                         SEQUENCE LISTING

<110>  Complix NV
 
<120>  Alpha-Bodies for HIV Entry Inhibition

<130>  135623

<160>  29    

<170>  PatentIn version 3.4

<210>  1
<211>  856
<212>  PRT
<213>  Human immunodeficiency virus type 1 HXB2

<400>  1

Met Arg Val Lys Glu Lys Tyr Gln His Leu Trp Arg Trp Gly Trp Arg 
1               5                   10                  15      


Trp Gly Thr Met Leu Leu Gly Met Leu Met Ile Cys Ser Ala Thr Glu 
            20                  25                  30          


Lys Leu Trp Val Thr Val Tyr Tyr Gly Val Pro Val Trp Lys Glu Ala 
        35                  40                  45              


Thr Thr Thr Leu Phe Cys Ala Ser Asp Ala Lys Ala Tyr Asp Thr Glu 
    50                  55                  60                  


Val His Asn Val Trp Ala Thr His Ala Cys Val Pro Thr Asp Pro Asn 
65                  70                  75                  80  


Pro Gln Glu Val Val Leu Val Asn Val Thr Glu Asn Phe Asn Met Trp 
                85                  90                  95      


Lys Asn Asp Met Val Glu Gln Met His Glu Asp Ile Ile Ser Leu Trp 
            100                 105                 110         


Asp Gln Ser Leu Lys Pro Cys Val Lys Leu Thr Pro Leu Cys Val Ser 
        115                 120                 125             


Leu Lys Cys Thr Asp Leu Lys Asn Asp Thr Asn Thr Asn Ser Ser Ser 
    130                 135                 140                 


Gly Arg Met Ile Met Glu Lys Gly Glu Ile Lys Asn Cys Ser Phe Asn 
145                 150                 155                 160 


Ile Ser Thr Ser Ile Arg Gly Lys Val Gln Lys Glu Tyr Ala Phe Phe 
                165                 170                 175     


Tyr Lys Leu Asp Ile Ile Pro Ile Asp Asn Asp Thr Thr Ser Tyr Lys 
            180                 185                 190         


Leu Thr Ser Cys Asn Thr Ser Val Ile Thr Gln Ala Cys Pro Lys Val 
        195                 200                 205             


Ser Phe Glu Pro Ile Pro Ile His Tyr Cys Ala Pro Ala Gly Phe Ala 
    210                 215                 220                 


Ile Leu Lys Cys Asn Asn Lys Thr Phe Asn Gly Thr Gly Pro Cys Thr 
225                 230                 235                 240 


Asn Val Ser Thr Val Gln Cys Thr His Gly Ile Arg Pro Val Val Ser 
                245                 250                 255     


Thr Gln Leu Leu Leu Asn Gly Ser Leu Ala Glu Glu Glu Val Val Ile 
            260                 265                 270         


Arg Ser Val Asn Phe Thr Asp Asn Ala Lys Thr Ile Ile Val Gln Leu 
        275                 280                 285             


Asn Thr Ser Val Glu Ile Asn Cys Thr Arg Pro Asn Asn Asn Thr Arg 
    290                 295                 300                 


Lys Arg Ile Arg Ile Gln Arg Gly Pro Gly Arg Ala Phe Val Thr Ile 
305                 310                 315                 320 


Gly Lys Ile Gly Asn Met Arg Gln Ala His Cys Asn Ile Ser Arg Ala 
                325                 330                 335     


Lys Trp Asn Asn Thr Leu Lys Gln Ile Ala Ser Lys Leu Arg Glu Gln 
            340                 345                 350         


Phe Gly Asn Asn Lys Thr Ile Ile Phe Lys Gln Ser Ser Gly Gly Asp 
        355                 360                 365             


Pro Glu Ile Val Thr His Ser Phe Asn Cys Gly Gly Glu Phe Phe Tyr 
    370                 375                 380                 


Cys Asn Ser Thr Gln Leu Phe Asn Ser Thr Trp Phe Asn Ser Thr Trp 
385                 390                 395                 400 


