                         LISTADO DE SECUENCIAS

<110>  Instituto de Salud Carlos III
 
<120>  MTODO DE AMPLIFICACIN GENMICA DEL VIRUS WEST NILE

<130>  PCT-566

<150>  ES201030126
<151>  2010-01-29

<160>  57    

<170>  PatentIn version 3.3

<210>  1
<211>  23
<212>  DNA
<213>  Secuencia artificial

<220>
<223>  Cebador directo WNVRT_F para la amplificacin de un fragmento de 
       regin no codificante de 3' del virus West Nile

<400>  1
cggaagtygr gtakacggtg ctg                                             23


<210>  2
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Secuencia artificial

<220>
<223>  Cebador inverso WNVRT_Re para la amplificacin de un fragmento de
       regin no codificante de 3' del virus West Nile

<400>  2
cggtwytgag ggcttacrtg g                                               21


<210>  3
<211>  15
<212>  DNA
<213>  Secuencia artificial

<220>
<223>  Sonda de la invencin para la deteccin del virus West Nile 
       amplificado

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (1)..(1)
<223>  /nota: Fluorforo, preferiblemente FAM, unido en 5'

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (15)..(15)
<223>  /nota: MGB unido a 3' en realizacin preferida

<400>  3
wccccaggwg gactg                                                      15


<210>  4
<211>  43
<212>  DNA
<213>  Secuencia artificial

<220>
<223>  Oligonucletido para la amplificacin del control interno que 
       contiene el cebador directo de PCR en Tiempo Real

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (1)..(23)
<223>  Secuencia del cebador directo de PCR

<400>  4
cggaagtygr gtakacggtg ctgccagcac acatgtgtct act                       43


<210>  5
<211>  41
<212>  DNA
<213>  Secuencia artificial

<220>
<223>  Oligonucletido para la amplificacin del control interno que 
       contiene el cebador inverso de PCR en Tiempo Real

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (1)..(21)
<223>  Secuencia del cebador inverso de PCR

<400>  5
cggtwytgag ggcttacrtg gagtagacac atgtgtgctg g                         41


<210>  6
<211>  64
<212>  DNA
<213>  Secuencia artificial

<220>
<223>  Secuencia del control interno de amplificacin y/o extraccin

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (1)..(23)
<223>  Secuencia del oligonucletido WNRT_F (SEQ ID NO:1)

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (44)..(64)
<223>  Secuencia complementaria al oligonucletido WNRT_Re (SEQ ID NO:2)

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (44)..(64)
<223>  Secuencia complementaria al oligonucletido WNVRT_Re (SEQ ID 
       NO:2)

<400>  6
cggaagtygr gtakacggtg ctgccagcac acatgtgtct actccaygta agccctcarw     60

accg                                                                  64


<210>  7
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Secuencia artificial

<220>
<223>  Sonda del control interno

<400>  7
ccagcacaca tgtgtctact                                                 20


<210>  8
<211>  93
<212>  DNA
<213>  West Nile Virus

<220>
<221>  source
<222>  (1)..(93)
<223>  Fragmento de la regin 3' no codificante del virus West Nile 
       (nucletidos 10530 a 10622 del aislado Eg101)

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (1)..(23)
<223>  Fragmento correspondiente al cebador directo WNRT-F (SEQ ID NO:1)

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (35)..(49)
<223>  Fragmento de unin de la sonda  de SEQ ID NO:3

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (73)..(93)
<223>  Fragmento correspondiente al cebador inverso WNRT-Re (SEQ ID 
       NO:2)

<400>  8
cggaagttga gtagacggtg ctgcctgcga ctcaacccca ggaggactgg gtgaacaaag     60

ctgcgaagtg atccatgtaa gccctcagaa ccg                                  93


<210>  9
<211>  93
<212>  DNA
<213>  West Nile virus

<220>
<221>  source
<222>  (1)..(93)
<223>  Fragmento de la regin 3' no codificante del virus West Nile, 
       aislado MP502_66, amplificado por el mtodo de la invencin

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (1)..(23)
<223>  Fragmento correspondiente al cebador directo WNRT-F (SEQ ID NO:1)

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (35)..(49)
<223>  Fragmento de unin de la sonda  de SEQ ID NO:3

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (73)..(93)
<223>  Fragmento correspondiente al cebador inverso WNRT-Re (SEQ ID 
       NO:2)

<400>  9
cggacgttga gtagacggtg ctgcctgcga ctcaacccca ggaggactgg gtgaacaaag     60

ctgcgaggtg atccacgtaa gccctcagaa ccg                                  93


<210>  10
<211>  93
<212>  DNA
<213>  West Nile virus

<220>
<221>  source
<222>  (1)..(93)
<223>  Fragmento de la regin 3' no codificante del virus West Nile, 
       aislado HU2925_06_3nc, amplificado por el mtodo de la invencin

<220>
<221>  source
<222>  (1)..(93)
<223>  Fragmento de la regin 3' no codificante del virus West Nile, 
       aislado HU2925_06, amplificado por el mtodo de la invencin

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (1)..(23)
<223>  Fragmento correspondiente al cebador directo WNRT-F (SEQ ID NO:1)

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (35)..(49)
<223>  Fragmento de unin de la sonda de SEQ ID NO:3

