys 
            100                 105                 110         