Ser Thr Glu Gly Ser Asn Asn Thr Glu Gly Ser Asp Thr Ile Thr Leu 
                405                 410                 415     


Pro Cys Arg Ile Lys Gln Ile Ile Asn Met Trp Gln Lys Val Gly Lys 
            420                 425                 430         


Ala Met Tyr Ala Pro Pro Ile Ser Gly Gln Ile Arg Cys Ser Ser Asn 
        435                 440                 445             


Ile Thr Gly Leu Leu Leu Thr Arg Asp Gly Gly Asn Ser Asn Asn Glu 
    450                 455                 460                 


Ser Glu Ile Phe Arg Pro Gly Gly Gly Asp Met Arg Asp Asn Trp Arg 
465                 470                 475                 480 


Ser Glu Leu Tyr Lys Tyr Lys Val Val Lys Ile Glu Pro Leu Gly Val 
                485                 490                 495     


Ala Pro Thr Lys Ala Lys Arg Arg Val Val Gln Arg Glu Lys Arg Ala 
            500                 505                 510         


Val Gly Ile Gly Ala Leu Phe Leu Gly Phe Leu Gly Ala Ala Gly Ser 
        515                 520                 525             


Thr Met Gly Ala Ala Ser Met Thr Leu Thr Val Gln Ala Arg Gln Leu 
    530                 535                 540                 


Leu Ser Gly Ile Val Gln Gln Gln Asn Asn Leu Leu Arg Ala Ile Glu 
545                 550                 555                 560 


Ala Gln Gln His Leu Leu Gln Leu Thr Val Trp Gly Ile Lys Gln Leu 
                565                 570                 575     


Gln Ala Arg Ile Leu Ala Val Glu Arg Tyr Leu Lys Asp Gln Gln Leu 
            580                 585                 590         


Leu Gly Ile Trp Gly Cys Ser Gly Lys Leu Ile Cys Thr Thr Ala Val 
        595                 600                 605             


Pro Trp Asn Ala Ser Trp Ser Asn Lys Ser Leu Glu Gln Ile Trp Asn 
    610                 615                 620                 


His Thr Thr Trp Met Glu Trp Asp Arg Glu Ile Asn Asn Tyr Thr Ser 
625                 630                 635                 640 


Leu Ile His Ser Leu Ile Glu Glu Ser Gln Asn Gln Gln Glu Lys Asn 
                645                 650                 655     


Glu Gln Glu Leu Leu Glu Leu Asp Lys Trp Ala Ser Leu Trp Asn Trp 
            660                 665                 670         


Phe Asn Ile Thr Asn Trp Leu Trp Tyr Ile Lys Leu Phe Ile Met Ile 
        675                 680                 685             


Val Gly Gly Leu Val Gly Leu Arg Ile Val Phe Ala Val Leu Ser Ile 
    690                 695                 700                 


Val Asn Arg Val Arg Gln Gly Tyr Ser Pro Leu Ser Phe Gln Thr His 
705                 710                 715                 720 


Leu Pro Thr Pro Arg Gly Pro Asp Arg Pro Glu Gly Ile Glu Glu Glu 
                725                 730                 735     


Gly Gly Glu Arg Asp Arg Asp Arg Ser Ile Arg Leu Val Asn Gly Ser 
            740                 745                 750         


Leu Ala Leu Ile Trp Asp Asp Leu Arg Ser Leu Cys Leu Phe Ser Tyr 
        755                 760                 765             


His Arg Leu Arg Asp Leu Leu Leu Ile Val Thr Arg Ile Val Glu Leu 
    770                 775                 780                 


Leu Gly Arg Arg Gly Trp Glu Ala Leu Lys Tyr Trp Trp Asn Leu Leu 
785                 790                 795                 800 


Gln Tyr Trp Ser Gln Glu Leu Lys Asn Ser Ala Val Ser Leu Leu Asn 
                805                 810                 815     


Ala Thr Ala Ile Ala Val Ala Glu Gly Thr Asp Arg Val Ile Glu Val 
            820                 825                 830         