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (73)..(93)
<223>  Fragmento correspondiente al cebador inverso WNRT-Re (SEQ ID 
       NO:2)

<400>  10
cggaagttga gtagacggtg ctgcttgcga ctcaacccca ggaggactgg gtaaacaaag     60

ccgtagagag atccacgtaa gccctcaata ccg                                  93


<210>  11
<211>  31
<212>  DNA
<213>  West Nile virus

<220>
<221>  source
<222>  (1)..(31)
<223>  Virus West Nile: Secuencia en la que estn contenidas las 
       secuencias de todos los cebadores de amplificacin del WNV de la 
       Tabla 5 de la solicitud WO 2004/036190

<400>  11
tccgccaccg gaagttgagt agacggtgct g                                    31


<210>  12
<211>  70
<212>  DNA
<213>  West Nile virus

<220>
<221>  source
<222>  (1)..(70)
<223>  Virus West Nile: Secuencia en la que estn contenidas las 
       secuencias de todos los cebadores de amplificacin del WNV de la 
       Tabla 6 del documento WO 2004/036190

<400>  12
tccgagacgg ttctgagggc ttacatggat cacttcgcag ctttgttcac ccagtcctcc     60

tggggttgag                                                            70


<210>  13
<211>  48
<212>  DNA
<213>  West Nile virus

<220>
<221>  source
<222>  (1)..(48)
<223>  Virus West Nile: porcin de SEQ ID NO:12 preferida para el diseo
       de cebadores de amplificacin del WNV segn la solicitud WO 
       2004/036190

<400>  13
tccgagacgg ttctgagggc ttacatggat cacttcgcag ctttgttc                  48


<210>  14
<211>  24
<212>  DNA
<213>  West Nile virus

<220>
<221>  source
<222>  (1)..(24)
<223>  Virus West Nile: porcin de SEQ ID NO:12 preferida para el diseo
       de cebadores de amplificacin del WNV segn la solicitud WO 
       2004/036190

<400>  14
tccgagacgg ttctgagggc ttac                                            24


<210>  15
<211>  19
<212>  DNA
<213>  Secuencia artificial

<220>
<223>  Cebador directo de PCR de la regin 3' no codificante del virus 
       West Nile

<400>  15
tccgccaccg gaagttgag                                                  19


<210>  16
<211>  19
<212>  DNA
<213>  Secuencia artificial

<220>
<223>  Cebador directo de PCR de la regin 3' no codificante del virus 
       West Nile


<220>
<221>  modified_base
<222>  (1)..(1)
<223>  I: inosina

<220>
<221>  modified_base
<222>  (1)..(1)
<223>  I: inosina

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (1)..(1)
<223>  n es a, c, g, o t

<400>  16
nccgccaccg gaagttgag                                                  19


<210>  17
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Secuencia artificial

<220>
<223>  Cebador directo de PCR de la regin 3' no codificante del virus 
       West Nile

<400>  17
tccgccaccg gaagttgagt                                                 20


<210>  18
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Secuencia artificial

<220>
<223>  Cebador directo de PCR de la regin 3' no codificante del virus 
       West Nile

<400>  18
tccgccaccg gaagttgagt a                                               21


<210>  19
<211>  18
<212>  DNA
<213>  Secuencia artificial

<220>
<223>  Cebador directo de PCR de la regin 3' no codificante del virus 
       West Nile

<400>  19
cgccaccgga agttgagt                                                   18


<210>  20
<211>  18
<212>  DNA
<213>  Secuencia artificial

<220>
<223>  Cebador directo de PCR de la regin 3' no codificante del virus 
       West Nile

<220>
<221>  modified_base
<222>  (1)..(1)
<223>  I. inosina

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (1)..(1)
<223>  n es a, c, g, o t

<400>  20
ngccaccgga agttgagt                                                   18


<210>  21
<211>  19
<212>  DNA
<213>  Secuencia artificial

<220>
<223>  Cebador directo de PCR de la regin 3' no codificante del virus 
       West Nile

<400>  21
cgccaccgga agttgagta                                                  19


<210>  22
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Secuencia artificial

<220>
<223>  Cebador directo de PCR de la regin 3' no codificante del virus 
       West Nile

<400>  22
ggaagttgag tagacggtgc t                                               21


<210>  23
<211>  22
<212>  DNA
<213>  Secuencia artificial

<220>
<223>  Cebador directo de PCR de la regin 3' no codificante del virus 
       West Nile

<400>  23
ggaagttgag tagacggtgc tg                                              22


<210>  24
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Secuencia artificial

<220>
<223>  Cebador directo de PCR de la regin 3' no codificante del virus 
       West Nile

<400>  24
gaagttgagt agacggtgct                                                 20


<210>  25
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Secuencia artificial

<220>
<223>  Cebador directo de PCR de la regin 3' no codificante del virus 
       West Nile

<400>  25
gaagttgagt agacggtgct g                                               21


<210>  26
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Secuencia artificial

<220>
<223>  Cebador directo de PCR de la regin 3' no codificante del virus 
       West Nile

<400>  26
aagttgagta gacggtgctg                                                 20


<210>  27
<211>  23
<212>  DNA
<213>  Secuencia artificial

<220>
<223>  Cebador inverso de PCR de la regin 3' no codificante del virus 
       West Nile

<400>  27
tccgagacgg ttctgagggt tac                                             23


