                         SEQUENCE LISTING

<110>  Abbott Laboratories
       Hayden, Mark A
       Laffler, Thomas G
 
<120>  MOLECULAR ASSAY FOR DIAGNOSIS OF MALARIA

<130>  9273WO01

<150>  US 61/139,406
<151>  2008-12-19

<160>  22    

<170>  PatentIn version 3.5

<210>  1
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer oligonucleotide

<400>  1
cggctcatta aaacagttat                                                   20


<210>  2
<211>  19
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer oligonucleotide

<400>  2
tagctacagc ttttccgta                                                    19


<210>  3
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  primer oligonucleotide

<400>  3
cctaccgatt gaaagatatg a                                                 21


<210>  4
<211>  18
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  primer oligonucleotide

<400>  4
cggaaacctt gttacgac                                                     18


<210>  5
<211>  24
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  primer oligonucleotide

<400>  5
gttaagggag tgaagacgat caga                                              24


<210>  6
<211>  26
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  primer oligonucleotide

<400>  6
aacccaaaga ctttgatttc tcatag                                            26


<210>  7
<211>  2040
<212>  DNA
<213>  Plasmodium falciparum

<400>  7
aacctggttg atcttgccag tagtcatatg cttgtctcac agattaagcc atgcaagtga       60

aagtacatat gtaagtaata tattgaaact gcgaacggct cattaaaaca gttataatct      120

acttgatgtt tttaatataa ggataactac ggaaaatctg tagctaatac ttgtgaaaat      180

accttttgat atatacatat gtatgtatca ttaaggtatg tatttgttag atataagaat      240

aaaataaata taattgaatt ataacaaaga agaaacacat aaaatatgtg tattatcaat      300

cgagtatctg acctatcagc ttttgatgtt agggtattga cctaacatgg ctatgacggg      360

taacggggaa ttagagttcg attccggaga gggagcctga gaaatagcta ccacatctaa      420

ggaaggcagc aggcgcgtaa attacccaat tctaaaaaag agaggtagtg acaagaaata      480

acaatacaat atcgaaaaat gattttgtaa ttggaatgat aggaatttac aaggttccta      540

gagaaacaat tggagggcaa gtctggtgcc agcagccgcg gtaattccag ctccaatagc      600

atatattaaa attgttgcag ttaaaacgtt cgtagttgaa tattaaagaa tccgatgttt      660

catttaaact ggtttgggaa aaccaaatat attatatatt ttgctttgtt caaaataagg      720

ttttctaata aattatgttt ttatcagata tgacagaatc ttttttaaaa tctcttcaat      780

atgcttttat tgcttttgag aggttttgtt actttgagta aaattaagtg ttcataacag      840

acgggtagtc atgattgagt tcattgtgtt tgaatactac agcatggaat aacaaatatg      900

aataagctaa ttattttttt tttcattatt ttttttgata ttcttattag cttagttacg      960

attaatagga gtagctttgg gggcattcgt attcagatgt cagaggtgaa attctaagat     1020

tttctggaga cggactactg cgaaagcatt tgcctaatct atttccatta atcaagaacg     1080

aaagttaagg gagtgaagac gatcagatac cgtcgtaatc ttaaccataa actataccga     1140

ctaggtgttg gatgaatata aaaaatatat aaatatgtag catttcttag ggaatgttga     1200

ttttatatta gaattgcttc cttcagtacc ttatgagaaa tcaaagtctt tgggttctgg     1260

ggcgagtatt cgcgcaagcg agaaagttaa aagaattgac ggaagggcac caccaggcgt     1320

ggagcttgcg gcttaatttg actcaacacg ggaaaactca ctagtttaag acaagagtag     1380

gattgacaga ttaatagctc tttcttgatt tcttggatgg tgatgcatgg ccgtttttag     1440

ttcgtgaata tgatttgtct ggttaattcc gataacgaac gagatcttaa cctgctaatt     1500

agcggtaagt acactatatt tttatttgaa attgaatata ggtaattata catgtttatt     1560

cagtgttcaa attaggatat tttttttatt aaaatattct tttccctgtt ttactaataa     1620

tttgtttttt tttactctat ttctctcttc ttttaagaat gtacttgctt gattaaataa     1680

agcttcttag aggaacagtg tgtatctaac acaaggaagt ttaaggcaac aacaggtctg     1740

tgatgtcctt agataaacta ggctgcacgc gtgctacaat gatatatata acaagttgtt     1800

aaaaatgtac ttataaataa gtgtgtacaa tttttcctgt actgaaaagt ataggtaatc     1860

tttatcagta tatatcgtaa ttgggataga ttattgcaat tattaatctt gaacgaggaa     1920

gcccgtcgct cctaccgatt gaaagatatg ataaattgtt tggatatgaa ttaaaataat     1980

agaagtcgta acaaggtttc cgtaggtgaa cctgcggaag gatcattaat atatgaaacg     2040


<210>  8
<211>  2319
<212>  DNA
<213>  Plasmodium malariae

<400>  8
atatatatat atactgtttg tgtttaattg tagtagaaat actacgatta ttttgcaata       60

