Table 8.2. List of significantly associated haplotypes based on the Endometriosis Disease results
using the Quebec Founder Population (QFP). Individual haplotypes with associated relative risks are
presented in each row of the table; these values were extracted from the associated marker
haplotype window with the most significant p value for each SNP in Table 8.1. The first column
lists the region ID as presented in Table 1. The Haplotype column lists the specific nucleotides
for the individual SNP alleles contributing to the haplotype reported. The Case and Control columns
correspond to the numbers of cases and controls, respectively, containing the haplotype variant
noted in the Haplotype column. The Total Case and Total Control columns list the total numbers of
cases and controls for which genotype data was available for the haplotype in question. The RR
column gives to the relative risk for each particular haplotype. The remainder of the columns lists
the SeqIDs for the SNPs contributing to the haplotype and their relative location with respect to
the central marker. The Central marker (0) column lists the SeqID for the central marker on which
the haplotype is based. Flanking markers are identified by minus (-) or plus (+) signs to indicate
the relative location of flanking SNPs.

Region   Haplotype   Case   Control   TotalCase   TotalControl   RR      Central Marker (-4)   Central Marker (-3)   Central Marker (-2)   Central Marker (-1)   Central Marker (0)   Central Marker (1)   Central Marker (2)   Central Marker (3)   Central Marker (4)   
110      C           97     81        504         504            1.240                                                                                           4212                 
110      T           407    423       504         504            0.800                                                                                           4212                 
110      C           227    280       504         504            0.660                                                                                           4215                 
110      T           277    224       504         504            1.530                                                                                           4215                 
110      T           131    199       504         504            0.540                                                                                           4216                 
110      C           373    305       504         504            1.860                                                                                           4216                 
110      A           145    115       504         504            1.370                                                                                           4217                 
110      G           359    389       504         504            0.730                                                                                           4217                 
111      G           164    220       504         504            0.620                                                                                           4264                 
111      A           340    284       504         504            1.610                                                                                           4264                 
111      C           148    91        504         504            1.890                                                                                           4265                 
111      T           356    413       504         504            0.530                                                                                           4265                 
111      A           217    262       504         504            0.700                                                                                           4266                 
111      C           287    242       504         504            1.430                                                                                           4266                 
111      T           193    133       504         504            1.730                                                                                           4267                 
111      C           311    371       504         504            0.580                                                                                           4267                 
111      C           192    226       504         504            0.760                                                                                           4268                 
111      T           312    278       504         504            1.320                                                                                           4268                 
111      G           188    250       504         504            0.600                                                                                           4269                 
111      A           316    254       504         504            1.650                                                                                           4269                 
111      T           293    245       504         504            1.470                                                                                           4270                 
111      C           211    259       504         504            0.680                                                                                           4270                 
111      A           130    112       504         504            1.220                                                                                           4271                 
111      G           374    392       504         504            0.820                                                                                           4271                 
111      C           374    392       504         504            0.820                                                                                           4272                 
111      T           130    112       504         504            1.220                                                                                           4272                 
112      G           44     31        502         502            1.460                                                                                           4488                 
112      A           458    471       502         502            0.690                                                                                           4488                 
112      A           85     113       502         502            0.700                                                                                           4489                 
112      C           417    389       502         502            1.430                                                                                           4489                 
112      T           365    316       502         502            1.570                                                                                           4490                 
112      C           137    186       502         502            0.640                                                                                           4490                 
112      A           186    230       502         502            0.700                                                                                           4493                 
112      C           316    272       502         502            1.440                                                                                           4493                 
112      T           214    249       502         502            0.750                                                                                           4494                 
112      G           288    253       502         502            1.320                                                                                           4494                 
112      A           339    290       502         502            1.520                                                                                           4495                 
112      G           163    212       502         502            0.660                                                                                           4495                 
112      G           262    289       502         502            0.800                                                                                           4496                 
112      A           240    213       502         502            1.240                                                                                           4496                 
112      T           356    292       502         502            1.750                                                                                           4497                 
112      C           146    210       502         502            0.570                                                                                           4497                 
112      C           139    114       502         502            1.300                                                                                           4498                 
112      T           363    388       502         502            0.770                                                                                           4498                 