Val Gln Gly Ala Cys Arg Ala Ile Arg His Ile Pro Arg Arg Ile Arg 
        835                 840                 845             


Gln Gly Leu Glu Arg Ile Leu Leu 
    850                 855     


<210>  2
<211>  117
<212>  PRT
<213>  Artificial

<220>
<223>  Alpha-body scAB013

<400>  2

Met Ser Ile Glu Glu Ile Gln Lys Gln Ile Ala Ala Ile Gln Lys Gln 
1               5                   10                  15      


Ile Ala Ala Ile Gln Lys Gln Ile Tyr Arg Met Thr Gly Gly Ser Gly 
            20                  25                  30          


Gly Gly Ser Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Ser Gly Met Ser Ile Glu 
        35                  40                  45              


Glu Ile Gln Lys Gln Ile Ala Ala Ile Gln Lys Gln Ile Ala Ala Ile 
    50                  55                  60                  


Gln Lys Gln Ile Tyr Arg Met Thr Gly Gly Ser Gly Gly Gly Ser Gly 
65                  70                  75                  80  


Gly Gly Ser Gly Gly Gly Ser Gly Met Ser Ile Glu Glu Ile Gln Lys 
                85                  90                  95      


Gln Ile Ala Ala Ile Gln Lys Gln Ile Ala Ala Ile Gln Lys Gln Ile 
            100                 105                 110         


Tyr Arg Met Thr Pro 
        115         


<210>  3
<211>  97
<212>  PRT
<213>  Artificial

<220>
<223>  scAB013_N1_L5/5

<400>  3

Ala Leu Ile Ser Gly Ile Gln Gln Gln Ile Ala Asn Leu Gln Lys Ala 
1               5                   10                  15      


Ile Ala Ala Gln Gln His Leu Ile Tyr Leu Met Thr Gly Gly Ser Ser 
            20                  25                  30          


Gly Gly Met Ser Ile Glu Glu Ile Gln Lys Gln Ile Ala Ala Ile Gln 
        35                  40                  45              


Lys Gln Ile Ala Ala Ile Gln Lys Gln Ile Tyr Arg Met Thr Gly Gly 
    50                  55                  60                  


Ser Ser Gly Gly Met Ser Leu Ser Ala Ile Val Lys Gln Gln Asn Ala 
65                  70                  75                  80  


Ile Leu Lys Gln Ile Gln Ala Ile Gln Lys Gln Leu Gln Arg Met Val 
                85                  90                  95      


Ala 
    


<210>  4
<211>  97
<212>  PRT
<213>  Artificial

<220>
<223>  scAB013_N2_L5/5

<400>  4

Gln Gln Ile Ala Asn Leu Gln Lys Ala Ile Ala Ala Gln Gln His Leu 
1               5                   10                  15      


Ile Ala Leu Ile Gln Trp Gly Ile Tyr Arg Met Thr Gly Gly Ser Ser 
            20                  25                  30          


Gly Gly Met Ser Ile Glu Glu Ile Gln Lys Gln Ile Ala Ala Ile Gln 
        35                  40                  45              


Lys Gln Ile Ala Ala Ile Gln Lys Gln Ile Tyr Arg Met Thr Gly Gly 
    50                  55                  60                  


Ser Ser Gly Gly Met Ser Gln Asn Ala Ile Leu Lys Gln Ile Gln Ala 
65                  70                  75                  80  


Ile Gln Lys Gln Leu Gln Ala Ile Val Lys Gln Ile Lys Ala Met Gln 
                85                  90                  95      


Ala 
    


<210>  5
<211>  97
<212>  PRT
<213>  Artificial

<220>
<223>  scAB013_N3_L5/5

<400>  5

Ala Ala Ile Ala Ala Gln Gln His Leu Ile Ala Leu Ile Gln Trp Gly 
1               5                   10                  15      


Ile Ala Gln Leu Gln Ala Arg Ile Tyr Ala Met Thr Gly Gly Ser Ser 
            20                  25                  30          