tgtgcgttat atatttattg tatttaagcc attttttata acatttaagt tatgatatta      120

ttattgattt tagtgaaatt atgttctgtt tttataatat tattatataa gtaacctggt      180

tgatcttgcc agtagtcata tgcttgtctc aaagattaag ccatgcaagt gaaagtatat      240

gcatatttta tatgtagaaa ctgcgaacgg ctcattaaaa cagttatagt ctacttgaca      300

ttttttttat aaggataact acggaaaagc tgtagctaat acttgcttta atactcttaa      360

ttcttatgtt tttttgagta tgtatttgtt aagccttata agagaaaagt atattaactt      420

aaggattata acaaagaagt aacacataat aaatttcgaa tatttagtgt gtatcaatcg      480

agtttctgac ctatcagctt ttgatgttag ggtattggcc taacatggct atgacgggta      540

acggggaatt agagttcgat tccggagagg gagcctgaga aatagctacc acatctaagg      600

aaggcagcag gcgcgtaaat tacccaattc taaagaagag aggtagtgac aagaaataac      660

aatgcaaggc caaattttgg ttttgcaatt ggaatgatgg gaatttaaaa ccttcccaga      720

aggcaattgg agggcaagtc tggtgccagc agccgcggta attccagctc caatagcgta      780

tattaaaatt gttgcagtta aaacgctcgt agttgaattt caaggaatca atattttaag      840

taatgctttg tatatttata acatagttgt acgttaagaa taaccgccaa ggcttatatt      900

ttttctgtta cattttgttt tattaatata tatatgcgtt cttattataa aaatgattct      960

ttttaaaatt cttttgtata attttttatg catgggaatt ttgttacttt gagtaaatta     1020

gagtgttcaa agcaaacagt taaaacagtt tctgtgtttg aatactacag catggaataa     1080

caaaattgaa caagtcagaa gtttgttctt ttttcttatt ttggcttagt tacgattaat     1140

aggagtagct tgggggcatt tgtattcaga tgtcagaggt gaaattctta gattttctgg     1200

agacaagcaa ctgcgaaagc atatgcctaa aatacttcca ttaatcaaga acgaaagtta     1260

agggagtgaa gacgatcaga taccgtcgta atcttaacca taaactatgc cgactaggtg     1320

ttggatgata gtgtaaaaaa taaaagagac attcttatat atgagtgttt cttttagata     1380

gcttccttca gtaccttatg agaaatcaaa gtctttgggt tctggggcga gtattcgcgc     1440

aagcgagaaa gttaaaagaa ccgacggaag gggacacagg cgtggagctt gcggcttaat     1500

ttgactcaac acggggaaac tcactagttt aagacaagag taggattgac agattaatag     1560

ctctttcttg atttcttgga tggtgatgca tggccgtttt tagttcgtga atatgatttg     1620

tctggttaat tccgataacg aacgagatct taacctgcta attagcggta atacactata     1680

ttcttaagtg aaattagaat atagataaat tgtgctaatt ttgattaaaa tattagaatg     1740

ttttttttaa taaaaacgtt cttttccctt tttttcttaa ttatgcatat ttattctttt     1800

tcttttttcg cataagaatg tatttgctta atgtaagctt cttagaggaa cgatgtgtgt     1860

ctaacacaag gaagtttaag gcaacaacag gtctgtgatg tccttagatg aactaggctg     1920

cacgcgtgct acactgatat gtataacgag tatttaaaaa tatatatctt gttatgttat     1980

acgtatttct atatgtatgc atacaaagaa tatatagttt gctcactgaa agtgtaggta     2040

atctttatca atatatatcg tgatggggat agattattgc aattattaat cttgaacgag     2100

gaatgcctag taagcatgat tcatcagatt gtgctgacta cgtccctgcc ctttgtacac     2160

accgcccgtc gctcctaccg attgaaagat atgatgaatt gtttggacaa gaaaaaaggt     2220

ttttattctt ttttctggaa aaatcgtaaa tcctatcttt taaaggaagg agaaagtcgt     2280

aacaaggttt ccgtcggtga acctgcggaa ggatcatta                            2319


<210>  9
<211>  2102
<212>  DNA
<213>  Plasmodium ovale

<400>  9
aacctggttg atcttgccag tagtcatatg cttgtctcaa agattaagcc atgcaagtga       60