112      C           409    432       502         502            0.710                                                                                           4499                 
112      T           93     70        502         502            1.400                                                                                           4499                 
113      G           169    150       502         502            1.190                                                                                           4578                 
113      A           333    352       502         502            0.840                                                                                           4578                 
113      A           385    424       502         502            0.610                                                                                           4580                 
113      G           117    78        502         502            1.650                                                                                           4580                 
113      G           329    310       502         502            1.180                                                                                           4581                 
113      A           173    192       502         502            0.850                                                                                           4581                 
113      A           385    424       502         502            0.610                                                                                           4582                 
113      C           117    78        502         502            1.650                                                                                           4582                 
113      T           230    255       502         502            0.820                                                                                           4583                 
113      G           272    247       502         502            1.220                                                                                           4583                 
113      C           220    259       502         502            0.730                                                                                           4584                 
113      T           282    243       502         502            1.370                                                                                           4584                 
113      A           125    73        502         502            1.950                                                                                           4585                 
113      G           377    429       502         502            0.510                                                                                           4585                 
113      T           429    448       502         502            0.710                                                                                           4586                 
113      C           73     54        502         502            1.410                                                                                           4586                 
113      T           412    434       502         502            0.720                                                                                           4587                 
113      C           90     68        502         502            1.390                                                                                           4587                 
113      A           59     46        502         502            1.320                                                                                           4588                 
113      C           443    456       502         502            0.760                                                                                           4588                 
114      T           165    143       504         504            1.230                                                                                           4760                 
114      C           339    361       504         504            0.810                                                                                           4760                 
114      A           325    355       504         504            0.760                                                                                           4761                 
114      G           179    149       504         504            1.310                                                                                           4761                 
114      T           127    180       504         504            0.610                                                                                           4762                 
114      C           377    324       504         504            1.650                                                                                           4762                 
114      G           201    180       504         504            1.190                                                                                           4763                 
114      A           303    324       504         504            0.840                                                                                           4763                 
114      T           390    434       504         504            0.550                                                                                           4764                 
114      G           114    70        504         504            1.810                                                                                           4764                 
114      T           209    282       504         504            0.560                                                                                           4765                 
114      C           295    222       504         504            1.790                                                                                           4765                 
114      C           295    222       504         504            1.790                                                                                           4766                 
114      T           209    282       504         504            0.560                                                                                           4766                 
114      C           134    116       504         504            1.210                                                                                           4767                 
114      T           370    388       504         504            0.830                                                                                           4767                 
114      G           71     47        504         504            1.590                                                                                           4768                 
114      T           433    457       504         504            0.630                                                                                           4768                 
114      C           161    109       504         504            1.700                                                                                           4769                 
114      T           343    395       504         504            0.590                                                                                           4769                 
114      G           88     61        504         504            1.540                                                                                           4770                 
114      A           416    443       504         504            0.650                                                                                           4770                 
114      C           284    330       504         504            0.680                                                                                           4771                 
114      T           220    174       504         504            1.470                                                                                           4771                 
114      T           70     48        504         504            1.530                                                                                           4772                 
114      C           434    456       504         504            0.650                                                                                           4772                 
114      A           70     48        504         504            1.530                                                                                           4773                 
114      G           434    456       504         504            0.650                                                                                           4773                 
114      C           281    327       504         504            0.680                                                                                           4774                 
114      T           223    177       504         504            1.470                                                                                           4774                 
114      T           316    361       504         504            0.670                                                                                           4775                 