<210>  28
<211>  22
<212>  DNA
<213>  Secuencia artificial

<220>
<223>  Cebador inverso de PCR de la regin 3' no codificante del virus 
       West Nile

<400>  28
tccgagacgg ttctgagggt ta                                              22


<210>  29
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Secuencia artificial

<220>
<223>  Cebador inverso de PCR de la regin 3' no codificante del virus 
       West Nile

<400>  29
tccgagacgg ttctgagggt t                                               21


<210>  30
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Secuencia artificial

<220>
<223>  Cebador inverso de PCR de la regin 3' no codificante del virus 
       West Nile

<400>  30
ccagtcctcc tggggttgag                                                 20


<210>  31
<211>  22
<212>  DNA
<213>  Secuencia artificial

<220>
<223>  Cebador inverso de PCR de la regin 3' no codificante del virus 
       West Nile

<400>  31
acccagtcct cctggggttg ag                                              22


<210>  32
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Secuencia artificial

<220>
<223>  Cebador inverso de PCR de la regin 3' no codificante del virus 
       West Nile

<400>  32
acccagtcct cctggggttg a                                               21


<210>  33
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Secuencia artificial

<220>
<223>  Cebador inverso de PCR de la regin 3' no codificante del virus 
       West Nile

<400>  33
acccagtcct cctggggttg                                                 20


<210>  34
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Secuencia artificial

<220>
<223>  Cebador inverso de PCR de la regin 3' no codificante del virus 
       West Nile

<220>
<221>  modified_base
<222>  (7)..(7)
<223>  I: inosina

<220>
<221>  modified_base
<222>  (10)..(10)
<223>  I: inosina

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (10)..(10)
<223>  n es a, c, g, o t

<400>  34
gctacarcan gtggggtcct                                                 20


<210>  35
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Secuencia artificial

<220>
<223>  Cebador inverso de PCR de la regin 3' no codificante del virus 
       West Nile

<220>
<221>  modified_base
<222>  (10)..(10)
<223>  I

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (10)..(10)
<223>  n es a, c, g, o t

<400>  35
gctacaacan gtggggtcct                                                 20


<210>  36
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Secuencia artificial

<220>
<223>  Sonda propuesta en la solicitud WO 2004/036190 para la deteccin 
       de virus West Nile amplificado

<400>  36
gagtagacgg tgctgcctgc g                                               21


<210>  37
<211>  19
<212>  DNA
<213>  Secuencia artificial

<220>
<223>  Sonda propuesta en la solicitud WO 2004/036190 para la deteccin 
       de virus West Nile amplificado

<400>  37
gtagacggtg ctgcctgcg                                                  19


<210>  38
<211>  22
<212>  DNA
<213>  Secuencia artificial

<220>
<223>  Sonda propuesta en la solicitud WO 2004/036190 para la deteccin 
       de virus West Nile amplificado

<400>  38
tgcgactcaa ccccaggagg ac                                              22


<210>  39
<211>  18
<212>  DNA
<213>  Secuencia artificial

<220>
<223>  Sonda propuesta en la solicitud WO 2004/036190 para la deteccin 
       de virus West Nile amplificado

<400>  39
tgcgactcaa ccccagga                                                   18


<210>  40
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Secuencia artificial

<220>
<223>  Sonda propuesta en la solicitud WO 2004/036190 para la deteccin 
       de virus West Nile amplificado

<400>  40
cgactcaacc ccaggaggac                                                 20


<210>  41
<211>  19
<212>  DNA
<213>  Secuencia artificial

<220>
<223>  Sonda propuesta en la solicitud WO 2004/036190 para la deteccin 
       de virus West Nile amplificado

<400>  41
gactcaaccc caggaggac                                                  19


<210>  42
<211>  18
<212>  DNA
<213>  Secuencia artificial

<220>
<223>  Sonda propuesta en la solicitud WO 2004/036190 para la deteccin 
       de virus West Nile amplificado

<400>  42
gactcaaccc caggagga                                                   18


<210>  43
<211>  18
<212>  DNA
<213>  Secuencia artificial

<220>
<223>  Sonda propuesta en la solicitud WO 2004/036190 para la deteccin 
       de virus West Nile amplificado

<400>  43
actcaacccc aggaggac                                                   18


<210>  44
<211>  19
<212>  RNA
<213>  Secuencia artificial

<220>
<223>  Sonda propuesta en la solicitud WO 2004/036190 para la deteccin 
       de virus West Nile amplificado

<400>  44
caggaggacu gggugaaca                                                  19


<210>  45
<211>  19
<212>  RNA
<213>  Secuencia artificial

<220>
<223>  Sonda propuesta en la solicitud WO 2004/036190 para la deteccin 
       de virus West Nile amplificado

<400>  45
gaggacuggg ugaacaaag                                                  19


<210>  46
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Secuencia artificial

<220>
<223>  Sonda propuesta en la solicitud WO 2004/036190 para la deteccin 
       de virus West Nile amplificado

<400>  46
gtgaacaaag ctgcgaagtg                                                 20


<210>  47
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Secuencia artificial

<220>
<223>  Sonda propuesta en la solicitud WO 2004/036190 para la deteccin 
       de virus West Nile amplificado

<400>  47
aagccgcgaa gtgatccatg                                                 20