aagtatatgc atattttata tgtagaaact gcgaacggct cattaaaaca gttataatct      120

acttgaaatt tctaccttac aaggataact acggaaaagc tgtagctaat acttgcttta      180

atgcgtttga atccttttgg attcccgcgt atgtacttgt taagtcttta agaaagaagt      240

ttataactta aggaattata acaaagaagt aacacataat aaggttgcct tatttagtgt      300

gtatcaatcg agtttctgac ctatcagctt ttgatgttag ggtattggcc taacatggct      360

atgacgggta acggggaatt agagttcgat tccggagagg gagcctgaga aatagctacc      420

acatctaagg aaggcagcag gcgcgtaaat tacccaattc taaagaagag aggtagtgac      480

aagaaataac aatacaaggc catttcatgg ttttgtaatt ggaatgatgg gaatttaaaa      540

ccttcccaaa attcaattgg agggcaagtc tggtgccagc agccgcggta attccagctc      600

caatagcgta tattaaaatt gttgcagtta aaacgctcgt agttgaattt caaagaatca      660

atattttaag taatactttt gctataagat gcttagacaa tacaacgtat ctgttctttg      720

cattccttat gcaaaatgtg ttcttattat aaaaaggatt ctttttaaaa tctcttttgc      780

tattttttag tattggagat tttgttactt tgagtaaatt agagtgttca aagcaaacag      840

ttaaagcatt ttattgcgtt tgaatactac agcatggaat aacaaaattg aacaagtcag      900

aattctgttc ttttttctta ttttggctta gttacgatta ataggagtag cttggaggca      960

tttgtattca gatgtcagag gtgaaattct tagattttct ggagacaaac aactgcgaaa     1020

gcatttgcct aaaatacttc cattaatcaa gaacgaaagt taagggagtg aagacgatca     1080

gataccgtcg taatcttaac cataaactat gccgactagg ttttggatga aagattttta     1140

aataagaaaa ttcctttcgg ggaaatttct tagattgctt ccttcagtac cttatgagaa     1200

atcaaagtct ttgggttctg gggcgagtat tcgcgcaagc gagaaagtta aaagaattga     1260

cggaagggca ccaccaggcg tggagcttgc gcttaatttg actcaacacg gggaaactca     1320

ctagtttaag acaagagtag gattgacaga ttaatagctc tttcttgatt tcttggatgg     1380

tgatgcatgg ccgtttttag ttcgtgaata tgatttgtct ggttaattcc gataacgaac     1440

gagatcttaa cctgctaatt agcggcgaat acgttatatt cttatgtgaa attgaatata     1500

gctgaatttt cttattttga agaatacatt aggatacaat taatgtgtcc ttttccctat     1560

tctacttaat tcgcaattca tgctgtttct cttttgcata ggaatgtatt cgtttgattg     1620

taaagcttct tagaggaacg atgtgtgtct aacacaagga agtttatggc aacaacaggt     1680

ctgtgatgtc cttagatgaa ctaggctgca cgcgtgctac actgatatgt ataacgagtt     1740

actaaaaata tacttttgtt agggtatttt atatactctt tcaaattgta tagttttcct     1800

ccactgaaaa gtgtaggtaa tctttatcag tacatatcgt gatggggata gattattgca     1860

attattaatc ttgaacgagg aatgcctagt aagcatgatt catcagattg tgctgactac     1920

gtccctgccc tttgtacaca ccgcccgtcg ctcctaccga ttgaaagata tgatgaattg     1980

tttggacaag aaaagaaaga atttatattc ttttttttct ggaaaaaccg taaatcctat     2040

cttttaaagg aaggagaagt cgtaacaagg tttccgtagg tgaacctgcg gaaggatcat     2100

ta                                                                    2102


<210>  10
<211>  2146
<212>  DNA
<213>  Plasmodium vivax

<400>  10
aacctggttg atcttgccag tagtcatatg cttgtctcaa agattaagcc atgcaagtga       60