114      C           188    143       504         504            1.500                                                                                           4775                 
114      T           266    319       504         504            0.650                                                                                           4776                 
114      C           238    185       504         504            1.540                                                                                           4776                 
114      C           407    424       504         504            0.790                                                                                           4777                 
114      T           97     80        504         504            1.260                                                                                           4777                 
114      A           267    320       504         504            0.650                                                                                           4778                 
114      G           237    184       504         504            1.540                                                                                           4778                 
114      G           66     51        504         504            1.340                                                                                           4779                 
114      A           438    453       504         504            0.750                                                                                           4779                 
114      T           157    139       504         504            1.190                                                                                           4780                 
114      C           347    365       504         504            0.840                                                                                           4780                 
108      T           291    334       504         504            0.700                                                                                           4910                 
108      C           213    170       504         504            1.440                                                                                           4910                 
108      CAG         25     14        504         504            1.830                                                                     4910                  4911                 4912                 
108      CGG         91     71        504         504            1.340                                                                     4910                  4911                 4912                 
108      TGA         291    334       504         504            0.700                                                                     4910                  4911                 4912                 
108      CAGTG       25     14        504         504            1.830                                               4910                  4911                  4912                 4913                 4914                 
108      CAAGG       79     62        504         504            1.330                                               4910                  4911                  4912                 4913                 4914                 
108      TGATG       291    334       504         504            0.700                                               4910                  4911                  4912                 4913                 4914                 
108      CGGTA       91     71        504         504            1.340                                               4910                  4911                  4912                 4913                 4914                 
108      CAATG       12     21        504         504            0.560                                               4910                  4911                  4912                 4913                 4914                 
108      AGTGG       25     14        504         504            1.830                                               4911                  4912                  4913                 4914                 4915                 
108      AATGA       12     21        504         504            0.560                                               4911                  4912                  4913                 4914                 4915                 
108      GGTAA       13     7         504         504            1.880                                               4911                  4912                  4913                 4914                 4915                 
108      AAGGA       79     61        504         504            1.350                                               4911                  4912                  4913                 4914                 4915                 
108      GATGA       259    313       504         504            0.650                                               4911                  4912                  4913                 4914                 4915                 
108      GATGG       32     21        504         504            1.560                                               4911                  4912                  4913                 4914                 4915                 
108      GGTAG       78     64        504         504            1.260                                               4911                  4912                  4913                 4914                 4915                 
108      CAATGACTC   12     21        504         504            0.560   4910                  4911                  4912                  4913                  4914                 4915                 4916                 4917                 4918                 
108      CAGTGGCTT   25     13        504         504            1.970   4910                  4911                  4912                  4913                  4914                 4915                 4916                 4917                 4918                 
108      CGGTAACTC   13     5         504         504            2.640   4910                  4911                  4912                  4913                  4914                 4915                 4916                 4917                 4918                 
108      TGATGGCTT   32     20        504         504            1.640   4910                  4911                  4912                  4913                  4914                 4915                 4916                 4917                 4918                 
108      TGATGACCT   2      21        504         504            0.090   4910                  4911                  4912                  4913                  4914                 4915                 4916                 4917                 4918                 
108      CAAGGATCT   66     53        504         504            1.280   4910                  4911                  4912                  4913                  4914                 4915                 4916                 4917                 4918                 
108      CGGTAGCTT   77     64        504         504            1.240   4910                  4911                  4912                  4913                  4914                 4915                 4916                 4917                 4918                 
108      TGATGACTC   253    283       504         504            0.790   4910                  4911                  4912                  4913                  4914                 4915                 4916                 4917                 4918                 
108      GGATC       66     53        504         504            1.280                                               4913                  4914                  4915                 4916                 4917                 
108      TAGCT       78     64        504         504            1.260                                               4913                  4914                  4915                 4916                 4917                 
108      TAACT       19     8         504         504            2.430                                               4913                  4914                  4915                 4916                 4917                 
108      TGGCT       57     34        504         504            1.760                                               4913                  4914                  4915                 4916                 4917                 
108      TGACT       267    311       504         504            0.700                                               4913                  4914                  4915                 4916                 4917                 
108      TGACC       2      21        504         504            0.090                                               4913                  4914                  4915                 4916                 4917                 
108      GATCT       68     55        504         504            1.270                                               4914                  4915                  4916                 4917                 4918                 
108      GACCT       2      21        504         504            0.090                                               4914                  4915                  4916                 4917                 4918                 