<210>  48
<211>  19
<212>  DNA
<213>  Secuencia artificial

<220>
<223>  Sonda propuesta en la solicitud WO 2004/036190 para la deteccin 
       de virus West Nile amplificado

<400>  48
gtaagccctc agaaccgtc                                                  19


<210>  49
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Secuencia artificial

<220>
<223>  Cebador directo de PCR para la amplificacin del virus West Nile

<400>  49
gccaccggaa gttgagtaga                                                 20


<210>  50
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Secuencia artificial

<220>
<223>  Cebador inverso de PCR para la amplificacin del virus West Nile

<400>  50
gagacggttc tgagggctta c                                               21


<210>  51
<211>  22
<212>  DNA
<213>  Secuencia artificial

<220>
<223>  Cebador inverso de PCR para la amplificacin del virus West Nile:
       propuesta inicial, cebador WNVRT-R1

<400>  51
cgagacggtw ytgagggctt ac                                              22


<210>  52
<211>  61
<212>  DNA
<213>  Secuencia artificial

<220>
<223>  Cebador 4WNQF: cebador directo de PCR en Tiempo Real para la 
       amplificacin de fragmento de la regin 3' NC del aislado 
       LEIV-Krnd88-190 del virus West Nile

<220>
<221>  source
<222>  (1)..(61)
<223>  Aislado LEIV-Krnd88-190 del virus West Nile (GenBank: AY277251), 
       nucletidos 10470-10530

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (9)..(31)
<223>  Fragmento correspondiente al cebador directo WNRT-F (SEQ ID NO:1)

<400>  52
gccgccaccg gaagttgggt atacggtgct gcctgtgacc caaccccagg aggactggga     60

t                                                                     61


<210>  53
<211>  67
<212>  DNA
<213>  Secuencia artificial

<220>
<223>  Cebador 4WNQRe: cebador inverso de PCR en Tiempo Real para la 
       amplificacin de fragmento de la regin 3' NC del aislado 
       LEIV-Krnd88-190 del virus West Nile


<220>
<221>  source
<222>  (1)..(67)
<223>  Aislado LEIV-Krnd88-190 del virus West Nile (GenBank: AY277251), 
       nucletidos 10512-10578

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (1)..(21)
<223>  Fragmento correspondiente al cebador inverso WNRT-Re (SEQ ID 
       NO:2)

<400>  53
ttccgaaacg gtattgaggg cttacgtgga tcgctccatg gctttgatat cccagtcctc     60

ctggggt                                                               67


<210>  54
<211>  61
<212>  DNA
<213>  Secuencia artificial

<220>
<223>  Cebador 5WNQF: cebador directo de PCR en Tiempo Real para la 
       amplificacin de fragmento de la regin 3' NC de la cepa 804994 
       del virus West Nile

<220>
<221>  source
<222>  (1)..(61)
<223>  Cepa 804994 del virus West Nile (GenBank: DQ256376), nucletidos 
       10509-10570

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (9)..(31)
<223>  Fragmento correspondiente al cebador directo WNRT-F (SEQ ID NO:1)

<400>  54
tccgccaccg gatgttgagt agacggtgct gcctgcgtct caaccccagg aggactgggt     60

g                                                                     61


<210>  55
<211>  69
<212>  DNA
<213>  Secuencia artificial

<220>
<223>  Cebador 5WNQRe: cebador inverso de PCR en Tiempo Real para la 
       amplificacin de fragmento de la regin 3' NC de la cepa 804994 
       del virus West Nile

<220>
<221>  source
<222>  (1)..(69)
<223>  Cepa 804994 del virus West Nile (GenBank: DQ256376), nucletidos 
       10551-10619

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (2)..(20)
<223>  Fragmento correspondiente al cebador inverso WNRT-Re (SEQ ID 
       NO:2)

<400>  55
cttccgaggc ggttctgagg gcttacatgg atcgctccgc agctttgttc acccagtcct     60

cctggggtt                                                             69


<210>  56
<211>  11029
<212>  DNA
<213>  West Nile virus


<220>
<221>  source
<222>  (1)..(11029)
<223>  Aislado Eg101 del virus West Nile, secuencia completa (nmero de 
       acceso en GenBank AF260968)

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (10530)..(10552)
<223>  Fragmento correspondiente al cebador directo WNRT-F (SEQ ID NO:1)

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (10530)..(10622)
<223>  Fragmento amplificado por el mtodo de la invencin

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (10602)..(10622)
<223>  Fragmento correspondiente al cebador inverso WNRT-Re (SEQ ID 
       NO:2)

<400>  56
agtagttcgc ctgtgtgagc tgacaaactt agtagtgttt gtgaggatta acaacaatta     60