aagtacatgc atatttttat atgcggaaac tgcgaacggc tcattaaaac agttataatc      120

tacttgacat ttttttctat aaggataact acggaaaagc tgtagctaat acttgcttta      180

atgctctcga cgaatgtctt gggcatgtac ttgttaagcc tttataagaa aaaagttaat      240

aacttaagga atgataacaa agaagtgaca catagaagga cctgcgtcca tttatagtgt      300

gtatcaatcg agtttctgac ctatcagctt ttgatgttag ggtattggcc taacattgct      360

atgacgggta acggggaatt agagttcgat tccggagagg gagcctgaga aatagctacc      420

acatctaagg aaggcagcag gcgcgtaaat tacccaattc taaagaagag aggtagtgac      480

aagaaataac aatacaagac caaaactggt tttgtaattg gaatgatggg aatttaaatc      540

cttcccataa tacaattgga gggcaagtct ggtgccagca gccgcggtaa ttccagctcc      600

aatagcgtat attaaaattg ttgcagttaa aacgctcgta gttgaatttc aaagaaccaa      660

tattttaata acgccgttag ctagatccac aaggggttga gccaatcacg gtttcggctt      720

ctgtgcgcat cctacctatc aagcgttttt ttaattaaag tgtttctttt taaaatcttc      780

tttaccttaa ccatatggaa gattttgtta ctttgagtaa attaaagtgt tcatagcaaa      840

cagatacagc attgcgcgtt ttgaatacta cagcatggaa taacaaaatt gaacaagtca      900

aaactatgtt tctttttttt atttttggct tagttacgat taataggagt agtttgggga      960

catttgtatt cagatgtcag aggtgaaatt ctaagatttt ctggagacaa acaactgcga     1020

aggcatttgt ctaaaatact tccattaatc aagaacgaaa gttaagggag tgaaaacgat     1080

cagataccgt cgtaatctta accataaact ataccgacta ggttttggat gaaagttaaa     1140

caaataagga tagtctcttc ggggatagtc cttagatttc ttccttcagt accctatgag     1200

aaatcaaagt ctttgggttc tggggcgagt attcgcgcaa gcgagaaagt taaaagaatt     1260

gacggaaggg caccaccagg cgtggagctt gcggcttaat ttgactcaac acgggaaaac     1320

tcactagttt aagacaagag taggattgac agattgagag ctctttcttg atttcttgga     1380

tggtgatgca tggccgtttt tagttcgtga atatgatttg tctggttaat tccgataacg     1440

aacgagatct taacctgcta attagcggta agtacgacat atttttatgt cggattggat     1500

ctggatgatt tgcttatatt gaggtgcaat ctaaataggg gattgcaatt atacttcgtg     1560

tcggtgtttc ttaatcgaat agctgatgcg tttggtatat tgctttcctt ttttttattt     1620

ctgcgcttct ttacttggct tatcgtaccg tttccttttt gtgtagaaat gtatttgcat     1680

tatattaaag cttcttagag gaacgatgtg tgtctaacac aaggaagttt aaggcaacaa     1740

caggtctgtg atgtccttag atgaactagg ctgcacgcgt gctacactga tatgtacaac     1800

gagttattaa aattacgatt cagcttgctg ttacgtattt ttcctccact gaaaagtgta     1860

ggtaatcttt atcagtacat atcgtgatgg ggatagatta ttgcaattat taatcttgaa     1920

cgaggaatgc ctagtaagca cgattcatta gattgtgctg actacgtccc tgccctttgt     1980

acacaccgcc cgtcgctcct accgatcgaa agatatgatg aattgtttgg acaagaagaa     2040

aggggattat atcttctttt ttctggaaaa accgtaaatc ctgtctttta aaggaaggag     2100

aagtcgtaac aaggtttccg taggtgaacc tgcggaagga tcatta                    2146


<210>  11
<211>  71
<212>  DNA
<213>  Plasmodium falciparum

<400>  11
cggctcatta aaacagttat aatctacttg atgtttttaa tataaggata actacggaaa       60