108      AGCTT       77     64        504         504            1.240                                               4914                  4915                  4916                 4917                 4918                 
108      GACTT       3      7         504         504            0.430                                               4914                  4915                  4916                 4917                 4918                 
108      GGCTT       57     34        504         504            1.760                                               4914                  4915                  4916                 4917                 4918                 
108      GACTC       277    312       504         504            0.750                                               4914                  4915                  4916                 4917                 4918                 
108      AACTC       19     7         504         504            2.780                                               4914                  4915                  4916                 4917                 4918                 
108      AGCTTCG     77     63        504         504            1.260                         4914                  4915                  4916                  4917                 4918                 4919                 4920                 
108      GACTCTT     275    309       504         504            0.760                         4914                  4915                  4916                  4917                 4918                 4919                 4920                 
108      GGCTTCG     57     35        504         504            1.710                         4914                  4915                  4916                  4917                 4918                 4919                 4920                 
108      AACTCTT     19     7         504         504            2.780                         4914                  4915                  4916                  4917                 4918                 4919                 4920                 
108      GATCTCT     67     54        504         504            1.280                         4914                  4915                  4916                  4917                 4918                 4919                 4920                 
108      GACCTTT     2      21        504         504            0.090                         4914                  4915                  4916                  4917                 4918                 4919                 4920                 
108      GACCTTTCA   2      20        504         504            0.100   4914                  4915                  4916                  4917                  4918                 4919                 4920                 4921                 4922                 
108      GATCTCTCC   28     20        504         504            1.420   4914                  4915                  4916                  4917                  4918                 4919                 4920                 4921                 4922                 
108      AACTCTTCC   15     7         504         504            2.180   4914                  4915                  4916                  4917                  4918                 4919                 4920                 4921                 4922                 
108      GGCTTCGTC   54     34        504         504            1.660   4914                  4915                  4916                  4917                  4918                 4919                 4920                 4921                 4922                 
108      AGCTTCGTC   77     55        504         504            1.470   4914                  4915                  4916                  4917                  4918                 4919                 4920                 4921                 4922                 
108      GACTCTTCA   27     45        504         504            0.580   4914                  4915                  4916                  4917                  4918                 4919                 4920                 4921                 4922                 
108      GCTTCGCCT   3      8         504         504            0.370   4915                  4916                  4917                  4918                  4919                 4920                 4921                 4922                 4923                 
108      ACTCTTCAC   27     45        504         504            0.580   4915                  4916                  4917                  4918                  4919                 4920                 4921                 4922                 4923                 
108      ACCTTTCAC   2      20        504         504            0.100   4915                  4916                  4917                  4918                  4919                 4920                 4921                 4922                 4923                 
108      GCTTCGTCC   131    88        504         504            1.660   4915                  4916                  4917                  4918                  4919                 4920                 4921                 4922                 4923                 
108      TTCGTCC     133    95        504         504            1.540                         4917                  4918                  4919                  4920                 4921                 4922                 4923                 
108      CTTTCAC     3      20        504         504            0.140                         4917                  4918                  4919                  4920                 4921                 4922                 4923                 
108      TTCGCCT     3      8         504         504            0.370                         4917                  4918                  4919                  4920                 4921                 4922                 4923                 
108      TCTTCAC     27     45        504         504            0.580                         4917                  4918                  4919                  4920                 4921                 4922                 4923                 
108      CGTCC       135    96        504         504            1.550                                               4919                  4920                  4921                 4922                 4923                 
108      TTCAC       31     65        504         504            0.440                                               4919                  4920                  4921                 4922                 4923                 
108      CGCCT       3      8         504         504            0.370                                               4919                  4920                  4921                 4922                 4923                 
108      A           71     102       504         504            0.650                                                                                           4922                 
108      C           433    402       504         504            1.550                                                                                           4922                 
115      A           48     30        504         504            1.660                                                                                           5005                 
115      G           456    474       504         504            0.600                                                                                           5005                 
115      C           263    300       504         504            0.740                                                                                           5006                 
115      T           241    204       504         504            1.350                                                                                           5006                 
115      A           364    305       504         504            1.700                                                                                           5007                 
115      G           140    199       504         504            0.590                                                                                           5007                 
115      A           335    362       504         504            0.780                                                                                           5008                 
115      G           169    142       504         504            1.290                                                                                           5008                 
116      C           334    369       504         504            0.720                                                                                           5313                 
116      T           170    135       504         504            1.390                                                                                           5313                 
116      C           391    439       504         504            0.510                                                                                           5315                 
116      T           113    65        504         504            1.950                                                                                           5315                 