Gly Gly Met Ser Ile Glu Glu Ile Gln Lys Gln Ile Ala Ala Ile Gln 
        35                  40                  45              


Lys Gln Ile Ala Ala Ile Gln Lys Gln Ile Tyr Arg Met Thr Gly Gly 
    50                  55                  60                  


Ser Ser Gly Gly Met Ser Ile Gln Ala Ile Gln Lys Gln Leu Gln Ala 
65                  70                  75                  80  


Ile Val Lys Gln Ile Lys Ala Ile Gln Lys Gln Ile Leu Ala Met Glu 
                85                  90                  95      


Ala 
    


<210>  6
<211>  99
<212>  PRT
<213>  Artificial

<220>
<223>  scAB013_C1_L5/5

<400>  6

Met Ser Ile Glu Glu Ile Gln Lys Gln Ile Ala Ala Ile Gln Lys Gln 
1               5                   10                  15      


Ile Ala Ala Ile Gln Lys Gln Ile Tyr Arg Met Thr Gly Gly Ser Ser 
            20                  25                  30          


Gly Gly Gly Gly Ser Ser Gly Gly Thr Trp Gln Met Trp Glu Ile Gln 
        35                  40                  45              


Ile Gln Ile Tyr Thr Ile Gln Ile Gln Ile Leu Ile Ile Gln Ala Gln 
    50                  55                  60                  


Ile Gln Gln Trp Lys Gln Met Ser Ile Glu Glu Ile Gln Lys Gln Ile 
65                  70                  75                  80  


Ala Ala Ile Gln Lys Gln Ile Ala Ala Ile Gln Lys Gln Ile Tyr Arg 
                85                  90                  95      


Met Thr Pro 
            


<210>  7
<211>  99
<212>  PRT
<213>  Artificial

<220>
<223>  scAB013_C2_L5/5

<400>  7

Met Ser Ile Glu Glu Ile Gln Lys Gln Ile Ala Ala Ile Gln Lys Gln 
1               5                   10                  15      


Ile Ala Ala Ile Gln Lys Gln Ile Tyr Arg Met Thr Gly Gly Ser Ser 
            20                  25                  30          


Gly Gly Gly Gly Ser Ser Gly Gly Ser Met Gln Met Tyr Thr Ile Gln 
        35                  40                  45              


Ile Gln Ile Leu Ile Ile Gln Ala Gln Ile Gln Gln Ile Gln Asn Gln 
    50                  55                  60                  


Ile Glu Leu Met Thr Leu Met Ser Ile Glu Glu Ile Gln Lys Gln Ile 
65                  70                  75                  80  


Ala Ala Ile Gln Lys Gln Ile Ala Ala Ile Gln Lys Gln Ile Tyr Arg 
                85                  90                  95      


Met Thr Pro 
            


<210>  8
<211>  6
<212>  PRT
<213>  Artificial

<220>
<223>  Linker sequence

<400>  8

Gly Gly Ser Ser Gly Gly 
1               5       


<210>  9
<211>  40
<212>  PRT
<213>  Human immunodeficiency virus type 1 HXB2

<400>  9

Gln Leu Leu Ser Gly Ile Val Gln Gln Gln Asn Asn Leu Leu Arg Ala 
1               5                   10                  15      


Ile Glu Ala Gln Gln His Leu Leu Gln Leu Thr Val Trp Gly Ile Lys 
            20                  25                  30          


Gln Leu Gln Ala Arg Ile Leu Ala 
        35                  40  


<210>  10
<211>  28
<212>  PRT
<213>  Artificial

<220>
<223>  Amino acid sequence of alpha-body helix

<400>  10

Met Ser Ile Glu Glu Ile Gln Lys Gln Ile Ala Ala Ile Gln Lys Gln 
1               5                   10                  15      


Ile Ala Ala Ile Gln Lys Gln Ile Tyr Arg Met Thr 
            20                  25              


<210>  11
<211>  38
<212>  PRT
<213>  Human immunodeficiency virus type 1 HXB2

<400>  11

His Thr Thr Trp Met Glu Trp Asp Arg Glu Ile Asn Asn Tyr Thr Ser 
1               5                   10                  15      