acacggtgcg agctgtttct tagcacgaag atctcgatgt ctaagaaacc aggagggccc    120

ggcaagagcc gggctgtcaa tatgctaaaa cgcggaatgc cccgcgtgtt gtccttgatt    180

ggactgaaga gggcaatgtt gagcctgatc gacggcaagg gaccaatacg atttgtgttg    240

gctctcttgg cgttcttcag gttcacagca attgctccga cccgagcagt gctggatcga    300

tggagaggtg tgaacaaaca aacagcgatg aaacaccttc tgagttttaa gaaggaacta    360

gggaccttga ccagtgctat caatcggcgg agctcaaaac aaaagaaaag aggaggaaag    420

accggaattg cagtcatgat tggcttgatc gccagcgtgg gagcagttac cctctctaac    480

ttccaaggga aggtgatgat gactgtaaat gccactgacg tcacagacgt catcacgatt    540

ccaacagctg ctggaaagaa tctatgcatt gtcagagcaa tggacgtggg gtacatgtgt    600

gatgatacta tcacctatga atgtccagtg ctgtcggctg gtaatgatcc agaagacatc    660

gactgttggt gcacaaaatc agcagtctac gtcaggtatg gaagatgcac caagacacgc    720

cactcaagac gtagccggag gtcactgaca gtgcagacac atggagaaag cactctagcg    780

aacaagaagg gggcttggat ggacagcacc aaggctacaa ggtatttggt aaaaacagaa    840

tcatggatct tgaggaaccc cggatatgcc ctggtggcag ccgtcattgg ttggatgctt    900

ggaagcaaca ccatgcagcg agttgtgttc gttgtgctac tgctcttggt ggctccagcc    960

tacagcttta actgccttgg aatgagcaac agagacttct tagagggagt gtctggagca   1020

acatgggtgg atttggttct cgaaggcgac agctgtgtga ccatcatgtc taaggacaag   1080

cctaccatcg atgtgaagat gatgaatatg gaggccgcca acctggcaga ggtccgcagt   1140

tattgctatc tggccaccgt cagcgatctc tccaccaaag ctgcgtgccc gactatggga   1200

gaagctcaca atgacaaacg tgctgaccca gcttttgtgt gtaaacaagg agtagtggac   1260

aggggttggg gcaacggctg tggactattt ggtaaaggaa gcattgacac atgcgccaaa   1320

tttgcctgtt ctaccaaggc aacaggaaga accattctga aagagaacat caagtacgaa   1380

gtggctatct ttgtccatgg accaaccact gtggagtcgc atggaaacta ccccacacag   1440

attggggcca ctcaggcagg gagattcagc atcactcctg cggcgccttc atacacacta   1500

aaacttggag agtatggaga ggtgacggtg gactgtgaac cacgatcagg gattgacacc   1560

aatgcatact acgtgatgac tgtcggaaca aagacgttct tggtccatcg tgagtggttt   1620

atggacctca acctcccctg gagcagtgcc ggaagcactg tgtggaggaa cagagagacg   1680

ttgatggagt ttgaggaacc acacgccacg aagcagtctg tgatagcatt gggctcacaa   1740

gagggagctc tgcatcaagc tttggctgga gccattcctg tggaattttc aagcaacact   1800

gtcaagttga catcgggtca tttgaagtgt agagtgaaga tggaaaaatt gcagttgaag   1860

ggaacaacct acggcgtctg ttcaaaggct ttcaagtttc ttggaactcc cgcagacaca   1920

ggccacggca ctgtagtgtt ggaattgcag tacactggca cggatggacc ttgcaaagtt   1980

cccatctcgt cagtggcttc attgaacgac ctaacgccag tgggcaggtt ggtcactgtc   2040

aacccctttg tttcagtagc cacggccaat gccaaggtcc tgattgaatt ggaaccaccc   2100

tttggagact catacatagt ggtgggcaga ggagaacaac agattaatca ccattggcac   2160

aagtctggaa gcagcattgg caaagccttc acaaccaccc tcaaaggggc gcagagatta   2220

gccgccctag gagatacagc ttgggacttt ggatcagttg gaggggtgtt cacctcagtg   2280

gggaaggctg tccatcaagt gtttggtgga gcattccgct cactgttcgg aggcatgtct   2340

tggataacgc aaggattgct gggggctctg ctgttgtgga tgggcatcaa tgctcgtgac   2400

aggtccatag ctctcacgtt tctcgcagtt ggaggggttt tgctctttct ctccgtgaac   2460

gtgcacgctg acactggatg tgccatagac atcagccggc aggagctgag atgtggaagt   2520

ggagtgttca tacacaatga tgtggaggct tggatggacc ggtacaagta ctaccctgaa   2580

acgccacaag gcctagccaa gatcattcaa aaagcccaca aagaaggagt gtgcggtcta   2640

cggtcggttt ccagactgga gcaccaaatg tgggaagcgg tgaaggacga gctaaacact   2700

cttttgaaag agaatggtgt ggacctcagt gttgtggttg agaaacagga gggaatgtac   2760

aagtcagcac ctaaacgtct caccgctacc acggaaaaat tggaaatagg ctggaaggcc   2820

tggggaaaga gcatcctatt cgcaccagaa ttggccaaca acacttttgt ggttgatggt   2880

ccggagacca aggaatgccc aactcagaat cgcgcttgga acagcttgga agtagaggat   2940

tttggatttg gtctcaccag tacccggatg ttcctgaagg tcagagagag caacacaact   3000