116      G           422    455       504         504            0.550                                                                                           5316                 
116      A           82     49        504         504            1.800                                                                                           5316                 
116      G           385    409       504         504            0.750                                                                                           5317                 
116      A           119    95        504         504            1.330                                                                                           5317                 
116      C           454    477       504         504            0.510                                                                                           5318                 
116      A           50     27        504         504            1.950                                                                                           5318                 
116      T           85     70        504         504            1.260                                                                                           5320                 
116      C           419    434       504         504            0.800                                                                                           5320                 
116      T           137    90        504         504            1.720                                                                                           5321                 
116      C           367    414       504         504            0.580                                                                                           5321                 
117      G           239    176       504         504            1.680                                                                                           5460                 
117      T           265    328       504         504            0.590                                                                                           5460                 
117      G           87     121       504         504            0.660                                                                                           5461                 
117      T           417    383       504         504            1.510                                                                                           5461                 
117      G           208    268       504         504            0.620                                                                                           5462                 
117      A           296    236       504         504            1.620                                                                                           5462                 
118      G           457    439       504         504            1.440                                                                                           5494                 
118      A           47     65        504         504            0.690                                                                                           5494                 
118      T           162    207       504         504            0.680                                                                                           5495                 
118      C           342    297       504         504            1.470                                                                                           5495                 
118      G           115    142       504         504            0.750                                                                                           5496                 
118      A           389    362       504         504            1.330                                                                                           5496                 
118      T           81     103       504         504            0.750                                                                                           5498                 
118      C           423    401       504         504            1.340                                                                                           5498                 
118      T           143    186       504         504            0.680                                                                                           5499                 
118      C           361    318       504         504            1.480                                                                                           5499                 
118      C           79     129       504         504            0.540                                                                                           5500                 
118      T           425    375       504         504            1.850                                                                                           5500                 
118      C           338    298       504         504            1.410                                                                                           5502                 
118      T           166    206       504         504            0.710                                                                                           5502                 
119      C           93     113       504         504            0.780                                                                                           5528                 
119      T           411    391       504         504            1.280                                                                                           5528                 
119      A           172    126       504         504            1.550                                                                                           5529                 
119      G           332    378       504         504            0.640                                                                                           5529                 
119      T           200    142       504         504            1.680                                                                                           5531                 
119      C           304    362       504         504            0.600                                                                                           5531                 
119      C           72     86        504         504            0.810                                                                                           5532                 
119      T           432    418       504         504            1.230                                                                                           5532                 
119      A           147    188       504         504            0.690                                                                                           5533                 
119      C           357    316       504         504            1.440                                                                                           5533                 
120      G           285    315       504         504            0.780                                                                                           5702                 
120      A           219    189       504         504            1.280                                                                                           5702                 
120      C           275    235       504         504            1.370                                                                                           5705                 
120      T           229    269       504         504            0.730                                                                                           5705                 
120      A           451    408       504         504            2.000                                                                                           5706                 
120      G           53     96        504         504            0.500                                                                                           5706                 
120      T           452    408       504         504            2.050                                                                                           5707                 
120      C           52     96        504         504            0.490                                                                                           5707                 
120      G           359    390       504         504            0.720                                                                                           5708                 
120      A           145    114       504         504            1.380                                                                                           5708                 
120      C           187    165       504         504            1.210                                                                                           5709                 
120      T           317    339       504         504            0.830                                                                                           5709                 
121      C           212    231       504         504            0.860                                                                                           5714                 