Leu Ile His Ser Leu Ile Glu Glu Ser Gln Asn Gln Gln Glu Lys Asn 
            20                  25                  30          


Glu Gln Glu Leu Leu Glu 
        35              


<210>  12
<211>  28
<212>  PRT
<213>  Artificial

<220>
<223>  Alpha-body sequence

<400>  12

Met Leu Ile Glu Gly Ile Gln Lys Gln Ile Ala Asn Ile Gln Lys Ala 
1               5                   10                  15      


Ile Ala Ala Ile Gln Lys Leu Ile Tyr Leu Met Thr 
            20                  25              


<210>  13
<211>  28
<212>  PRT
<213>  Artificial

<220>
<223>  Alpha-body sequence

<400>  13

Met Gln Ile Glu Asn Ile Gln Lys Ala Ile Ala Ala Ile Gln Lys Leu 
1               5                   10                  15      


Ile Ala Leu Ile Gln Lys Gly Ile Tyr Gln Met Thr 
            20                  25              


<210>  14
<211>  28
<212>  PRT
<213>  Artificial

<220>
<223>  Alpha-body sequence

<400>  14

Met Ala Ile Glu Ala Ile Gln Lys Leu Ile Ala Leu Ile Gln Lys Gly 
1               5                   10                  15      


Ile Ala Gln Ile Gln Lys Arg Ile Tyr Ala Met Thr 
            20                  25              


<210>  15
<211>  28
<212>  PRT
<213>  Artificial

<220>
<223>  Alpha-body sequence

<400>  15

Met Ser Ile Ser Glu Ile Val Lys Gln Ile Asn Ala Ile Leu Lys Gln 
1               5                   10                  15      


Ile Glu Ala Ile Gln Lys Gln Ile Gln Arg Met Val 
            20                  25              


<210>  16
<211>  28
<212>  PRT
<213>  Artificial

<220>
<223>  Alpha-body sequence

<400>  16

Met Ser Ile Asn Glu Ile Leu Lys Gln Ile Glu Ala Ile Gln Lys Gln 
1               5                   10                  15      


Ile Gln Ala Ile Val Lys Gln Ile Lys Arg Met Gln 
            20                  25              


<210>  17
<211>  28
<212>  PRT
<213>  Artificial

<220>
<223>  Alpha-body sequence

<400>  17

Met Ser Ile Glu Glu Ile Gln Lys Gln Ile Gln Ala Ile Val Lys Gln 
1               5                   10                  15      


Ile Lys Ala Ile Gln Lys Gln Ile Leu Arg Met Thr 
            20                  25              


<210>  18
<211>  43
<212>  PRT
<213>  Human immunodeficiency virus type 1 HBX2

<400>  18

Gln Leu Leu Ser Gly Ile Val Gln Gln Gln Asn Asn Leu Leu Arg Ala 
1               5                   10                  15      


Ile Glu Ala Gln Gln His Leu Leu Gln Leu Thr Val Trp Gly Ile Lys 
            20                  25                  30          


Gln Leu Gln Ala Arg Ile Leu Ala Val Glu Arg 
        35                  40              


<210>  19
<211>  28
<212>  PRT
<213>  Artificial

<220>
<223>  Amino acid sequence of structurally optimized alpha-body A-helix

<400>  19

Ala Leu Ile Ser Gly Ile Gln Gln Gln Ile Ala Asn Leu Gln Lys Ala 
1               5                   10                  15      


Ile Ala Ala Gln Gln His Leu Ile Tyr Leu Met Thr 
            20                  25              


<210>  20
<211>  28
<212>  PRT
<213>  Artificial

<220>
<223>  Amino acid sequence of structurally optimized alpha-body A-helix

<400>  20

Gln Gln Ile Ala Asn Leu Gln Lys Ala Ile Ala Ala Gln Gln His Leu 
1               5                   10                  15      


Ile Ala Leu Ile Gln Trp Gly Ile Tyr Arg Met Thr 
            20                  25              