gaatgtgact caaagatcat cggaacggct gtcaagaaca acttggcgat ccacagtgac   3060

ctgtcctatt ggattgaaag caggcttaat gatacgtgga agcttgaaag ggcggtcctg   3120

ggtgaagtta aatcatgcac ttggcctgaa acgcacactt tgtggggtga aggaatcctc   3180

gagagtgact tgataatacc agtcacactg gcgggaccac gaagcaacca caatcggaga   3240

cctgggtaca agacacaaaa ccagggccca tgggacgaag gccgggtaga gattgatttc   3300

gattactgcc caggaacgac ggtcaccctg agtgagagct gcggacaccg tggacctgcc   3360

actcgcacca ccacagagag cggaaagctg ataacggact ggtgctgcag gagctgcacc   3420

ttaccaccat tgcgctacca gacggacagc ggttgttggt atggtatgga gattagacca   3480

cagaggcatg atgaaaagac ccttgtgcag tcacaagtga atgcttacaa cgctgatatg   3540

attgatcctt ttcagctggg ccttctggtc gtgttcttgg ccacccagga ggtccttcgc   3600

aagaggtgga cagccaagat cagcatgcca gctatactga ttgctctgct agtcctggtg   3660

tttgggggca ttacttacac tgacgtgtta cgctatgtca tcttagtggg agcagctttc   3720

gcagaatcca attcgggagg agacgtggta cacttggcgc tcatggcgac cttcaagata   3780

caaccagtgt ttatggtggc atcgtttctc aaagcgagat ggaccaacca ggagaatatc   3840

ttgttgatgt tggcggctgt tttctttcaa atggcttacc atgacgctcg ccaaattctg   3900

ctttgggaga tccctgatgt gttgaattca ttggcagtag cttggatgat actgagagcc   3960

ataaccttta caacaacatc aaacgtggtt gttccgctgc tagctctgtt aacacccgga   4020

ctgagatgct tgaatctgga tgtgtacagg atcctgctat tgatggtcgg aataggcagc   4080

ttgatcagag agaagagaag cgcagctgca aaaaagaaag gagcaagtct gttatgcctg   4140

gctctagcct caacaggact tttcaaccct atgatcctcg ccgctggact cattgcatgt   4200

gatcccaacc gtaaacgagg atggcccgca actgaagtga tgactgctgt cggcctgatg   4260

tttgccattg tcggagggct ggcagagctt gacattgact ccatggccat tccaatgacc   4320

atcgcagggc tcatgtttgc tgccttcgtg atatctggga aatcaacaga tatgtggatc   4380

gagaggacgg cggacatctc ctgggaaagt gatgcggaaa ttacaggctc gagcgagaga   4440

gttgatgtgc ggcttgatga tgacggaaat ttccagctca tgaatgatcc aggagcacct   4500

tggaagatat ggatgctcag aatggcttgc ctcgcgatta gtgcgtacac cccttgggca   4560

atcctgccct cagtagttgg attttggata actctccaat acacaaagag aggaggtgtg   4620

ctgtgggaca ctccctcacc aaaggagtac aaaaaagggg acacgaccac tggcgtctac   4680

aggatcatga ctcgtgggct gctcggcagt tatcaagcag gagcgggcgt gatggttgaa   4740

ggggttttcc acaccctttg gcatacaaca aaaggagccg ctctgatgag cggggaaggc   4800

cgcctggacc catactgggg tagtgtcaaa gaggatcgac tttgctacgg aggaccctgg   4860

aaattgcagc acaagtggaa tgggcaggat gaggtgcaaa tgattgtggt ggaacctggc   4920

aagaacgtta aaaacgtcca gacgaaacca ggggtgttca aaacacctga aggagaaatt   4980

ggggccgtga ctctggactt ccccactgga acatcaggct caccaatagt ggacaaaaac   5040

ggtgatgtga tcgggctcta tggcaatgga gtcataatgc ccaacggctc atacataagc   5100

gcgatagtgc agggtgaaag gatggatgag ccgatcccag ccggattcga acctgagatg   5160

ctgaggaaaa aacagatcac agttctggac cttcatcccg gtgctggtaa aacaaggagg   5220

atactgccac agatcatcaa agaggccata aatagaagat tgagaacggc cgtgctagca   5280

ccaactaggg ttgtagccgc tgagatggct gaagccctga gaggactgcc catccggtat   5340

cagacatctg cagtgcccag agaacacaat ggaaatgaga ttgttgatgt catgtgccat   5400

gccactctca ctcacaggct gatgtctcct cacagggtgc cgaactacaa tcttttcgtg   5460

atggatgagg ctcattttac cgacccagct agcattgcag caaggggtta tatttccaca   5520

aaagtcgagc tgggggaggc ggcggcaata ttcatgacag ctaccccacc aggcacttca   5580

gacccattcc cagagtccaa ttcacctatt tctgacttgc agactgagat cccagatcgg   5640

gcctggaact ctgggtacga atggattaca gaatacattg ggaaaacggt ttggtttgtg   5700

cccagtgtga aaatggggaa tgagattgcc ctttgtctac aacgtgccgg caaaaaagta   5760

gtccaactga acagaaagtc gtatgagacg gagtacccaa agtgcaagaa cgatgattgg   5820

gactttgtta tcacaacaga catatctgaa atgggggcta acttcaaggc gagcagggtg   5880

attgacagca ggaagagtgt gaaaccaacc atcatcacgg aaggagaagg gagggtgatc   5940