121      A           292    273       504         504            1.170                                                                                           5714                 
121      T           293    338       504         504            0.680                                                                                           5716                 
121      C           211    166       504         504            1.470                                                                                           5716                 
121      C           217    286       504         504            0.580                                                                                           5718                 
121      T           287    218       504         504            1.740                                                                                           5718                 
122      T           213    237       504         504            0.820                                                                                           5735                 
122      C           291    267       504         504            1.210                                                                                           5735                 
122      T           54     98        504         504            0.500                                                                                           5737                 
122      C           450    406       504         504            2.010                                                                                           5737                 
122      G           414    444       504         504            0.620                                                                                           5738                 
122      A           90     60        504         504            1.610                                                                                           5738                 
122      C           468    452       504         504            1.500                                                                                           5739                 
122      T           36     52        504         504            0.670                                                                                           5739                 
123      T           305    248       504         504            1.580                                                                                           5852                 
123      C           199    256       504         504            0.630                                                                                           5852                 
123      A           455    426       504         504            1.700                                                                                           5853                 
123      G           49     78        504         504            0.590                                                                                           5853                 
123      T           352    288       504         504            1.740                                                                                           5854                 
123      C           152    216       504         504            0.580                                                                                           5854                 
123      T           468    451       504         504            1.530                                                                                           5855                 
123      C           36     53        504         504            0.650                                                                                           5855                 
123      A           401    365       504         504            1.480                                                                                           5856                 
123      G           103    139       504         504            0.670                                                                                           5856                 
124      T           345    313       502         502            1.330                                                                                           6095                 
124      C           157    189       502         502            0.750                                                                                           6095                 
124      A           224    179       502         502            1.450                                                                                           6096                 
124      G           278    323       502         502            0.690                                                                                           6096                 
124      A           122    80        502         502            1.690                                                                                           6097                 
124      G           380    422       502         502            0.590                                                                                           6097                 
124      A           213    155       502         502            1.650                                                                                           6099                 
124      C           289    347       502         502            0.610                                                                                           6099                 
124      C           267    237       502         502            1.270                                                                                           6100                 
124      T           235    265       502         502            0.790                                                                                           6100                 
124      A           329    293       502         502            1.360                                                                                           6102                 
124      G           173    209       502         502            0.740                                                                                           6102                 
109      A           429    401       504         504            1.470                                                                                           6234                 
109      G           75     103       504         504            0.680                                                                                           6234                 
109      CGGGT       34     53        504         504            0.620                                               6233                  6234                  6235                 6236                 6237                 
109      CGGTCTA     22     10        504         504            2.250                         6233                  6234                  6235                  6236                 6237                 6238                 6239                 
109      CAATTCA     26     11        504         504            2.440                         6233                  6234                  6235                  6236                 6237                 6238                 6239                 
109      CGGGTCA     17     33        504         504            0.500                         6233                  6234                  6235                  6236                 6237                 6238                 6239                 
109      AAGTTCG     9      3         504         504            3.040                         6233                  6234                  6235                  6236                 6237                 6238                 6239                 
109      AAGTTTA     121    83        504         504            1.600                         6233                  6234                  6235                  6236                 6237                 6238                 6239                 
109      AAGTTTG     62     105       504         504            0.530                         6233                  6234                  6235                  6236                 6237                 6238                 6239                 
109      CAATTCG     71     57        504         504            1.290                         6233                  6234                  6235                  6236                 6237                 6238                 6239                 
109      CGGTCTG     17     35        504         504            0.470                         6233                  6234                  6235                  6236                 6237                 6238                 6239                 
109      AGTTTGC     51     92        504         504            0.500                         6234                  6235                  6236                  6237                 6238                 6239                 6240                 
109      GGTCTAC     16     9         504         504            1.800                         6234                  6235                  6236                  6237                 6238                 6239                 6240                 
109      AATTCGC     64     43        504         504            1.560                         6234                  6235                  6236                  6237                 6238                 6239                 6240                 