<210>  21
<211>  28
<212>  PRT
<213>  Artificial

<220>
<223>  Amino acid sequence of structurally optimized alpha-body A-helix

<400>  21

Ala Ala Ile Ala Ala Gln Gln His Leu Ile Ala Leu Ile Gln Trp Gly 
1               5                   10                  15      


Ile Ala Gln Leu Gln Ala Arg Ile Tyr Ala Met Thr 
            20                  25              


<210>  22
<211>  29
<212>  PRT
<213>  Artificial

<220>
<223>  Amino acid sequence of structurally optimized alpha-body C-helix

<400>  22

Met Ser Leu Ser Ala Ile Val Lys Gln Gln Asn Ala Ile Leu Lys Gln 
1               5                   10                  15      


Ile Gln Ala Ile Gln Lys Gln Leu Gln Arg Met Val Ala 
            20                  25                  


<210>  23
<211>  29
<212>  PRT
<213>  Artificial

<220>
<223>  Amino acid sequence of structurally optimized alpha-body C-helix

<400>  23

Met Ser Gln Asn Ala Ile Leu Lys Gln Ile Gln Ala Ile Gln Lys Gln 
1               5                   10                  15      


Leu Gln Ala Ile Val Lys Gln Ile Lys Ala Met Gln Ala 
            20                  25                  


<210>  24
<211>  29
<212>  PRT
<213>  Artificial

<220>
<223>  Amino acid sequence of structurally optimized alpha-body C-helix

<400>  24

Met Ser Ile Gln Ala Ile Gln Lys Gln Leu Gln Ala Ile Val Lys Gln 
1               5                   10                  15      


Ile Lys Ala Ile Gln Lys Gln Ile Leu Ala Met Glu Ala 
            20                  25                  


<210>  25
<211>  28
<212>  PRT
<213>  Artificial

<220>
<223>  Amino acid sequence of alpha-body B-helix with grafted HR2 
       residues

<400>  25

Trp Ser Ile Trp Asp Ile Gln Ile Gln Ile Tyr Thr Ile Gln Ile Gln 
1               5                   10                  15      


Ile Leu Ile Ile Gln Ser Gln Ile Gln Gln Met Thr 
            20                  25              


<210>  26
<211>  28
<212>  PRT
<213>  Artificial

<220>
<223>  Amino acid sequence of alpha-body B-helix with grafted HR2 
       residues

<400>  26

Ile Ser Ile Tyr Thr Ile Gln Ile Gln Ile Leu Ile Ile Gln Ser Gln 
1               5                   10                  15      


Ile Gln Gln Ile Gln Asn Gln Ile Glu Leu Met Thr 
            20                  25              


<210>  27
<211>  30
<212>  PRT
<213>  Artificial

<220>
<223>  Amino acid sequence of structurally optimized alpha-body B-helix

<400>  27

Thr Trp Gln Met Trp Glu Ile Gln Ile Gln Ile Tyr Thr Ile Gln Ile 
1               5                   10                  15      


Gln Ile Leu Ile Ile Gln Ala Gln Ile Gln Gln Trp Lys Gln 
            20                  25                  30  


<210>  28
<211>  30
<212>  PRT
<213>  Artificial

<220>
<223>  Amino acid sequence of structurally optimized alpha-body B-helix

<400>  28

Ser Met Gln Met Tyr Thr Ile Gln Ile Gln Ile Leu Ile Ile Gln Ala 
1               5                   10                  15      


Gln Ile Gln Gln Ile Gln Asn Gln Ile Glu Leu Met Thr Leu 
            20                  25                  30  


<210>  29
<211>  29
<212>  PRT
<213>  Artificial

<220>
<223>  Amino acid sequence of the non-mutated alpha-body C-helix

<400>  29

Met Ser Ile Glu Glu Ile Gln Lys Gln Ile Ala Ala Ile Gln Lys Gln 
1               5                   10                  15      


Ile Ala Ala Ile Gln Lys Gln Ile Tyr Arg Met Thr Pro 
            20                  25                  