ctgggagaac catccgctgt gacagcagct agtgcagccc aaagacgtgg acgcatcggt   6000

aggaatccat cgcaagttgg tgatgagtac tgctatgggg ggcacacgaa tgaagacgac   6060

tcgaacttcg cccattggac tgaggcacga atcatgctgg acaacatcaa catgccaaac   6120

ggactgatcg ctcaattcta ccaaccagag cgtgaaaagg tatacaccat ggatggagaa   6180

taccgactca gaggagaaga gaggaaaaac tttctggaat tattgaggac tgcagatctg   6240

ccagtttggc tggcttacaa ggtggcagcg gctggagtgt cataccacga tcggagatgg   6300

tgttttgatg gccctaggac aaacacaatt ctagaagaca acaacgaagt ggaagtcatt   6360

acgaagcttg gtgaaagaaa gattctgagg ccgcgctgga ttgacgccag ggtgtactcg   6420

gatcatcagg cattaaaggc gttcaaggac tttgcttcgg gaaagcgttc tcagataggg   6480

ctcattgagg ttctgggaaa gatgcctgag cacttcatgg ggaagacatg ggaagcactt   6540

gacaccatgt atgttgtggc caccgcagag aaagggggaa gagctcacag aatggccttg   6600

gaggaactgc cagatgctct ccagacaatt gccctgattg ccttattgag tgtgatgacc   6660

atgggagtat tcttcctcct catgcagcgg aagggcattg gaaagatagg tttgggaggc   6720

gttgtcctgg gagtcgcaac cttcttttgt tggatggctg aagttccagg aacgaagatc   6780

gccggaatgt tgctgctttc ccttctcttg atgattgtgc taatccctga gccagagaag   6840

caacgttcgc agacagacaa ccagctagcc gtgttcctga tttgtgtgtt gaccctcgtg   6900

agcgcagtgg cagccaacga aatgggttgg ctggacaaga ccaagaatga tataagcagt   6960

ttgtttgggc aaagaattga ggccaaggag aatttcagta tgggagagtt tctcctggac   7020

ttgagaccgg caacagcctg gtcactgtat gctgtgacca cagcggttct cactccactg   7080

ctaaagcatc tgatcacgtc agattacatc aacacttcat tgacctcaat caatgttcaa   7140

gcaagtgcac tattcacact cgcgcgaggc ttcccctttg tcgatgttgg agtgtcggct   7200

ctcctgctag cagccggatg ctggggacaa gtcaccctca ccgtgacggt gacagcggca   7260

acactcctgt tctgccacta cgcctacatg gttcccggat ggcaggctga ggcaatgcgc   7320

tcagcccagc ggcggacagc ggctggaatc atgaaaaacg ctgtagtgga tggcatcgtg   7380

gccacggacg tcccagaatt agagcgcacc acacccatca tgcagaagaa agttgggcaa   7440

atcatgctga tcttggtgtc tctagctgca gtagtagtga acccgtctgt gaagacagtg   7500

cgagaagccg gaattctgat cacggcagca gcggtgacac tctgggagaa tggagcaagc   7560

tctgtttgga atgcaacaac tgccatcgga ctctgccaca tcatgcgtgg gggttggttg   7620

tcatgcttat ccataacatg gacactcata aagaacatgg aaaaaccagg actaaaaaga   7680

ggtggggcaa agggacgcac cttgggagag gtttggaaag aaagactcaa ccagatgaca   7740

aaagaagagt tcactaggta ccgcaaagag gccatcatcg aagtcgatcg ctcagcagca   7800

aaacacgcca ggaaagaagg caatgtcact ggagggcatc cagtctctag aggcacagca   7860

aagctgagat ggctggtcga gcggaggttt ctcgaaccgg tcggaaaagt gattgacctt   7920

ggatgtggaa gaggcggttg gtgttactac atggcaaccc aaaaaagagt ccaagaggtc   7980

agagggtaca caaagggtgg tcccggacat gaagagcccc aactggtgca aagttatgga   8040

tggaacattg tcaccatgaa gagcggagtg gatgtgttct acagaccttc tgagtgctgc   8100

gataccctcc tttgtgacat cggagagtct tcatcaagtg ctgaggttga agagcatagg   8160

acgatccggg tccttgaaat ggttgaggac tggctgcacc gagggccaaa ggaattttgt   8220

gtgaaggtgc tctgccccta tatgccaaaa gtcatagaaa agatggagct gctccagcgc   8280

cggtatgggg ggggactggt cagaaaccca ctctcgcgga attccacgca cgagatgtat   8340

tgggtaagtc gagcttcggg caatgtggta cactcagtga acatgaccag ccaggtgctt   8400

ctgggaagaa tggagaaaag gacctggaag ggaccccaat acgaggaaga tgtgaacttg   8460

ggaagtggaa ccagggcggt gggaaaaccc ctactcaact cagacactag taaaatcaag   8520

aacaggattg aacgactcag gcgtgagtac agttcgacgt ggcaccacga tgagaaccac   8580

ccatatagaa cctggaacta tcacggcagt tatgatgtga aacctacagg ctccgccagc   8640

tcgctggtca atggagtggt taggctcctc tcaaaaccat gggacaccat cacgaacgtt   8700

accaccatgg ccatgactga cactactccc ttcggacagc agcgggtgtt taaagagaag   8760

gtggacacga aagctcctga accgccagaa ggagtgaagt atgtgctcaa tgaaaccacc   8820