109      GGGTCAC     17     30        504         504            0.550                         6234                  6235                  6236                  6237                 6238                 6239                 6240                 
109      AGTTCGT     8      2         504         504            4.050                         6234                  6235                  6236                  6237                 6238                 6239                 6240                 
109      GGTCTGC     24     39        504         504            0.600                         6234                  6235                  6236                  6237                 6238                 6239                 6240                 
109      AATTCAC     30     12        504         504            2.590                         6234                  6235                  6236                  6237                 6238                 6239                 6240                 
109      AATTCGT     4      13        504         504            0.300                         6234                  6235                  6236                  6237                 6238                 6239                 6240                 
109      GGGTCGC     5      15        504         504            0.330                         6234                  6235                  6236                  6237                 6238                 6239                 6240                 
109      AGTTTAC     121    80        504         504            1.670                         6234                  6235                  6236                  6237                 6238                 6239                 6240                 
109      AGTTTGCTC   8      24        504         504            0.320   6234                  6235                  6236                  6237                  6238                 6239                 6240                 6241                 6242                 
109      GGTCTGCTT   19     38        504         504            0.480   6234                  6235                  6236                  6237                  6238                 6239                 6240                 6241                 6242                 
109      AATTCGTTT   4      15        504         504            0.260   6234                  6235                  6236                  6237                  6238                 6239                 6240                 6241                 6242                 
109      AATTCGCTT   50     37        504         504            1.390   6234                  6235                  6236                  6237                  6238                 6239                 6240                 6241                 6242                 
109      AGTTTACGC   119    79        504         504            1.660   6234                  6235                  6236                  6237                  6238                 6239                 6240                 6241                 6242                 
109      GGGTCACGC   16     30        504         504            0.520   6234                  6235                  6236                  6237                  6238                 6239                 6240                 6241                 6242                 
109      AATTCACGC   30     10        504         504            3.130   6234                  6235                  6236                  6237                  6238                 6239                 6240                 6241                 6242                 
109      AATTCGCTC   14     6         504         504            2.370   6234                  6235                  6236                  6237                  6238                 6239                 6240                 6241                 6242                 
109      GGTCTACGC   8      3         504         504            2.690   6234                  6235                  6236                  6237                  6238                 6239                 6240                 6241                 6242                 
109      AGTTTGCTT   43     63        504         504            0.650   6234                  6235                  6236                  6237                  6238                 6239                 6240                 6241                 6242                 
109      ATTCACGCA   30     10        504         504            3.130   6235                  6236                  6237                  6238                  6239                 6240                 6241                 6242                 6243                 
109      GTTTGCTCG   7      24        504         504            0.280   6235                  6236                  6237                  6238                  6239                 6240                 6241                 6242                 6243                 
109      GGTCACGCA   16     30        504         504            0.520   6235                  6236                  6237                  6238                  6239                 6240                 6241                 6242                 6243                 
109      GTCTACGCA   11     3         504         504            3.730   6235                  6236                  6237                  6238                  6239                 6240                 6241                 6242                 6243                 
109      ATTCGTTTA   4      15        504         504            0.260   6235                  6236                  6237                  6238                  6239                 6240                 6241                 6242                 6243                 
109      GTTTACGCA   120    79        504         504            1.680   6235                  6236                  6237                  6238                  6239                 6240                 6241                 6242                 6243                 
109      ATTTACGCA   35     46        504         504            0.740   6235                  6236                  6237                  6238                  6239                 6240                 6241                 6242                 6243                 
109      GTCTGCTTA   19     37        504         504            0.490   6235                  6236                  6237                  6238                  6239                 6240                 6241                 6242                 6243                 
109      ATTCGCTCG   14     6         504         504            2.370   6235                  6236                  6237                  6238                  6239                 6240                 6241                 6242                 6243                 
109      ATTCGCTTA   50     37        504         504            1.390   6235                  6236                  6237                  6238                  6239                 6240                 6241                 6242                 6243                 
109      GTTTGCTTA   43     63        504         504            0.650   6235                  6236                  6237                  6238                  6239                 6240                 6241                 6242                 6243                 
109      ACG         236    191       504         504            1.440                                                                     6239                  6240                 6241                 
109      GCT         196    244       504         504            0.680                                                                     6239                  6240                 6241                 
109      G           237    196       504         504            1.390                                                                                           6241                 
109      T           267    308       504         504            0.720                                                                                           6241                 
109      T           204    237       504         504            0.770                                                                                           6242                 
109      C           300    267       504         504            1.310                                                                                           6242                 
125      C           318    271       504         504            1.470                                                                                           6254                 
125      T           186    233       504         504            0.680                                                                                           6254                 
125      C           186    233       504         504            0.680                                                                                           6255                 
125      A           318    271       504         504            1.470                                                                                           6255                 
125      T           17     48        504         504            0.330                                                                                           6256                 
125      C           487    456       504         504            3.020                                                                                           6256                 