atctgtagct a                                                            71


<210>  12
<211>  72
<212>  DNA
<213>  Plasmodium falciparum

<400>  12
cctaccgatt gaaagatatg ataaattgtt tggatatgaa ttaaaataat agaagtcgta       60

acaaggtttc cg                                                           72


<210>  13
<211>  173
<212>  DNA
<213>  Plasmodium falciparum

<400>  13
gttaagggag tgaagacgat cagataccgt cgtaatctta accataaact ataccgacta       60

ggtgttggat gaatataaaa aatatataaa tatgtagcat ttcttaggga atgttgattt      120

tatattagaa ttgcttcctt cagtacctta tgagaaatca aagtctttgg gtt             173


<210>  14
<211>  71
<212>  DNA
<213>  Plasmodium malariae

<400>  14
cggctcatta aaacagttat agtctacttg acattttttt tataaggata actacggaaa       60

agctgtagct a                                                            71


<210>  15
<211>  120
<212>  DNA
<213>  Plasmodium malariae

<400>  15
cctaccgatt gaaagatatg atgaattgtt tggacaagaa aaaaggtttt tattcttttt       60

tctggaaaaa tcgtaaatcc tatcttttaa aggaaggaga aagtcgtaac aaggtttccg      120


<210>  16
<211>  165
<212>  DNA
<213>  Plasmodium malariae

<400>  16
gttaagggag tgaagacgat cagataccgt cgtaatctta accataaact atgccgacta       60

ggtgttggat gatagtgtaa aaaataaaag agacattctt atatatgagt gtttctttta      120

gatagcttcc ttcagtacct tatgagaaat caaagtcttt gggtt                      165


<210>  17
<211>  73
<212>  DNA
<213>  Plasmodium ovale

<400>  17
cggctcatta aaacagttat aatctacttg aaatttctac cttacaagga taactacgga       60

aaagctgtag cta                                                          73


<210>  18
<211>  124
<212>  DNA
<213>  Plasmodium ovale

<400>  18
cctaccgatt gaaagatatg atgaattgtt tggacaagaa aagaaagaat ttatattctt       60

ttttttctgg aaaaaccgta aatcctatct tttaaaggaa ggagaagtcg taacaaggtt      120

tccg                                                                   124


<210>  19
<211>  159
<212>  DNA
<213>  Plasmodium ovale

<400>  19
gttaagggag tgaagacgat cagataccgt cgtaatctta accataaact atgccgacta       60

ggttttggat gaaagatttt taaataagaa aattcctttc ggggaaattt cttagattgc      120

ttccttcagt accttatgag aaatcaaagt ctttgggtt                             159


<210>  20
<211>  72
<212>  DNA
<213>  Plasmodium vivax

<400>  20
cggctcatta aaacagttat aatctacttg acattttttt ctataaggat aactacggaa       60

aagctgtagc ta                                                           72


<210>  21
<211>  123
<212>  DNA
<213>  Plasmodium vivax

<400>  21
cctaccgatc gaaagatatg atgaattgtt tggacaagaa gaaaggggat tatatcttct       60

tttttctgga aaaaccgtaa atcctgtctt ttaaaggaag gagaagtcgt aacaaggttt      120

ccg                                                                    123


<210>  22
<211>  159
<212>  DNA
<213>  Plasmodium vivax

<400>  22
gttaagggag tgaaaacgat cagataccgt cgtaatctta accataaact ataccgacta       60

ggttttggat gaaagttaaa caaataagga tagtctcttc ggggatagtc cttagatttc      120

ttccttcagt accctatgag aaatcaaagt ctttgggtt                             159