aactggttgt gggcgtttct ggccagagaa aaacgtccca gaatgtgctc tcgagaggaa   8880

ttcataaaaa aggtcaatag caatgcagct ctgggtgcca tgtttgaaga gcagaaccaa   8940

tggaggagcg ccagagaagc agttgaggat ccaaaatttt gggagatggt ggatgaggag   9000

cgcgaggcac acctgcgggg ggaatgtcac acttgcatct acaacatgat ggggaagaga   9060

gagaagaaac ctggagagtt cggaaaggct aagggaagca gagccatatg gttcatgtgg   9120

ctcggagctc gctttctgga gttcgaagct ctgggctttc ttaacgaaga ccactggctt   9180

ggaagaaaga actcaggagg cggggtcgag ggcttgggcc tccaaaaact gggttatatt   9240

ctgcgtgaag ttggcacccg acctggaggc aagatctatg ctgatgacac agctggctgg   9300

gacacccgca ttacgagagc tgacctggaa aatgaagcta aggttcttga gttgctggat   9360

ggggaacatc ggcgtcttgc tagggccatc attgagctca cctatcgtca caaagttgtg   9420

aaagtgatgc gcccggctgc tgatggaaga accgtcatgg atgtcatctc cagagaagat   9480

cagaggggga gtggacaagt tgtcacctac gctctaaaca ccttcaccaa cctggccgtc   9540

cagttggtga ggatgatgga aggggaagga gtgattggcc cagatgatgt ggagaaactc   9600

acaaagggaa aaggacctaa agtcaggacc tggctgtttg agaatgggga ggaaagactc   9660

agccgcatgg ctgtcagcgg agatgactgt gtggtaaagc ccctagatga ccgcttcgcc   9720

acctctctcc acttcctcaa cgccatgtca aaggttcgca aagatatcca ggagtggaaa   9780

ccgtcaactg gatggtatga ctggcagcag gttccattct gctcgaacca tttcactgaa   9840

ttaatcatga aagatggaag aacactggtg gttccatgcc gaggacagga cgaactggta   9900

ggcagagctc gcatttctcc aggggccgga tggaacgtcc gtgacactgc ttgtctggct   9960

aagtcttatg cccagatgtg gctgcttctg tacttccaca gaagagacct gcggctaatg  10020

gccaacgcca tttgctccgc tgtccctgtg aattgggtcc ctaccggaag aaccacgtgg  10080

tccatccatg ccggagggga gtggatgaca acagaagaca tgctggaggt ctggaaccgt  10140

gtttggatag aggagaatga atggatggaa gacaaaaccc cagtggagaa atggagtgac  10200

gtcccatact caggaaaacg ggaggacatc tggtgtggca gcttgattgg cacaagaacc  10260

cgagccacgt gggcagaaaa catccaggta gccatcaacc aagtcagagc aatcattgga  10320

gatgagaagt atgtggatta catgagttca ttaaagagat atgaagacac gactttggtt  10380

gaggacacag tactgtaaat actttattaa ttgtaaatag acaatgtaag catgtgtaaa  10440

agtatagttt tatagtagca tttagtgatg ttagtgtaaa tagttaagaa aattttaagg  10500

aggaagtcag gccggaaagt ttccgccacc ggaagttgag tagacggtgc tgcctgcgac  10560

tcaaccccag gaggactggg tgaacaaagc tgcgaagtga tccatgtaag ccctcagaac  10620

cgtctcggaa ggaggacccc acatgttgta acttcaaagc ccaatgtcag accacgctac  10680

ggcgtgccac tctgcggaga gtgcagtctg cgatagtgcc ccaggaggac tgggttaaca  10740

aaggcagatc aacgccccac gcggccctag ccctggtaat ggtgttaacc agggcgaaag  10800

gactagaggt tagaggagac cccgcggttt aaagtgcacg gcccagcctg actgaagctg  10860

taggtcaggg gaaggactag aggttagtgg agaccccgtg ccacaaaaca ccacaacaaa  10920

acagcatatt gacacctggg atagactagg agatcttctg ctctgcacaa ccagccacac  10980

ggcacagtgc gccgacaatg gtggctggtg gtgcgagaac acaggatct              11029


<210>  57
<211>  571
<212>  DNA
<213>  West Nile virus


<220>
<221>  source
<222>  (1)..(571)
<223>  Aislado MP502-66 del virus West Nile, regin 3'NC

<400>  57
taagtttgtg gtgatcatgt aaatatagtt gtaaatatta taaaagaagt tagttgtaga     60

gagagtcagg ccggcctaaa tccgccaccg gacgttgagt agacggtgct gcctgcgact    120

caaccccagg aggactgggt gaacaaagct gcgaggtgat ccacgtaagc cctcagaacc    180

gtctcggaag aaggacccca cgtgttttag cctcaaggcc cagtgtcaga ccacacttag    240

tgtgccactc tgcggagagt gcagtctgcg ctagtgcccc aggtggactg ggttatcaaa    300

ggcatggcaa tgccccacgc ggccccaacc ctaatgatgg tgttaatcag ggagcaagga    360

ctagaggtta gaggagaccc cgcgttcaca agtgcacggc ccaacctagc tgaagctgta    420

agctagggga aggactagag gttagaggag accccgtgcc aaagaaacac caaagaaaac    480

agcatattga cacctgggaa agactagggg atcttctgct caacacaacc agccacacgg    540

cacagagcgc cgatgtaggt ggctggtggt g                                   571


